24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1920 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1920  V-type ATP synthase subunit K  100 
 
 		 104 aa  196  7e-50  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.418171  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1634  H+transporting two-sector ATPase C subunit  79.21 
 
 		 102 aa  121  3e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1105  H+transporting two-sector ATPase C subunit  38.54 
 
 		 142 aa  62.8  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1014  H+transporting two-sector ATPase C subunit  43.55 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0520  H+transporting two-sector ATPase C subunit  46.15 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0283  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  48.39 
 
 		 82 aa  54.7  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.319058  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0553  V-type ATP synthase subunit K  46.77 
 
 		 222 aa  53.9  0.0000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.651546  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0363  V-type ATP synthase subunit K  46.77 
 
 		 222 aa  54.3  0.0000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.100605  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0294  V-type ATP synthase subunit K  46.77 
 
 		 222 aa  53.9  0.0000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.620174 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1619  V-type ATP synthase subunit K  46.77 
 
 		 222 aa  53.9  0.0000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.573628  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0061  V-type ATP synthase subunit K  46.77 
 
 		 223 aa  53.9  0.0000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2681  H+transporting two-sector ATPase C subunit  46.77 
 
 		 93 aa  52.4  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0243152  normal  0.117564 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1179  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  43.55 
 
 		 85 aa  50.8  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00560744  normal  0.523004 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2086  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  35.53 
 
 		 151 aa  50.1  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.185721  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1774  V-type ATP synthase subunit K  43.24 
 
 		 232 aa  49.3  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1688  H+transporting two-sector ATPase C subunit  47.54 
 
 		 102 aa  49.3  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.422777 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19430  V-type ATP synthase subunit C  44.44 
 
 		 140 aa  47.4  0.00007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1218  hypothetical protein  43.55 
 
 		 83 aa  47  0.00008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.000000000445422  normal  0.214233 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3459  H+transporting two-sector ATPase C subunit  37.7 
 
 		 138 aa  46.6  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.64867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2349  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  46.77 
 
 		 82 aa  45.4  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.211164 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1266  H(+)-transporting two-sector ATPase  37.97 
 
 		 606 aa  46.2  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK03340  hydrogen ion transporter, putative  39.19 
 
 		 190 aa  41.6  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.000569268  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15741  F0F1 ATP synthase subunit C  32.38 
 
 		 111 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0419  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  38.33 
 
 		 70 aa  40.8  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>