29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2599 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2599  yersiniabactin synthetase, thiazolinyl reductase component  100 
 
 		 360 aa  726    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302341  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2434  thiazolinyl imide reductase  53.76 
 
 		 378 aa  347  2e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2096  yersiniabactin synthetase, YbtU component  49.56 
 
 		 366 aa  290  2e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3034  thiazolinyl imide reductase  41.7 
 
 		 375 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.799621 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1805  putative siderophore-like synthase protein  41.35 
 
 		 387 aa  189  5e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.146971  normal  0.0672231 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2818  thiazolinyl imide reductase  35.77 
 
 		 375 aa  178  1e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0754  thiazolinyl imide reductase  37.16 
 
 		 375 aa  171  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0686  thiazolinyl imide reductase family protein  37.16 
 
 		 375 aa  171  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2672  thiazolinyl imide reductase  31.49 
 
 		 354 aa  170  3e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0046074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3769  hypothetical protein  32.8 
 
 		 375 aa  155  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.151955  normal  0.953662 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1759  thiazolinyl imide reductase  29.83 
 
 		 377 aa  126  5e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  hitchhiker  0.00889428 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1032  thiazolinyl imide reductase  39.93 
 
 		 378 aa  125  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00459922  normal  0.0434723 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1765  oxidoreductase domain protein  26.82 
 
 		 723 aa  124  3e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2152  pyochelin biosynthetic protein  32.94 
 
 		 351 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.230198  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1826  pyochelin biosynthetic protein  34.34 
 
 		 351 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.405535  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0879  pyochelin biosynthetic protein  32.65 
 
 		 351 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.900541  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0789  pyochelin biosynthetic protein  32.65 
 
 		 351 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09290  pyochelin biosynthetic protein PchG  32.31 
 
 		 349 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00751852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0876  pyochelin biosynthetic protein PchG  32.3 
 
 		 349 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.145757  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3371  thiazolinyl imide reductase  33.2 
 
 		 350 aa  103  6e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0773991  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4996  thiazolinyl imide reductase  33.2 
 
 		 350 aa  103  6e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0531281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5291  thiazolinyl imide reductase  33.2 
 
 		 350 aa  100  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.516222 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0674  thiazolinyl imide reductase  28.78 
 
 		 350 aa  97.4  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.125784  normal  0.499924 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0993  oxidoreductase domain protein  24.46 
 
 		 344 aa  50.1  0.00006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2352  oxidoreductase-like  29.46 
 
 		 310 aa  49.3  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0723  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  22.05 
 
 		 345 aa  47  0.0006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1150  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  24.87 
 
 		 352 aa  47  0.0006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.651822 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1214  oxidoreductase domain protein  22.47 
 
 		 344 aa  45.4  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1110  oxidoreductase domain-containing protein  22.73 
 
 		 353 aa  43.9  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>