49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2776 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_2776  hypothetical protein  100 
 
 
412 aa  825    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1779  hypothetical protein  33.08 
 
 
411 aa  159  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3568  GCN5-related N-acetyltransferase  33.73 
 
 
402 aa  152  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00407937  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3185  acetyltransferase  34.27 
 
 
420 aa  148  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0548677  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2064  hypothetical protein  32.97 
 
 
429 aa  143  6e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.037054  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1858  hypothetical protein  34.15 
 
 
422 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0346316  normal  0.689821 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7318  acetyltransferase  31.33 
 
 
409 aa  131  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1552  GCN5-related N-acetyltransferase  31.83 
 
 
413 aa  123  5e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.664271  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2201  hypothetical protein  31.74 
 
 
421 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2972  hypothetical protein  37.32 
 
 
425 aa  119  7e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.225391  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8857  hypothetical protein  31.49 
 
 
419 aa  119  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24490  predicted acetyltransferase  29.86 
 
 
439 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.328849 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2731  hypothetical protein  34.85 
 
 
399 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.229221 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2745  hypothetical protein  34.35 
 
 
399 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.834944 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2701  hypothetical protein  34.35 
 
 
399 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2102  acetyltransferase  31.42 
 
 
424 aa  117  5e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.598658  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5348  GCN5-related N-acetyltransferase  32.55 
 
 
412 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.46132  normal  0.204889 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0866  hypothetical protein  31.63 
 
 
401 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.201505  normal  0.503906 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1803  hypothetical protein  30.77 
 
 
438 aa  111  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000000141215 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3512  hypothetical protein  30.21 
 
 
409 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.79902  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3887  hypothetical protein  30.12 
 
 
409 aa  108  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.305747 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6041  hypothetical protein  30.14 
 
 
379 aa  107  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48783  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21910  predicted acetyltransferase  33.12 
 
 
397 aa  102  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0891512  normal  0.2522 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1376  GCN5-related protein N-acetyltransferase  30.19 
 
 
414 aa  101  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.005111 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1107  hypothetical protein  30.32 
 
 
416 aa  101  3e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.80545  normal  0.383897 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1149  hypothetical protein  28.64 
 
 
400 aa  92.4  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.686629  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1863  hypothetical protein  28.92 
 
 
421 aa  92  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.165564  normal  0.279872 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2391  acetyltransferase  26.8 
 
 
404 aa  89.4  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.925288  hitchhiker  0.00956926 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2256  hypothetical protein  30.82 
 
 
434 aa  89.4  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000511116  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2624  GCN5-related protein N-acetyltransferase  28.28 
 
 
432 aa  88.2  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.407198  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12444  hypothetical protein  28.45 
 
 
402 aa  87.4  4e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.439735  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1253  acetyltransferase  27.54 
 
 
414 aa  84.7  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0834  hypothetical protein  28.4 
 
 
383 aa  84  0.000000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.175031  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11130  predicted acetyltransferase  31.97 
 
 
457 aa  83.6  0.000000000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.328272  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05980  predicted acetyltransferase  30 
 
 
432 aa  80.1  0.00000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.307493 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2218  acetyltransferase  27.37 
 
 
429 aa  80.1  0.00000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2333  hypothetical protein  27.71 
 
 
420 aa  79.3  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.774321  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0949  acetyltransferase  27.47 
 
 
441 aa  68.9  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0216  GCN5-related N-acetyltransferase  26.74 
 
 
392 aa  65.5  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2441  GCN5-related N-acetyltransferase  20.96 
 
 
392 aa  63.2  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3669  GCN5-related N-acetyltransferase  20.96 
 
 
392 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5250  GCN5-related N-acetyltransferase  21.56 
 
 
392 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.527352 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4977  GCN5-related N-acetyltransferase  22.06 
 
 
395 aa  55.5  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1535  acetyltransferase  26.89 
 
 
413 aa  53.9  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2112  hypothetical protein  36.67 
 
 
415 aa  49.7  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.607011  normal  0.41072 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2866  GCN5-related N-acetyltransferase  27 
 
 
390 aa  45.8  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3530  hypothetical protein  25.81 
 
 
416 aa  44.7  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2955  acetyltransferase, GNAT family  18.43 
 
 
385 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3575  GCN5-related N-acetyltransferase  28.19 
 
 
393 aa  44.3  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0414984 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>