More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0673 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_0673  amino acid adenylation domain-containing protein  100 
 
 
1063 aa  2129    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.372789  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1367  amino acid adenylation domain protein  33.99 
 
 
6403 aa  427  1e-118  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1613  non-ribosomal peptide synthase  30.64 
 
 
3498 aa  429  1e-118  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0181375 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2265  amino acid adenylation  31.28 
 
 
3002 aa  404  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.580207  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1792  amino acid adenylation  32.06 
 
 
3021 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.277992 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4519  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  29.16 
 
 
3432 aa  384  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1611  amino acid adenylation  29.45 
 
 
3308 aa  385  1e-105  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0144172 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  30.98 
 
 
6889 aa  380  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05859  peptide synthetase protein  30.97 
 
 
5953 aa  374  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2463  bacitracin synthetase 1  29.75 
 
 
4960 aa  374  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2873  bacitracin synthetase 1  29.79 
 
 
4960 aa  374  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2384  amino acid adenylation domain protein  27.3 
 
 
2508 aa  368  1e-100  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5190  amino acid adenylation domain protein  27.6 
 
 
7168 aa  369  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  unclonable  0.00000112945 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1970  amino acid adenylation domain-containing protein  31.99 
 
 
1137 aa  363  1e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0949143 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3095  amino acid adenylation domain protein  27.14 
 
 
1556 aa  359  1.9999999999999998e-97  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0982  amino acid adenylation domain protein  27.06 
 
 
2006 aa  358  1.9999999999999998e-97  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6813  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase  31.65 
 
 
4383 aa  358  3.9999999999999996e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2616  amino acid adenylation  30.17 
 
 
13537 aa  358  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5617  amino acid adenylation domain-containing protein  28.83 
 
 
4968 aa  357  5e-97  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3686  amino acid adenylation domain protein  28.65 
 
 
2395 aa  357  6.999999999999999e-97  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3740  amino acid adenylation domain protein  28.65 
 
 
2395 aa  357  7.999999999999999e-97  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.209532 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3683  amino acid adenylation domain protein  28.65 
 
 
2664 aa  356  1e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2577  amino acid adenylation  29.93 
 
 
5926 aa  355  2e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4699  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  31.15 
 
 
4531 aa  355  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4099  non-ribosomal peptide synthase  28.6 
 
 
2033 aa  355  2.9999999999999997e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.908444 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6812  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  31.18 
 
 
2370 aa  355  2.9999999999999997e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3026  amino acid adenylation domain protein  26.87 
 
 
1556 aa  354  5e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3973  amino acid adenylation domain-containing protein  29.21 
 
 
6661 aa  353  1e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  30.72 
 
 
6676 aa  352  3e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2830  non-ribosomal peptide synthetase SyfB  29.92 
 
 
5929 aa  351  4e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0546  amino acid adenylation domain-containing protein  27.99 
 
 
2151 aa  351  5e-95  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5870  amino acid adenylation domain protein  26.41 
 
 
2164 aa  350  8e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4417  amino acid adenylation domain-containing protein  31.8 
 
 
1104 aa  350  9e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.543215 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1835  amino acid adenylation domain protein  29.31 
 
 
2571 aa  349  2e-94  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3602  cyclic nucleotide-binding protein  31.65 
 
 
8211 aa  349  2e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1861  amino acid adenylation domain protein  29.31 
 
 
2571 aa  348  3e-94  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0980  amino acid adenylation domain protein  27.28 
 
 
2193 aa  348  4e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0363  amino acid adenylation domain-containing protein  31.73 
 
 
2125 aa  347  7e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.831612 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2420  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  30.19 
 
 
1839 aa  347  7e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.452144  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3737  amino acid adenylation domain protein  28.68 
 
 
3824 aa  347  8.999999999999999e-94  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0118377 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2208  nonribosomal peptide synthetase DhbF  28.21 
 
 
2385 aa  346  1e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1968  amino acid adenylation domain-containing protein  30.71 
 
 
3639 aa  346  1e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00734125 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1846  peptide synthase  28.82 
 
 
4502 aa  346  1e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2372  nonribosomal peptide synthetase DhbF  28.21 
 
 
2385 aa  346  1e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2390  nonribosomal peptide synthetase DhbF  28.61 
 
 
2385 aa  345  2e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4891  amino acid adenylation domain-containing protein  31.67 
 
 
1104 aa  345  2e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0706407  normal  0.0725779 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2131  nonribosomal peptide synthetase  28.48 
 
 
2385 aa  344  5e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33650  pyoverdine synthetase D  31.08 
 
 
2448 aa  344  5e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.769726  normal  0.0679691 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3027  amino acid adenylation domain protein  26.14 
 
 
3086 aa  343  8e-93  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1676  amino acid adenylation domain-containing protein  30.78 
 
 
3432 aa  343  8e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.602072 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4109  amino acid adenylation  26.16 
 
 
1786 aa  343  8e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.208816  normal  0.227369 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3094  amino acid adenylation domain protein  26.14 
 
 
3086 aa  343  1e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.54199 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25580  peptide synthase  30.41 
 
 
4747 aa  342  2e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6814  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  31.1 
 
 
8646 aa  341  2.9999999999999998e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2147  nonribosomal peptide synthetase  28.29 
 
 
2385 aa  342  2.9999999999999998e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.633458  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2874  non-ribosomal peptide synthase  27.37 
 
 
2156 aa  342  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0024  linear gramicidin synthetase subunit D  29.21 
 
 
3374 aa  342  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2337  nonribosomal peptide synthetase DhbF  29.08 
 
 
2385 aa  341  5e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1000  amino acid adenylation domain-containing protein  29.89 
 
 
2477 aa  339  9.999999999999999e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4084  amino acid adenylation domain-containing protein  29.56 
 
 
1114 aa  338  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.85613  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2988  nonribosomal peptide synthetase DhbF  28.3 
 
 
2385 aa  338  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2961  amino acid adenylation domain-containing protein  31.62 
 
 
2201 aa  338  2.9999999999999997e-91  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.956293  hitchhiker  0.00505571 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3746  amino acid adenylation domain protein  29.06 
 
 
1776 aa  338  3.9999999999999995e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1748  amino acid adenylation domain protein  29.55 
 
 
7712 aa  337  5.999999999999999e-91  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.970061 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1882  amino acid adenylation domain-containing protein  31.33 
 
 
5596 aa  337  7.999999999999999e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2402  nonribosomal peptide synthetase DhbF  28.26 
 
 
2385 aa  337  9e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.777196  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1935  amino acid adenylation domain-containing protein  27.62 
 
 
3291 aa  337  9e-91  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2213  amino acid adenylation  30.74 
 
 
4882 aa  335  2e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2472  nonribosomal peptide synthetase DhbF  28.39 
 
 
2385 aa  335  2e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2149  pyoverdine sidechain peptide synthetase III, L-Thr-L-Ser component  28.98 
 
 
2151 aa  335  3e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1959  amino acid adenylation  29.39 
 
 
2154 aa  335  3e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.992857 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33630  PvdJ  28.99 
 
 
2189 aa  335  3e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.795242  normal  0.135203 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4376  linear gramicidin synthetase subunit D  24.93 
 
 
2054 aa  335  4e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.459682  hitchhiker  5.79111e-19 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5872  amino acid adenylation domain protein  28.51 
 
 
1550 aa  334  4e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00539466 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18410  non-ribosomal peptide synthase/amino acid adenylation enzyme  31.05 
 
 
7310 aa  334  5e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1858  amino acid adenylation domain-containing protein  28.29 
 
 
1528 aa  333  1e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5618  amino acid adenylation domain-containing protein  27.68 
 
 
2156 aa  333  1e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3542  amino acid adenylation domain-containing protein  32.63 
 
 
2845 aa  332  3e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2179  amino acid adenylation domain-containing protein  28.39 
 
 
2386 aa  332  3e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2869  amino acid adenylation domain-containing protein  30.51 
 
 
5328 aa  332  3e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.127211 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5075  amino acid adenylation domain protein  31.37 
 
 
1769 aa  331  6e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944137  normal  0.714561 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2462  linear gramicidin synthetase subunit D  27.52 
 
 
2156 aa  330  7e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  25.47 
 
 
1833 aa  330  1.0000000000000001e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25570  peptide synthase  29.98 
 
 
5213 aa  329  2.0000000000000001e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5751  amino acid adenylation domain protein  27.97 
 
 
1578 aa  328  2.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3733  amino acid adenylation domain-containing protein  30.85 
 
 
1779 aa  329  2.0000000000000001e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.279948 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5064  amino acid adenylation domain protein  31.66 
 
 
4449 aa  328  3e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1088  hypothetical protein  30.32 
 
 
2187 aa  327  8.000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5188  amino acid adenylation domain protein  28.77 
 
 
5738 aa  327  9e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0122381 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2952  amino acid adenylation domain protein  30.11 
 
 
2012 aa  327  9e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.537682 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1971  amino acid adenylation domain-containing protein  30.48 
 
 
1109 aa  327  1e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.565529  normal  0.353817 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2968  amino acid adenylation domain-containing protein  26.95 
 
 
1331 aa  327  1e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4753  amino acid adenylation domain-containing protein  33.02 
 
 
6176 aa  327  1e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.86552 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  29.88 
 
 
4478 aa  326  2e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6472  amino acid adenylation domain-containing protein  29.47 
 
 
8914 aa  324  4e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4221  non-ribosomal peptide synthetase  27.67 
 
 
2174 aa  324  5e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.206011 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4083  amino acid adenylation domain-containing protein  28.66 
 
 
3942 aa  324  6e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.223479 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1749  amino acid adenylation domain protein  29.92 
 
 
1199 aa  323  8e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.82306  normal  0.0351239 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1758  amino acid adenylation domain-containing protein  27.93 
 
 
2386 aa  323  8e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9643  peptide synthetase  28.78 
 
 
2561 aa  323  9.999999999999999e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>