47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0834 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_0834  hypothetical protein  100 
 
 
383 aa  754    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.175031  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1253  acetyltransferase  40.69 
 
 
414 aa  252  9.000000000000001e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2701  hypothetical protein  43.16 
 
 
399 aa  236  6e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2745  hypothetical protein  43.16 
 
 
399 aa  236  6e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.834944 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2731  hypothetical protein  41.81 
 
 
399 aa  234  3e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.229221 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6041  hypothetical protein  41.49 
 
 
379 aa  233  5e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48783  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12444  hypothetical protein  39.95 
 
 
402 aa  227  2e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.439735  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0866  hypothetical protein  39.65 
 
 
401 aa  214  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.201505  normal  0.503906 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3568  GCN5-related N-acetyltransferase  35.68 
 
 
402 aa  171  3e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00407937  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2064  hypothetical protein  35.49 
 
 
429 aa  148  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.037054  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1803  hypothetical protein  35.13 
 
 
438 aa  134  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000000141215 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5348  GCN5-related N-acetyltransferase  33.75 
 
 
412 aa  134  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.46132  normal  0.204889 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3185  acetyltransferase  34.66 
 
 
420 aa  132  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0548677  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1858  hypothetical protein  33.25 
 
 
422 aa  130  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0346316  normal  0.689821 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21910  predicted acetyltransferase  34.38 
 
 
397 aa  130  4.0000000000000003e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0891512  normal  0.2522 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1552  GCN5-related N-acetyltransferase  32.3 
 
 
413 aa  126  7e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.664271  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24490  predicted acetyltransferase  33.05 
 
 
439 aa  126  7e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.328849 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7318  acetyltransferase  30.23 
 
 
409 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3512  hypothetical protein  33.52 
 
 
409 aa  125  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.79902  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8857  hypothetical protein  32.87 
 
 
419 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2102  acetyltransferase  32.53 
 
 
424 aa  124  4e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.598658  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1376  GCN5-related protein N-acetyltransferase  35.93 
 
 
414 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.005111 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3887  hypothetical protein  33.7 
 
 
409 aa  117  3e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.305747 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2201  hypothetical protein  32.47 
 
 
421 aa  116  5e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1149  hypothetical protein  32.51 
 
 
400 aa  113  5e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.686629  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05980  predicted acetyltransferase  36.33 
 
 
432 aa  113  5e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.307493 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1779  hypothetical protein  32.17 
 
 
411 aa  110  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2972  hypothetical protein  33.25 
 
 
425 aa  111  3e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.225391  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1863  hypothetical protein  32.2 
 
 
421 aa  110  5e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.165564  normal  0.279872 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1107  hypothetical protein  31.17 
 
 
416 aa  109  1e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.80545  normal  0.383897 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2624  GCN5-related protein N-acetyltransferase  32.17 
 
 
432 aa  106  7e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.407198  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0949  acetyltransferase  29.3 
 
 
441 aa  102  2e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2256  hypothetical protein  30.12 
 
 
434 aa  100  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000511116  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2391  acetyltransferase  30.49 
 
 
404 aa  100  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.925288  hitchhiker  0.00956926 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2218  acetyltransferase  31.89 
 
 
429 aa  95.9  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2333  hypothetical protein  34.22 
 
 
420 aa  95.5  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.774321  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2776  hypothetical protein  28.4 
 
 
412 aa  92.8  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11130  predicted acetyltransferase  32.15 
 
 
457 aa  75.9  0.000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.328272  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1535  acetyltransferase  27.03 
 
 
413 aa  67.8  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0434  hypothetical protein  27.62 
 
 
395 aa  53.9  0.000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.611412  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3669  GCN5-related N-acetyltransferase  21.24 
 
 
392 aa  49.7  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2364  GCN5-related N-acetyltransferase  26.22 
 
 
394 aa  48.5  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.212134 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2441  GCN5-related N-acetyltransferase  21.6 
 
 
392 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2471  GCN5-related N-acetyltransferase  23.67 
 
 
401 aa  44.7  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2112  hypothetical protein  26.33 
 
 
415 aa  43.9  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.607011  normal  0.41072 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11640  predicted acetyltransferase  31.75 
 
 
378 aa  43.5  0.006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.310129  normal  0.265932 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0452  Eis, predicted acetyltransferase-like acetyltransferase  18.75 
 
 
426 aa  43.1  0.008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0190133  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>