52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_4184 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_4184  hypothetical protein  100 
 
 
82 aa  174  4e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4457  hypothetical protein  67.53 
 
 
85 aa  113  7.999999999999999e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.919934 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0079  hypothetical protein  65 
 
 
88 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0085  hypothetical protein  64.47 
 
 
88 aa  108  3e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0080  hypothetical protein  64.94 
 
 
87 aa  106  1e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0083  hypothetical protein  65.33 
 
 
87 aa  105  1e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0084  hypothetical protein  64.94 
 
 
87 aa  105  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0065  hypothetical protein  60.53 
 
 
88 aa  103  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0079  hypothetical protein  60.81 
 
 
87 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0082  hypothetical protein  60 
 
 
87 aa  100  7e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4858  hypothetical protein  57.14 
 
 
81 aa  95.9  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0071  hypothetical protein  53.16 
 
 
79 aa  92.4  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3774  acetyltransferase-like  51.32 
 
 
108 aa  89.4  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.463282  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3969  hypothetical protein  53.95 
 
 
85 aa  85.9  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2946  hypothetical protein  36.84 
 
 
100 aa  59.3  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3817  hypothetical protein  40.79 
 
 
99 aa  59.3  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.4231  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2206  hypothetical protein  34.18 
 
 
90 aa  58.2  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.788583 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1808  acetyltransferase  34.18 
 
 
93 aa  55.8  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1761  acetyltransferase  32.91 
 
 
123 aa  54.3  0.0000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0128615  normal  0.0715534 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2553  acetyltransferase-like protein  34.78 
 
 
94 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000305824  hitchhiker  0.000000000000131346 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3559  hypothetical protein  34.78 
 
 
94 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41930  hypothetical protein  35.29 
 
 
161 aa  52  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2274  hypothetical protein  35.29 
 
 
95 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.0000000180646  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2243  acetyltransferase-like protein  28.21 
 
 
93 aa  51.6  0.000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2072  hypothetical protein  35.29 
 
 
117 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0000410313  normal  0.04757 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2768  hypothetical protein  32.35 
 
 
96 aa  50.4  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.173421 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3163  hypothetical protein  33.33 
 
 
96 aa  50.1  0.000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.919705  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23120  hypothetical protein  38.1 
 
 
90 aa  49.7  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.0000670372  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2724  hypothetical protein  31.88 
 
 
96 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0839227  normal  0.382992 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3447  hypothetical protein  33.33 
 
 
93 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000030181  hitchhiker  0.000684662 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1924  hypothetical protein  33.33 
 
 
93 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000705286  hitchhiker  0.00000000000000488804 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2008  hypothetical protein  36.11 
 
 
110 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.370861 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1807  acetyltransferase-like  31.88 
 
 
110 aa  48.5  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1764  hypothetical protein  33.33 
 
 
93 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000155918  hitchhiker  0.000000000000406701 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4010  hypothetical protein  33.82 
 
 
115 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000057579  normal  0.556915 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2323  hypothetical protein  33.33 
 
 
143 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.0000526442  hitchhiker  0.0000374352 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4721  hypothetical protein  34.72 
 
 
103 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.534046  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0210  acetyltransferase  32.91 
 
 
93 aa  47.4  0.00006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2765  hypothetical protein  30.43 
 
 
96 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0194  acetyltransferase-like protein  35.14 
 
 
113 aa  45.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2664  hypothetical protein  29.11 
 
 
100 aa  45.1  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0595784 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3553  hypothetical protein  33.75 
 
 
99 aa  44.7  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1594  hypothetical protein  28.57 
 
 
97 aa  42.4  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0106902  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2917  GCN5-related N-acetyltransferase  29.63 
 
 
97 aa  42.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.142881 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0141  hypothetical protein  26.47 
 
 
97 aa  42.4  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09658  Acetyltransferase  30.77 
 
 
102 aa  41.6  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5465  hypothetical protein  30 
 
 
104 aa  41.6  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1003  hypothetical protein  32.88 
 
 
93 aa  41.2  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.709962  normal  0.531715 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0132  hypothetical protein  23.68 
 
 
97 aa  41.6  0.004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3098  hypothetical protein  27.94 
 
 
96 aa  41.2  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.207624  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0164  hypothetical protein  27.85 
 
 
105 aa  40.8  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2775  putative acetyltransferase  34.72 
 
 
312 aa  40  0.01  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.22239  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>