27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A2096 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A2096  yersiniabactin synthetase, YbtU component  100 
 
 
366 aa  750    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2434  thiazolinyl imide reductase  53.35 
 
 
378 aa  325  6e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2599  yersiniabactin synthetase, thiazolinyl reductase component  49.85 
 
 
360 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302341  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3034  thiazolinyl imide reductase  45.91 
 
 
375 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.799621 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1805  putative siderophore-like synthase protein  44.52 
 
 
387 aa  204  2e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.146971  normal  0.0672231 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0754  thiazolinyl imide reductase  32.22 
 
 
375 aa  173  3.9999999999999995e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0686  thiazolinyl imide reductase family protein  32.22 
 
 
375 aa  173  3.9999999999999995e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2672  thiazolinyl imide reductase  29.43 
 
 
354 aa  167  2e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0046074  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2818  thiazolinyl imide reductase  33.15 
 
 
375 aa  157  3e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1759  thiazolinyl imide reductase  33.43 
 
 
377 aa  139  6e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  hitchhiker  0.00889428 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1032  thiazolinyl imide reductase  32.6 
 
 
378 aa  138  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00459922  normal  0.0434723 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3769  hypothetical protein  31.62 
 
 
375 aa  135  8e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.151955  normal  0.953662 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1765  oxidoreductase domain protein  26.77 
 
 
723 aa  107  3e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1826  pyochelin biosynthetic protein  31.15 
 
 
351 aa  100  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.405535  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2152  pyochelin biosynthetic protein  31.56 
 
 
351 aa  90.5  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.230198  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09290  pyochelin biosynthetic protein PchG  29.55 
 
 
349 aa  90.1  6e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00751852  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0876  pyochelin biosynthetic protein PchG  29.07 
 
 
349 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.145757  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0879  pyochelin biosynthetic protein  31.15 
 
 
351 aa  87.4  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.900541  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0789  pyochelin biosynthetic protein  31.15 
 
 
351 aa  87.4  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0674  thiazolinyl imide reductase  33.57 
 
 
350 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.125784  normal  0.499924 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4996  thiazolinyl imide reductase  27.98 
 
 
350 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0531281  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3371  thiazolinyl imide reductase  27.98 
 
 
350 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0773991  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5291  thiazolinyl imide reductase  27.38 
 
 
350 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.516222 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2352  oxidoreductase-like  29.27 
 
 
310 aa  48.9  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0993  oxidoreductase domain protein  23.33 
 
 
344 aa  45.8  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0826  oxidoreductase domain protein  22.86 
 
 
315 aa  45.1  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1110  oxidoreductase domain-containing protein  22 
 
 
353 aa  42.7  0.009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>