More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2968 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009831  Ssed_2968  acetyltransferase  100 
 
 
178 aa  364  1e-100  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.11746  normal  0.186962 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1502  Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)-like protein  45.6 
 
 
166 aa  118  3.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1974  hypothetical protein  46.08 
 
 
187 aa  93.2  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.931779  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2130  transferase hexapeptide repeat containing protein  53.06 
 
 
208 aa  91.7  6e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02281  Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily) protein  47.42 
 
 
190 aa  82.8  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.284307  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1952  acetyltransferase  47.13 
 
 
191 aa  82  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.582602  normal  0.324618 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0055  Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)- like protein  44.64 
 
 
268 aa  81.3  0.000000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2194  hypothetical protein  38.94 
 
 
185 aa  80.1  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.73675  decreased coverage  0.00108321 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_28841  predicted protein  44.9 
 
 
204 aa  79.3  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2893  acetyl transferase  35.4 
 
 
240 aa  78.6  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000824087  normal  0.0256653 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1354  acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)  44.79 
 
 
195 aa  78.2  0.00000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0867  arsenate reductase  34.29 
 
 
179 aa  77  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.784017  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0483  maltose O-acetyltransferase  40.82 
 
 
189 aa  76.3  0.0000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.833227  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0419  hexapaptide repeat-containing transferase  42.86 
 
 
204 aa  76.3  0.0000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000074046  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6294  acetyltransferase  41.23 
 
 
191 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148142  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5031  Maltose O-acetyltransferase  46.07 
 
 
183 aa  74.7  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4911  maltose O-acetyltransferase  47.19 
 
 
183 aa  74.3  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3508  nodulation protein L  36.63 
 
 
181 aa  74.7  0.0000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0002287  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12060  acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)  38.38 
 
 
193 aa  73.6  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1146  transferase hexapeptide repeat containing protein  42.27 
 
 
183 aa  73.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3377  maltose O-acetyltransferase  46.07 
 
 
187 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1011  acetyltransferase  40.45 
 
 
182 aa  73.2  0.000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0285362  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4764  transferase hexapeptide repeat containing protein  44.94 
 
 
187 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.935522 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3155  maltose O-acetyltransferase  46.07 
 
 
187 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000124616  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3140  maltose O-acetyltransferase  46.07 
 
 
187 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0964249  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6263  maltose O-acetyltransferase  46.51 
 
 
183 aa  73.2  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.486684  normal  0.132466 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3402  maltose O-acetyltransferase  46.07 
 
 
187 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00827475  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3135  transferase hexapeptide repeat containing protein  48.86 
 
 
182 aa  73.2  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0123  acetyltransferase, CysE/LacA/LpxA/NodL family  44.94 
 
 
178 aa  73.2  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1584  hexapaptide repeat-containing transferase  44.44 
 
 
196 aa  73.2  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2590  maltose transacetylase  46.59 
 
 
195 aa  72.8  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3375  maltose O-acetyltransferase  46.07 
 
 
187 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.567242  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3624  nodulation protein L  43.16 
 
 
184 aa  72.4  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3050  maltose O-acetyltransferase  44.94 
 
 
187 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000408787  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3747  nodulation protein L  43.16 
 
 
184 aa  72.4  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0103184  normal  0.675776 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2912  maltose transacetylase  46.59 
 
 
195 aa  72.8  0.000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.231486  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1874  maltose O-acetyltransferase  44.94 
 
 
187 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3377  maltose O-acetyltransferase  44.94 
 
 
187 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000821648  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3624  hexapaptide repeat-containing transferase  38 
 
 
182 aa  72  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0939  maltose O-acetyltransferase  44.94 
 
 
183 aa  72  0.000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4918  hexapaptide repeat-containing transferase  42.39 
 
 
191 aa  72.4  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.198536  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0645  Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)- like protein  40.23 
 
 
225 aa  72.4  0.000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.1009 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2989  Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)- like protein  38.39 
 
 
284 aa  72  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.685626  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3080  hexapaptide repeat-containing transferase  43.82 
 
 
187 aa  71.6  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00258923  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0997  galactoside O-acetyltransferase  35.71 
 
 
206 aa  71.6  0.000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.158856  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2849  putative acetyltransferase  42.7 
 
 
187 aa  71.6  0.000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.239696  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3556  nodulation protein L  43.16 
 
 
184 aa  71.2  0.000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00247017  hitchhiker  0.00893631 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0465  maltose O-acetyltransferase  47.19 
 
 
186 aa  71.2  0.000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0760174  hitchhiker  0.0000000000353002 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2989  hexapaptide repeat-containing transferase  38.78 
 
 
185 aa  71.2  0.000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29453  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0739  transferase hexapeptide repeat containing protein  38.26 
 
 
200 aa  70.9  0.000000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.597159 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2197  putative sugar acetyltransferase  38.1 
 
 
220 aa  70.9  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1260  maltose O-acetyltransferase  41.57 
 
 
184 aa  70.9  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1079  putative acetyltransferase  43.27 
 
 
177 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.770563  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2852  hexapaptide repeat-containing transferase  37.76 
 
 
185 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.581317 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4614  transferase hexapeptide repeat containing protein  42.7 
 
 
187 aa  70.5  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.270396  normal  0.31258 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0407  transferase hexapeptide repeat containing protein  43.01 
 
 
223 aa  70.9  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4244  hexapaptide repeat-containing transferase  42.7 
 
 
187 aa  70.5  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.587532  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0686  nodulation protein L  42.11 
 
 
184 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00118691  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1458  hexapaptide repeat-containing transferase  42.11 
 
 
194 aa  70.1  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.560945  normal  0.127404 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4774  maltose O-acetyltransferase  44.94 
 
 
186 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.789771  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3784  transferase hexapeptide repeat containing protein  33.33 
 
 
181 aa  69.7  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4492  hexapaptide repeat-containing transferase  44.94 
 
 
185 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1672  acetyltransferase  42.7 
 
 
186 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2880  putative lipopolysaccharide biosynthesis O-acetyl transferase WbbJ  40.82 
 
 
176 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1408  acetyltransferase  41.49 
 
 
203 aa  69.3  0.00000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0573867  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2577  hexapaptide repeat-containing transferase  34.62 
 
 
199 aa  68.9  0.00000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2439  Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)- like protein  33.33 
 
 
173 aa  68.9  0.00000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0423  acetyltransferase  45.68 
 
 
190 aa  68.9  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0284031  hitchhiker  0.00641556 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2631  hexapaptide repeat-containing transferase  34.62 
 
 
199 aa  68.9  0.00000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.778978  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2637  hexapaptide repeat-containing transferase  34.88 
 
 
223 aa  68.9  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.94707 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00410  maltose O-acetyltransferase  42.7 
 
 
183 aa  68.6  0.00000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3157  maltose O-acetyltransferase  42.7 
 
 
183 aa  68.6  0.00000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3151  transferase hexapeptide repeat containing protein  42.7 
 
 
183 aa  68.6  0.00000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.594832  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1660  acetyltransferase  38 
 
 
175 aa  68.2  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.135233  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2179  transferase hexapeptide repeat containing protein  35.71 
 
 
183 aa  68.6  0.00000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.167318  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2974  hexapaptide repeat-containing transferase  48.42 
 
 
180 aa  68.2  0.00000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00183597  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0494  maltose O-acetyltransferase  42.7 
 
 
183 aa  68.6  0.00000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0535  maltose O-acetyltransferase  42.7 
 
 
183 aa  68.6  0.00000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00415  hypothetical protein  42.7 
 
 
183 aa  68.6  0.00000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2366  transferase hexapeptide repeat containing protein  39.33 
 
 
174 aa  68.2  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0391  maltose O-acetyltransferase  42.7 
 
 
183 aa  68.2  0.00000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0502  maltose O-acetyltransferase  42.7 
 
 
183 aa  68.2  0.00000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4118  phosphonate metabolim protein, transferase hexapeptide repeat family  49.25 
 
 
205 aa  68.2  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1463  hexapaptide repeat-containing transferase  43.3 
 
 
192 aa  67.8  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000251809  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1780  acetyltransferase  45.74 
 
 
203 aa  67.8  0.00000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1906  hexapaptide repeat-containing transferase  33.54 
 
 
176 aa  67.8  0.00000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1439  hexapaptide repeat-containing transferase  38.21 
 
 
218 aa  67.8  0.00000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0513  maltose O-acetyltransferase  41.57 
 
 
183 aa  67.4  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000528215  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4442  maltose O-acetyltransferase  42.7 
 
 
185 aa  67.4  0.00000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.260239 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5163  acetyltransferase  44.83 
 
 
188 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.357684 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3095  hexapaptide repeat-containing transferase  33.81 
 
 
239 aa  67  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.165073 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0758  acetyltransferase  39.33 
 
 
209 aa  67  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.708622  normal  0.0152344 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3541  transferase hexapeptide repeat containing protein  45.56 
 
 
198 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2830  acetyltransferase  37.37 
 
 
176 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00579309  normal  0.0978513 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0532  maltose O-acetyltransferase  41.57 
 
 
183 aa  67.4  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0502164  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4432  phosphonate metabolim protein, transferase hexapeptide repeat family  49.25 
 
 
205 aa  66.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.649079  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06920  hypothetical protein  35.48 
 
 
216 aa  66.6  0.0000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.832713  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1896  acetyltransferase  36.73 
 
 
225 aa  66.6  0.0000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3242  hexapaptide repeat-containing transferase  39.02 
 
 
204 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3283  galactoside O-acetyltransferase  40.45 
 
 
201 aa  66.2  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.142249  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>