75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1149 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_1149  hypothetical protein  100 
 
 
400 aa  791    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.686629  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1552  GCN5-related N-acetyltransferase  45.55 
 
 
413 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.664271  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7318  acetyltransferase  41.65 
 
 
409 aa  248  1e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8857  hypothetical protein  41.37 
 
 
419 aa  235  9e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5348  GCN5-related N-acetyltransferase  39.4 
 
 
412 aa  230  4e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.46132  normal  0.204889 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1107  hypothetical protein  39.63 
 
 
416 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.80545  normal  0.383897 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3887  hypothetical protein  38.2 
 
 
409 aa  215  9.999999999999999e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.305747 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3512  hypothetical protein  41.24 
 
 
409 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.79902  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2201  hypothetical protein  36.61 
 
 
421 aa  209  7e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1858  hypothetical protein  39.29 
 
 
422 aa  206  8e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0346316  normal  0.689821 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24490  predicted acetyltransferase  41.24 
 
 
439 aa  204  2e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.328849 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1863  hypothetical protein  37.86 
 
 
421 aa  201  3e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.165564  normal  0.279872 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2391  acetyltransferase  35.12 
 
 
404 aa  183  4.0000000000000006e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.925288  hitchhiker  0.00956926 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2102  acetyltransferase  36.17 
 
 
424 aa  180  2.9999999999999997e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.598658  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1376  GCN5-related protein N-acetyltransferase  40.86 
 
 
414 aa  179  1e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.005111 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2624  GCN5-related protein N-acetyltransferase  39.02 
 
 
432 aa  175  9.999999999999999e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.407198  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3185  acetyltransferase  35.37 
 
 
420 aa  174  2.9999999999999996e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0548677  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6041  hypothetical protein  39.6 
 
 
379 aa  171  2e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48783  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2218  acetyltransferase  42.98 
 
 
429 aa  167  4e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2701  hypothetical protein  39.5 
 
 
399 aa  166  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2745  hypothetical protein  39.5 
 
 
399 aa  166  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.834944 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2731  hypothetical protein  39.5 
 
 
399 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.229221 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3568  GCN5-related N-acetyltransferase  36.86 
 
 
402 aa  158  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00407937  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1253  acetyltransferase  36.36 
 
 
414 aa  157  3e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0866  hypothetical protein  36.56 
 
 
401 aa  151  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.201505  normal  0.503906 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12444  hypothetical protein  35.08 
 
 
402 aa  144  4e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.439735  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21910  predicted acetyltransferase  37.33 
 
 
397 aa  142  9.999999999999999e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0891512  normal  0.2522 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2256  hypothetical protein  35.37 
 
 
434 aa  135  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000511116  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0949  acetyltransferase  31.11 
 
 
441 aa  122  8e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2333  hypothetical protein  33.72 
 
 
420 aa  116  6e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.774321  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0834  hypothetical protein  33.75 
 
 
383 aa  114  3e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.175031  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2064  hypothetical protein  32.54 
 
 
429 aa  110  5e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.037054  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1779  hypothetical protein  30.87 
 
 
411 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2776  hypothetical protein  28.64 
 
 
412 aa  105  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1803  hypothetical protein  33.63 
 
 
438 aa  100  6e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000000141215 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0216  GCN5-related N-acetyltransferase  32.08 
 
 
392 aa  85.5  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05980  predicted acetyltransferase  31.91 
 
 
432 aa  82  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.307493 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2672  acetyltransferase  22.01 
 
 
385 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.69016  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2952  acetyltransferase, GNAT family  22.81 
 
 
385 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.86247e-27 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2972  hypothetical protein  31.13 
 
 
425 aa  76.3  0.0000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.225391  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2364  GCN5-related N-acetyltransferase  29.65 
 
 
394 aa  75.5  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.212134 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11130  predicted acetyltransferase  34.43 
 
 
457 aa  74.3  0.000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.328272  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2285  acetyltransferase, GNAT family  22.78 
 
 
386 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000496858 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2993  acetyltransferase  21.49 
 
 
385 aa  72.8  0.000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0576195  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0587  acetyltransferase  21.16 
 
 
433 aa  72.4  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2693  acetyltransferase  21.54 
 
 
390 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2743  acetyltransferase  22.02 
 
 
390 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.891678  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2952  acetyltransferase  22.02 
 
 
385 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5250  GCN5-related N-acetyltransferase  23.98 
 
 
392 aa  70.1  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.527352 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2955  acetyltransferase, GNAT family  22.75 
 
 
385 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0931  GCN5-related N-acetyltransferase  20.18 
 
 
403 aa  67  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2441  GCN5-related N-acetyltransferase  21.85 
 
 
392 aa  66.2  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3669  GCN5-related N-acetyltransferase  22.19 
 
 
392 aa  64.7  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0452  Eis, predicted acetyltransferase-like acetyltransferase  22.97 
 
 
426 aa  63.5  0.000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0190133  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2866  GCN5-related N-acetyltransferase  28.82 
 
 
390 aa  63.2  0.000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02810  Acetyltransferase  20.53 
 
 
402 aa  63.2  0.000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.619157  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2745  GCN5-related N-acetyltransferase  20.63 
 
 
387 aa  62.8  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2999  GNAT family acetyltransferase  23.27 
 
 
310 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000158264  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6114  acetyltransferase  27.46 
 
 
385 aa  61.6  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728211  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2112  hypothetical protein  25.48 
 
 
415 aa  58.9  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.607011  normal  0.41072 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0434  hypothetical protein  29.41 
 
 
395 aa  58.5  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.611412  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3575  GCN5-related N-acetyltransferase  26.77 
 
 
393 aa  58.2  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0414984 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4958  GCN5-related N-acetyltransferase  28.77 
 
 
393 aa  56.6  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.55151  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4977  GCN5-related N-acetyltransferase  23.67 
 
 
395 aa  56.6  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0611  GCN5-related N-acetyltransferase  27.16 
 
 
378 aa  56.2  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3530  hypothetical protein  27.99 
 
 
416 aa  55.8  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1743  GCN5-related N-acetyltransferase  21.34 
 
 
413 aa  54.3  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1535  acetyltransferase  27.3 
 
 
413 aa  53.1  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2342  GCN5-related N-acetyltransferase  25.37 
 
 
403 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.482641 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2471  GCN5-related N-acetyltransferase  25.41 
 
 
401 aa  45.1  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0858  GCN5-related N-acetyltransferase  23.92 
 
 
390 aa  44.3  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0179  acetyltransferase  23.79 
 
 
350 aa  44.3  0.004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.171066  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11640  predicted acetyltransferase  27.87 
 
 
378 aa  43.9  0.006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.310129  normal  0.265932 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07040  hypothetical protein  26.67 
 
 
398 aa  43.1  0.008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17480  predicted acetyltransferase  29.17 
 
 
424 aa  43.1  0.008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.342381  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>