47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2256 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2256  hypothetical protein  100 
 
 		 434 aa  829    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000511116  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21910  predicted acetyltransferase  41.74 
 
 		 397 aa  255  9e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0891512  normal  0.2522 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2201  hypothetical protein  34.59 
 
 		 421 aa  171  3e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1552  GCN5-related N-acetyltransferase  34.83 
 
 		 413 aa  159  1e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.664271  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7318  acetyltransferase  34.08 
 
 		 409 aa  158  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3568  GCN5-related N-acetyltransferase  35.32 
 
 		 402 aa  155  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00407937  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5348  GCN5-related N-acetyltransferase  33.51 
 
 		 412 aa  153  5.9999999999999996e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.46132  normal  0.204889 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8857  hypothetical protein  31.92 
 
 		 419 aa  146  7.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3185  acetyltransferase  31.42 
 
 		 420 aa  143  7e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0548677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2102  acetyltransferase  35.2 
 
 		 424 aa  142  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.598658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24490  predicted acetyltransferase  32.52 
 
 		 439 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.328849 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1858  hypothetical protein  33.17 
 
 		 422 aa  140  3e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0346316  normal  0.689821 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1803  hypothetical protein  33.07 
 
 		 438 aa  138  2e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000000141215 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3887  hypothetical protein  33.09 
 
 		 409 aa  134  3e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.305747 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1149  hypothetical protein  35.46 
 
 		 400 aa  133  6.999999999999999e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.686629  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2391  acetyltransferase  31.33 
 
 		 404 aa  132  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.925288  hitchhiker  0.00956926 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1253  acetyltransferase  29.84 
 
 		 414 aa  130  3e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1863  hypothetical protein  32.58 
 
 		 421 aa  129  9.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.165564  normal  0.279872 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0866  hypothetical protein  37.26 
 
 		 401 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.201505  normal  0.503906 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6041  hypothetical protein  34.22 
 
 		 379 aa  128  3e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3512  hypothetical protein  33.33 
 
 		 409 aa  124  4e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.79902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2972  hypothetical protein  32.87 
 
 		 425 aa  121  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.225391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2064  hypothetical protein  30.37 
 
 		 429 aa  121  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.037054  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12444  hypothetical protein  33.33 
 
 		 402 aa  116  8.999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.439735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2701  hypothetical protein  32.6 
 
 		 399 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2745  hypothetical protein  32.6 
 
 		 399 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.834944 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2731  hypothetical protein  32.6 
 
 		 399 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.229221 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1107  hypothetical protein  29.46 
 
 		 416 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.80545  normal  0.383897 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1779  hypothetical protein  28.29 
 
 		 411 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0834  hypothetical protein  30.62 
 
 		 383 aa  102  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.175031  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2218  acetyltransferase  33.51 
 
 		 429 aa  102  1e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0949  acetyltransferase  30.08 
 
 		 441 aa  101  2e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1376  GCN5-related protein N-acetyltransferase  32.27 
 
 		 414 aa  101  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.005111 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2776  hypothetical protein  29.38 
 
 		 412 aa  95.1  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05980  predicted acetyltransferase  27.45 
 
 		 432 aa  87.8  4e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.307493 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2333  hypothetical protein  28.5 
 
 		 420 aa  87  5e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.774321  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2624  GCN5-related protein N-acetyltransferase  41.1 
 
 		 432 aa  79  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.407198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0216  GCN5-related N-acetyltransferase  29.19 
 
 		 392 aa  71.6  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11130  predicted acetyltransferase  30.16 
 
 		 457 aa  70.9  0.00000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.328272  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2672  acetyltransferase  20.06 
 
 		 385 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.69016  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2471  GCN5-related N-acetyltransferase  25.06 
 
 		 401 aa  59.3  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2866  GCN5-related N-acetyltransferase  25.87 
 
 		 390 aa  55.5  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6114  acetyltransferase  25.66 
 
 		 385 aa  54.3  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728211  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0434  hypothetical protein  26.84 
 
 		 395 aa  49.3  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.611412  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0587  acetyltransferase  18.28 
 
 		 433 aa  48.9  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1146  GCN5-related N-acetyltransferase  28.81 
 
 		 400 aa  47.4  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2112  hypothetical protein  25 
 
 		 415 aa  43.9  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.607011  normal  0.41072 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>