60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3774 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009092  Shew_3774  acetyltransferase-like  100 
 
 
108 aa  225  2e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.463282  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0083  hypothetical protein  67.53 
 
 
87 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0065  hypothetical protein  67.53 
 
 
88 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0080  hypothetical protein  66.23 
 
 
87 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0082  hypothetical protein  66.23 
 
 
87 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0084  hypothetical protein  64.94 
 
 
87 aa  114  5e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0085  hypothetical protein  63.64 
 
 
88 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0079  hypothetical protein  64.94 
 
 
87 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0079  hypothetical protein  60.92 
 
 
88 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0071  hypothetical protein  60.26 
 
 
79 aa  101  3e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4858  hypothetical protein  56.79 
 
 
81 aa  99.8  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3969  hypothetical protein  59.74 
 
 
85 aa  97.1  7e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4457  hypothetical protein  51.32 
 
 
85 aa  89.7  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.919934 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4184  hypothetical protein  51.32 
 
 
82 aa  89.4  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2243  acetyltransferase-like protein  36.59 
 
 
93 aa  65.9  0.0000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2072  hypothetical protein  39.74 
 
 
117 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0000410313  normal  0.04757 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2274  hypothetical protein  39.74 
 
 
95 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.0000000180646  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3817  hypothetical protein  40.26 
 
 
99 aa  64.3  0.0000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.4231  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2946  hypothetical protein  39.51 
 
 
100 aa  64.3  0.0000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2323  hypothetical protein  33.33 
 
 
143 aa  63.5  0.0000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.0000526442  hitchhiker  0.0000374352 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3559  hypothetical protein  37.18 
 
 
94 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41930  hypothetical protein  37.18 
 
 
161 aa  62  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2553  acetyltransferase-like protein  35.9 
 
 
94 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000305824  hitchhiker  0.000000000000131346 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1764  hypothetical protein  37.18 
 
 
93 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000155918  hitchhiker  0.000000000000406701 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1924  hypothetical protein  37.18 
 
 
93 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000705286  hitchhiker  0.00000000000000488804 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3447  hypothetical protein  37.18 
 
 
93 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000030181  hitchhiker  0.000684662 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2206  hypothetical protein  38.96 
 
 
90 aa  60.5  0.000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.788583 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2765  hypothetical protein  34.15 
 
 
96 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3163  hypothetical protein  40.58 
 
 
96 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.919705  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2664  hypothetical protein  35.14 
 
 
100 aa  57  0.00000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0595784 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4010  hypothetical protein  34.62 
 
 
115 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000057579  normal  0.556915 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2724  hypothetical protein  32.53 
 
 
96 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0839227  normal  0.382992 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23120  hypothetical protein  34.62 
 
 
90 aa  54.3  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.0000670372  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0132  hypothetical protein  29.87 
 
 
97 aa  53.1  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2768  hypothetical protein  39.13 
 
 
96 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.173421 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0141  hypothetical protein  29.87 
 
 
97 aa  52.4  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0210  acetyltransferase  39.29 
 
 
93 aa  50.4  0.000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2713  hypothetical protein  28.95 
 
 
95 aa  48.1  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.550413  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0921  hypothetical protein  34.07 
 
 
117 aa  47.8  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.513329  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5465  hypothetical protein  30.49 
 
 
104 aa  46.2  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00670  hypothetical protein  33.78 
 
 
92 aa  45.4  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.83104  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0194  acetyltransferase-like protein  34.94 
 
 
113 aa  45.1  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4391  hypothetical protein  31.43 
 
 
90 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.946399  normal  0.0400185 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0999  hypothetical protein  31.08 
 
 
89 aa  42.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.833549 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3723  hypothetical protein  30.14 
 
 
87 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0090  hypothetical protein  30.77 
 
 
94 aa  42.4  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000798856  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2548  hypothetical protein  27.27 
 
 
89 aa  42  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.17311  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3334  putative acetyltransferase protein  34.85 
 
 
92 aa  41.6  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.474868 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1761  acetyltransferase  27.66 
 
 
123 aa  41.2  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0128615  normal  0.0715534 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1014  hypothetical protein  26.74 
 
 
117 aa  41.2  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.411227 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1808  acetyltransferase  25 
 
 
93 aa  41.2  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3739  acetyltransferase-like protein  32.18 
 
 
119 aa  41.2  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3475  acetyltransferase  32 
 
 
111 aa  40.8  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.597651 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4762  acetyltransferase-like protein  28.21 
 
 
110 aa  40.8  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1594  hypothetical protein  30.99 
 
 
97 aa  40.8  0.006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0106902  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1960  hypothetical protein  34.15 
 
 
96 aa  40.8  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1504  hypothetical protein  33.33 
 
 
98 aa  40.8  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1807  acetyltransferase-like  32.35 
 
 
110 aa  40.8  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02810  predicted acetyltransferase  28.05 
 
 
96 aa  40.4  0.008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3266  hypothetical protein  35.8 
 
 
96 aa  40.4  0.008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.709169  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>