26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3769 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_3769  hypothetical protein  100 
 
 
375 aa  750    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.151955  normal  0.953662 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2818  thiazolinyl imide reductase  52.62 
 
 
375 aa  369  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1759  thiazolinyl imide reductase  53.39 
 
 
377 aa  352  5e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  hitchhiker  0.00889428 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1032  thiazolinyl imide reductase  49.07 
 
 
378 aa  303  3.0000000000000004e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00459922  normal  0.0434723 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2672  thiazolinyl imide reductase  37.85 
 
 
354 aa  280  3e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0046074  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0754  thiazolinyl imide reductase  39.14 
 
 
375 aa  267  2.9999999999999995e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0686  thiazolinyl imide reductase family protein  39.14 
 
 
375 aa  267  2.9999999999999995e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3034  thiazolinyl imide reductase  36.29 
 
 
375 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.799621 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1805  putative siderophore-like synthase protein  38.75 
 
 
387 aa  191  1e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.146971  normal  0.0672231 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09290  pyochelin biosynthetic protein PchG  38.68 
 
 
349 aa  184  3e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00751852  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0876  pyochelin biosynthetic protein PchG  38.22 
 
 
349 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.145757  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2152  pyochelin biosynthetic protein  37.36 
 
 
351 aa  172  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.230198  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1826  pyochelin biosynthetic protein  35.99 
 
 
351 aa  171  1e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.405535  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0879  pyochelin biosynthetic protein  37.09 
 
 
351 aa  169  8e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.900541  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0789  pyochelin biosynthetic protein  37.09 
 
 
351 aa  169  8e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4996  thiazolinyl imide reductase  35.43 
 
 
350 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0531281  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3371  thiazolinyl imide reductase  35.43 
 
 
350 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0773991  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5291  thiazolinyl imide reductase  35.19 
 
 
350 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.516222 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2599  yersiniabactin synthetase, thiazolinyl reductase component  32.61 
 
 
360 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302341  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0674  thiazolinyl imide reductase  34.11 
 
 
350 aa  149  7e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.125784  normal  0.499924 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2434  thiazolinyl imide reductase  33.07 
 
 
378 aa  149  1.0000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1765  oxidoreductase domain protein  23.66 
 
 
723 aa  140  3e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2096  yersiniabactin synthetase, YbtU component  31.34 
 
 
366 aa  122  9.999999999999999e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2352  oxidoreductase-like  27.96 
 
 
310 aa  48.1  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1853  oxidoreductase domain-containing protein  30 
 
 
331 aa  44.7  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00149941  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2263  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.63 
 
 
310 aa  43.5  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>