51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_4457 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_4457  hypothetical protein  100 
 
 		 85 aa  178  2.9999999999999997e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.919934 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4858  hypothetical protein  65.82 
 
 		 81 aa  113  7.999999999999999e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4184  hypothetical protein  67.53 
 
 		 82 aa  113  7.999999999999999e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0065  hypothetical protein  55.7 
 
 		 88 aa  95.5  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0082  hypothetical protein  54.43 
 
 		 87 aa  94  6e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0079  hypothetical protein  53.49 
 
 		 87 aa  94  6e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0085  hypothetical protein  53.49 
 
 		 88 aa  92.4  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0079  hypothetical protein  53.95 
 
 		 88 aa  90.5  7e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3774  acetyltransferase-like  51.32 
 
 		 108 aa  89.7  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.463282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0083  hypothetical protein  53.16 
 
 		 87 aa  89.4  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0080  hypothetical protein  53.75 
 
 		 87 aa  88.6  3e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0084  hypothetical protein  53.75 
 
 		 87 aa  88.2  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3969  hypothetical protein  44.05 
 
 		 85 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0071  hypothetical protein  48.68 
 
 		 79 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2946  hypothetical protein  41.1 
 
 		 100 aa  58.5  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3817  hypothetical protein  36.47 
 
 		 99 aa  55.8  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.4231  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2553  acetyltransferase-like protein  32.93 
 
 		 94 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000305824  hitchhiker  0.000000000000131346 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2768  hypothetical protein  36.23 
 
 		 96 aa  53.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.173421 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1808  acetyltransferase  31.17 
 
 		 93 aa  52.8  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1761  acetyltransferase  29.87 
 
 		 123 aa  50.8  0.000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0128615  normal  0.0715534 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2243  acetyltransferase-like protein  30.86 
 
 		 93 aa  50.8  0.000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2206  hypothetical protein  33.33 
 
 		 90 aa  50.8  0.000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.788583 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3553  hypothetical protein  37.14 
 
 		 99 aa  50.4  0.000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3559  hypothetical protein  30.49 
 
 		 94 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41930  hypothetical protein  30.49 
 
 		 161 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2072  hypothetical protein  34.29 
 
 		 117 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0000410313  normal  0.04757 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2274  hypothetical protein  34.29 
 
 		 95 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.0000000180646  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2765  hypothetical protein  38.18 
 
 		 96 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2664  hypothetical protein  31.17 
 
 		 100 aa  48.1  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0595784 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3163  hypothetical protein  38.18 
 
 		 96 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.919705  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2724  hypothetical protein  36.36 
 
 		 96 aa  47  0.00009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0839227  normal  0.382992 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1807  acetyltransferase-like  38.89 
 
 		 110 aa  47  0.00009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2323  hypothetical protein  32.86 
 
 		 143 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.0000526442  hitchhiker  0.0000374352 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4010  hypothetical protein  32.86 
 
 		 115 aa  47  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000057579  normal  0.556915 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2008  hypothetical protein  39.71 
 
 		 110 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.370861 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3447  hypothetical protein  32.86 
 
 		 93 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000030181  hitchhiker  0.000684662 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0132  hypothetical protein  26.58 
 
 		 97 aa  45.8  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1924  hypothetical protein  32.86 
 
 		 93 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000705286  hitchhiker  0.00000000000000488804 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1764  hypothetical protein  32.86 
 
 		 93 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000155918  hitchhiker  0.000000000000406701 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0141  hypothetical protein  25 
 
 		 97 aa  44.3  0.0006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2713  hypothetical protein  28.57 
 
 		 95 aa  44.3  0.0006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.550413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4721  hypothetical protein  36.76 
 
 		 103 aa  42.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.534046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1960  hypothetical protein  30.86 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0804  hypothetical protein  28.57 
 
 		 92 aa  42  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0713  acetyltransferase  29.87 
 
 		 90 aa  41.6  0.004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0818284  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23120  hypothetical protein  30 
 
 		 90 aa  41.6  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.0000670372  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0921  hypothetical protein  31.76 
 
 		 117 aa  40.8  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.513329  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1504  hypothetical protein  31.88 
 
 		 98 aa  40.8  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0210  acetyltransferase  31.58 
 
 		 93 aa  40.8  0.006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0194  acetyltransferase-like protein  30.77 
 
 		 113 aa  40.4  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1868  hypothetical protein  38.46 
 
 		 112 aa  40  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.551038  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>