26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2818 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_2818  thiazolinyl imide reductase  100 
 
 
375 aa  755    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3769  hypothetical protein  52.32 
 
 
375 aa  378  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.151955  normal  0.953662 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2672  thiazolinyl imide reductase  39.29 
 
 
354 aa  308  9e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0046074  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1759  thiazolinyl imide reductase  46.52 
 
 
377 aa  303  3.0000000000000004e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  hitchhiker  0.00889428 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1032  thiazolinyl imide reductase  47.61 
 
 
378 aa  294  2e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00459922  normal  0.0434723 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0754  thiazolinyl imide reductase  40.75 
 
 
375 aa  268  1e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0686  thiazolinyl imide reductase family protein  40.75 
 
 
375 aa  268  1e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3034  thiazolinyl imide reductase  38.42 
 
 
375 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.799621 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1805  putative siderophore-like synthase protein  36.46 
 
 
387 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.146971  normal  0.0672231 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2434  thiazolinyl imide reductase  38.15 
 
 
378 aa  201  9.999999999999999e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2599  yersiniabactin synthetase, thiazolinyl reductase component  35.95 
 
 
360 aa  187  3e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302341  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09290  pyochelin biosynthetic protein PchG  38.51 
 
 
349 aa  182  6e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00751852  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0876  pyochelin biosynthetic protein PchG  38.62 
 
 
349 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.145757  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1826  pyochelin biosynthetic protein  33.7 
 
 
351 aa  177  3e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.405535  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1765  oxidoreductase domain protein  25.07 
 
 
723 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2152  pyochelin biosynthetic protein  35 
 
 
351 aa  168  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.230198  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0879  pyochelin biosynthetic protein  34.72 
 
 
351 aa  166  9e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.900541  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0789  pyochelin biosynthetic protein  34.72 
 
 
351 aa  166  9e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4996  thiazolinyl imide reductase  34.19 
 
 
350 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0531281  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3371  thiazolinyl imide reductase  34.19 
 
 
350 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0773991  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2096  yersiniabactin synthetase, YbtU component  32.22 
 
 
366 aa  146  6e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5291  thiazolinyl imide reductase  34.3 
 
 
350 aa  146  6e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.516222 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0674  thiazolinyl imide reductase  32.76 
 
 
350 aa  146  6e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.125784  normal  0.499924 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0085  myo-inositol 2-dehydrogenase  24.79 
 
 
335 aa  45.8  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4060  oxidoreductase domain-containing protein  31.63 
 
 
370 aa  43.9  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2352  oxidoreductase-like  28.68 
 
 
310 aa  43.5  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>