56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_05980 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_05980  predicted acetyltransferase  100 
 
 
432 aa  845    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.307493 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2064  hypothetical protein  34.69 
 
 
429 aa  194  2e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.037054  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1803  hypothetical protein  35.75 
 
 
438 aa  183  5.0000000000000004e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000000141215 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2731  hypothetical protein  36.66 
 
 
399 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.229221 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1779  hypothetical protein  32.23 
 
 
411 aa  134  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2701  hypothetical protein  36.36 
 
 
399 aa  132  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2745  hypothetical protein  36.36 
 
 
399 aa  132  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.834944 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2972  hypothetical protein  35.38 
 
 
425 aa  129  9.000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.225391  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1552  GCN5-related N-acetyltransferase  33.16 
 
 
413 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.664271  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3568  GCN5-related N-acetyltransferase  33.52 
 
 
402 aa  121  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00407937  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12444  hypothetical protein  32 
 
 
402 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.439735  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1253  acetyltransferase  29.18 
 
 
414 aa  114  5e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6041  hypothetical protein  33.43 
 
 
379 aa  113  6e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48783  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0834  hypothetical protein  36.61 
 
 
383 aa  110  5e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.175031  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3512  hypothetical protein  31.72 
 
 
409 aa  108  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.79902  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11130  predicted acetyltransferase  33.04 
 
 
457 aa  108  3e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.328272  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3887  hypothetical protein  33.98 
 
 
409 aa  106  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.305747 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5348  GCN5-related N-acetyltransferase  30.64 
 
 
412 aa  105  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.46132  normal  0.204889 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2102  acetyltransferase  29.33 
 
 
424 aa  105  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.598658  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3185  acetyltransferase  31.36 
 
 
420 aa  103  6e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0548677  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21910  predicted acetyltransferase  31.02 
 
 
397 aa  102  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0891512  normal  0.2522 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0866  hypothetical protein  32.17 
 
 
401 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.201505  normal  0.503906 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2391  acetyltransferase  28.92 
 
 
404 aa  99.8  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.925288  hitchhiker  0.00956926 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1863  hypothetical protein  30.77 
 
 
421 aa  90.9  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.165564  normal  0.279872 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24490  predicted acetyltransferase  32.02 
 
 
439 aa  88.2  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.328849 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2201  hypothetical protein  30.8 
 
 
421 aa  87.8  3e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2776  hypothetical protein  30 
 
 
412 aa  82.4  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1376  GCN5-related protein N-acetyltransferase  31.83 
 
 
414 aa  82.8  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.005111 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1858  hypothetical protein  27.49 
 
 
422 aa  77.8  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0346316  normal  0.689821 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7318  acetyltransferase  28.42 
 
 
409 aa  78.2  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1149  hypothetical protein  31.82 
 
 
400 aa  77.8  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.686629  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2256  hypothetical protein  27.14 
 
 
434 aa  75.1  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000511116  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1107  hypothetical protein  29.58 
 
 
416 aa  70.5  0.00000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.80545  normal  0.383897 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2624  GCN5-related protein N-acetyltransferase  31.83 
 
 
432 aa  69.7  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.407198  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2218  acetyltransferase  29.74 
 
 
429 aa  68.6  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8857  hypothetical protein  30.62 
 
 
419 aa  63.5  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0949  acetyltransferase  26.17 
 
 
441 aa  61.6  0.00000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2333  hypothetical protein  28.73 
 
 
420 aa  60.1  0.00000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.774321  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2112  hypothetical protein  26.21 
 
 
415 aa  58.2  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.607011  normal  0.41072 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2441  GCN5-related N-acetyltransferase  21.75 
 
 
392 aa  55.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3530  hypothetical protein  34.32 
 
 
416 aa  55.5  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1535  acetyltransferase  34.22 
 
 
413 aa  55.8  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6114  acetyltransferase  27.14 
 
 
385 aa  53.5  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728211  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02810  Acetyltransferase  19.1 
 
 
402 aa  48.5  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.619157  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3669  GCN5-related N-acetyltransferase  20.35 
 
 
392 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0434  hypothetical protein  25.14 
 
 
395 aa  48.5  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.611412  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2955  acetyltransferase, GNAT family  18.58 
 
 
385 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2993  acetyltransferase  18.58 
 
 
385 aa  47  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0576195  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2952  acetyltransferase  18.92 
 
 
385 aa  46.2  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2693  acetyltransferase  18.03 
 
 
390 aa  46.2  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2743  acetyltransferase  18.92 
 
 
390 aa  46.2  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.891678  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4977  GCN5-related N-acetyltransferase  24.38 
 
 
395 aa  45.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2285  acetyltransferase, GNAT family  18.03 
 
 
386 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000496858 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1079  GCN5-related N-acetyltransferase  34.21 
 
 
229 aa  45.1  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.964069  normal  0.263711 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2952  acetyltransferase, GNAT family  18.92 
 
 
385 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.86247e-27 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2672  acetyltransferase  17.91 
 
 
385 aa  43.1  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.69016  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>