26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_0686 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010465  YPK_0754  thiazolinyl imide reductase  100 
 
 
375 aa  774    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0686  thiazolinyl imide reductase family protein  100 
 
 
375 aa  774    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3769  hypothetical protein  39.14 
 
 
375 aa  267  2.9999999999999995e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.151955  normal  0.953662 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2672  thiazolinyl imide reductase  38.11 
 
 
354 aa  265  1e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0046074  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2818  thiazolinyl imide reductase  40.75 
 
 
375 aa  252  6e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1759  thiazolinyl imide reductase  37.75 
 
 
377 aa  235  8e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  hitchhiker  0.00889428 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3034  thiazolinyl imide reductase  40.73 
 
 
375 aa  235  8e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.799621 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1805  putative siderophore-like synthase protein  39.5 
 
 
387 aa  234  3e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.146971  normal  0.0672231 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1032  thiazolinyl imide reductase  37.36 
 
 
378 aa  208  1e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00459922  normal  0.0434723 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2434  thiazolinyl imide reductase  36.3 
 
 
378 aa  175  9.999999999999999e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2599  yersiniabactin synthetase, thiazolinyl reductase component  37.16 
 
 
360 aa  171  2e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302341  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2096  yersiniabactin synthetase, YbtU component  32.22 
 
 
366 aa  160  2e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0876  pyochelin biosynthetic protein PchG  32.56 
 
 
349 aa  155  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.145757  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09290  pyochelin biosynthetic protein PchG  31.18 
 
 
349 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00751852  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1826  pyochelin biosynthetic protein  30.66 
 
 
351 aa  152  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.405535  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0879  pyochelin biosynthetic protein  29.39 
 
 
351 aa  144  3e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.900541  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0789  pyochelin biosynthetic protein  29.39 
 
 
351 aa  144  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2152  pyochelin biosynthetic protein  29.39 
 
 
351 aa  144  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.230198  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1765  oxidoreductase domain protein  27.33 
 
 
723 aa  138  2e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0674  thiazolinyl imide reductase  28.41 
 
 
350 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.125784  normal  0.499924 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4996  thiazolinyl imide reductase  28.74 
 
 
350 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0531281  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3371  thiazolinyl imide reductase  28.74 
 
 
350 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0773991  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5291  thiazolinyl imide reductase  28.33 
 
 
350 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.516222 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0993  oxidoreductase domain protein  24.64 
 
 
344 aa  45.4  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2352  oxidoreductase-like  30.11 
 
 
310 aa  45.4  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0723  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  23.91 
 
 
345 aa  44.3  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>