26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1805 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1805  putative siderophore-like synthase protein  100 
 
 		 387 aa  776    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.146971  normal  0.0672231 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3034  thiazolinyl imide reductase  55 
 
 		 375 aa  352  5e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.799621 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0754  thiazolinyl imide reductase  38.68 
 
 		 375 aa  237  2e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0686  thiazolinyl imide reductase family protein  38.68 
 
 		 375 aa  237  2e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2434  thiazolinyl imide reductase  44.91 
 
 		 378 aa  207  3e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2818  thiazolinyl imide reductase  36.61 
 
 		 375 aa  204  2e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3769  hypothetical protein  36.66 
 
 		 375 aa  196  8.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.151955  normal  0.953662 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2599  yersiniabactin synthetase, thiazolinyl reductase component  41.35 
 
 		 360 aa  190  4e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302341  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2096  yersiniabactin synthetase, YbtU component  41.03 
 
 		 366 aa  184  2.0000000000000003e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1759  thiazolinyl imide reductase  35.75 
 
 		 377 aa  181  2e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  hitchhiker  0.00889428 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2672  thiazolinyl imide reductase  35.98 
 
 		 354 aa  178  2e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0046074  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1032  thiazolinyl imide reductase  36.34 
 
 		 378 aa  178  2e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00459922  normal  0.0434723 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1826  pyochelin biosynthetic protein  36.82 
 
 		 351 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.405535  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2152  pyochelin biosynthetic protein  38.4 
 
 		 351 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.230198  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0879  pyochelin biosynthetic protein  38.02 
 
 		 351 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.900541  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0789  pyochelin biosynthetic protein  38.02 
 
 		 351 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09290  pyochelin biosynthetic protein PchG  34.85 
 
 		 349 aa  139  7e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00751852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0876  pyochelin biosynthetic protein PchG  35.61 
 
 		 349 aa  138  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.145757  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1765  oxidoreductase domain protein  26.04 
 
 		 723 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0674  thiazolinyl imide reductase  34.09 
 
 		 350 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.125784  normal  0.499924 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4996  thiazolinyl imide reductase  34.98 
 
 		 350 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0531281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3371  thiazolinyl imide reductase  34.98 
 
 		 350 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0773991  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5291  thiazolinyl imide reductase  34.6 
 
 		 350 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.516222 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2352  oxidoreductase-like  27.61 
 
 		 310 aa  49.3  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0993  oxidoreductase domain protein  24.83 
 
 		 344 aa  43.5  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0723  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  23.29 
 
 		 345 aa  42.7  0.009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>