24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_07040 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_07040  hypothetical protein  100 
 
 
398 aa  802    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7318  acetyltransferase  26.62 
 
 
409 aa  69.3  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3185  acetyltransferase  30.25 
 
 
420 aa  67.8  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0548677  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24490  predicted acetyltransferase  33.96 
 
 
439 aa  64.3  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.328849 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1858  hypothetical protein  34.95 
 
 
422 aa  63.5  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0346316  normal  0.689821 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2102  acetyltransferase  31.98 
 
 
424 aa  60.8  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.598658  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2391  acetyltransferase  35.14 
 
 
404 aa  58.2  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.925288  hitchhiker  0.00956926 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5348  GCN5-related N-acetyltransferase  30 
 
 
412 aa  54.7  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.46132  normal  0.204889 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1552  GCN5-related N-acetyltransferase  26.1 
 
 
413 aa  54.7  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.664271  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8857  hypothetical protein  25.13 
 
 
419 aa  53.9  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2201  hypothetical protein  30.77 
 
 
421 aa  51.6  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2064  hypothetical protein  24.86 
 
 
429 aa  50.1  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.037054  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1863  hypothetical protein  30.48 
 
 
421 aa  50.1  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.165564  normal  0.279872 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2333  hypothetical protein  29.59 
 
 
420 aa  50.1  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.774321  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2701  hypothetical protein  28.44 
 
 
399 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3887  hypothetical protein  29.69 
 
 
409 aa  48.9  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.305747 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3512  hypothetical protein  29.92 
 
 
409 aa  48.9  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.79902  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2731  hypothetical protein  28.44 
 
 
399 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.229221 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2745  hypothetical protein  28.44 
 
 
399 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.834944 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3568  GCN5-related N-acetyltransferase  34 
 
 
402 aa  47  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00407937  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0949  acetyltransferase  28.45 
 
 
441 aa  46.6  0.0007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1803  hypothetical protein  27.22 
 
 
438 aa  44.7  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000000141215 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1253  acetyltransferase  29.05 
 
 
414 aa  43.1  0.009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6041  hypothetical protein  28.93 
 
 
379 aa  43.1  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48783  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>