27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1634 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_1634  H+transporting two-sector ATPase C subunit  100 
 
 
102 aa  187  5.999999999999999e-47  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1920  V-type ATP synthase subunit K  79.21 
 
 
104 aa  121  3e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.418171  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1105  H+transporting two-sector ATPase C subunit  41.77 
 
 
142 aa  65.5  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1014  H+transporting two-sector ATPase C subunit  43.55 
 
 
142 aa  57  0.00000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1619  V-type ATP synthase subunit K  48.39 
 
 
222 aa  55.5  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.573628  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0294  V-type ATP synthase subunit K  48.39 
 
 
222 aa  55.5  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.620174 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0363  V-type ATP synthase subunit K  48.39 
 
 
222 aa  55.8  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.100605  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0520  H+transporting two-sector ATPase C subunit  46.15 
 
 
139 aa  55.8  0.0000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0553  V-type ATP synthase subunit K  48.39 
 
 
222 aa  55.5  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.651546  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0061  V-type ATP synthase subunit K  48.39 
 
 
223 aa  55.1  0.0000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0283  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  50 
 
 
82 aa  55.1  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.319058  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2681  H+transporting two-sector ATPase C subunit  46.77 
 
 
93 aa  52.4  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0243152  normal  0.117564 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1179  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  43.55 
 
 
85 aa  50.8  0.000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00560744  normal  0.523004 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1688  H+transporting two-sector ATPase C subunit  49.18 
 
 
102 aa  50.4  0.000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.422777 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1218  hypothetical protein  42.11 
 
 
83 aa  49.7  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.000000000445422  normal  0.214233 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1774  V-type ATP synthase subunit K  49.21 
 
 
232 aa  49.7  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2086  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  37.93 
 
 
151 aa  49.3  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.185721  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1266  H(+)-transporting two-sector ATPase  42.11 
 
 
606 aa  48.1  0.00004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19430  V-type ATP synthase subunit C  44.87 
 
 
140 aa  47.8  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2349  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  48.39 
 
 
82 aa  46.6  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.211164 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3459  H+transporting two-sector ATPase C subunit  39.34 
 
 
138 aa  46.6  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.64867  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87235  vacuolar ATPase V0 domain subunit c' (17 kDa)  28.04 
 
 
163 aa  43.9  0.0007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.291766 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03088  hypothetical protein similar to vacuolar ATP synthase 16 kDa proteolipid subunit (Broad)  35.85 
 
 
161 aa  42.4  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02690  conserved hypothetical protein  30.84 
 
 
164 aa  42.4  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.372829  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04718  vacuolar ATPase proteolipid subunit c, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G08560)  31.25 
 
 
237 aa  41.2  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.519602  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0419  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  38.33 
 
 
70 aa  40.8  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35397  F-ATPase family transporter: protons (vacuolar)  26.85 
 
 
159 aa  40  0.01  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.175083  normal  0.827504 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>