62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2972 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_2972  hypothetical protein  100 
 
 
425 aa  814    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.225391  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2064  hypothetical protein  40.27 
 
 
429 aa  194  2e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.037054  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3568  GCN5-related N-acetyltransferase  37.84 
 
 
402 aa  174  3.9999999999999995e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00407937  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1779  hypothetical protein  36.48 
 
 
411 aa  171  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1552  GCN5-related N-acetyltransferase  38.07 
 
 
413 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.664271  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1803  hypothetical protein  38.36 
 
 
438 aa  164  3e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000000141215 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21910  predicted acetyltransferase  34.78 
 
 
397 aa  152  1e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0891512  normal  0.2522 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1253  acetyltransferase  35.06 
 
 
414 aa  152  2e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2745  hypothetical protein  36.11 
 
 
399 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.834944 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2731  hypothetical protein  36.11 
 
 
399 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.229221 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2701  hypothetical protein  36.11 
 
 
399 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6041  hypothetical protein  37.25 
 
 
379 aa  147  5e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48783  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3185  acetyltransferase  35.54 
 
 
420 aa  143  5e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0548677  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05980  predicted acetyltransferase  35.32 
 
 
432 aa  142  9.999999999999999e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.307493 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1858  hypothetical protein  35.05 
 
 
422 aa  140  3e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0346316  normal  0.689821 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12444  hypothetical protein  34.88 
 
 
402 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.439735  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2201  hypothetical protein  34.47 
 
 
421 aa  132  7.999999999999999e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2776  hypothetical protein  38.85 
 
 
412 aa  132  1.0000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7318  acetyltransferase  33.82 
 
 
409 aa  130  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5348  GCN5-related N-acetyltransferase  33.92 
 
 
412 aa  130  6e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.46132  normal  0.204889 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2102  acetyltransferase  34.32 
 
 
424 aa  129  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.598658  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8857  hypothetical protein  33.66 
 
 
419 aa  128  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0866  hypothetical protein  33.61 
 
 
401 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.201505  normal  0.503906 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3512  hypothetical protein  35.71 
 
 
409 aa  127  3e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.79902  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1863  hypothetical protein  34.39 
 
 
421 aa  121  3e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.165564  normal  0.279872 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3887  hypothetical protein  35.91 
 
 
409 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.305747 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1376  GCN5-related protein N-acetyltransferase  36.72 
 
 
414 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.005111 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0834  hypothetical protein  33.25 
 
 
383 aa  116  8.999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.175031  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24490  predicted acetyltransferase  33.15 
 
 
439 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.328849 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2256  hypothetical protein  32.33 
 
 
434 aa  114  4.0000000000000004e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000511116  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2391  acetyltransferase  31.91 
 
 
404 aa  107  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.925288  hitchhiker  0.00956926 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0949  acetyltransferase  29.28 
 
 
441 aa  106  6e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2624  GCN5-related protein N-acetyltransferase  32.25 
 
 
432 aa  101  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.407198  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11130  predicted acetyltransferase  33.06 
 
 
457 aa  97.1  5e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.328272  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1107  hypothetical protein  32.87 
 
 
416 aa  94.4  4e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.80545  normal  0.383897 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1149  hypothetical protein  33.02 
 
 
400 aa  83.2  0.000000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.686629  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2218  acetyltransferase  32.47 
 
 
429 aa  82.4  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02810  Acetyltransferase  22.98 
 
 
402 aa  73.9  0.000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.619157  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0434  hypothetical protein  29.79 
 
 
395 aa  73.9  0.000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.611412  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2333  hypothetical protein  28.77 
 
 
420 aa  70.1  0.00000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.774321  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2866  GCN5-related N-acetyltransferase  29.47 
 
 
390 aa  66.2  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0216  GCN5-related N-acetyltransferase  29.46 
 
 
392 aa  65.1  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0931  GCN5-related N-acetyltransferase  21.3 
 
 
403 aa  63.5  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0522  hypothetical protein  20.94 
 
 
387 aa  63.2  0.000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1535  acetyltransferase  27.27 
 
 
413 aa  53.9  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2471  GCN5-related N-acetyltransferase  29.21 
 
 
401 aa  53.1  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2672  acetyltransferase  20.05 
 
 
385 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.69016  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17480  predicted acetyltransferase  28.67 
 
 
424 aa  52.8  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.342381  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2364  GCN5-related N-acetyltransferase  28.77 
 
 
394 aa  52.4  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.212134 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1743  GCN5-related N-acetyltransferase  20.11 
 
 
413 aa  50.4  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2993  acetyltransferase  17.61 
 
 
385 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0576195  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0452  Eis, predicted acetyltransferase-like acetyltransferase  18.32 
 
 
426 aa  47.8  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0190133  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2999  GNAT family acetyltransferase  19.94 
 
 
310 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000158264  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2693  acetyltransferase  18.58 
 
 
390 aa  46.6  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2112  hypothetical protein  27.78 
 
 
415 aa  45.8  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.607011  normal  0.41072 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2952  acetyltransferase, GNAT family  20 
 
 
385 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.86247e-27 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2952  acetyltransferase  20 
 
 
385 aa  45.8  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6114  acetyltransferase  27.97 
 
 
385 aa  45.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728211  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2285  acetyltransferase, GNAT family  20.32 
 
 
386 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000496858 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2743  acetyltransferase  20 
 
 
390 aa  45.8  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.891678  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3575  GCN5-related N-acetyltransferase  28.23 
 
 
393 aa  44.7  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0414984 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1780  GCN5-related N-acetyltransferase  27.82 
 
 
294 aa  43.5  0.007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0146577  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>