109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2930 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_2930  phenylalanine 4-monooxygenase  100 
 
 		 265 aa  549  1e-155  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00742608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1715  phenylalanine 4-monooxygenase  81.51 
 
 		 265 aa  461  1e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00750789  normal  0.397112 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1435  phenylalanine 4-monooxygenase  72.83 
 
 		 277 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0156707  normal  0.62095 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1328  phenylalanine 4-monooxygenase  71.32 
 
 		 265 aa  409  1e-113  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2222  phenylalanine 4-monooxygenase  72.31 
 
 		 263 aa  404  1.0000000000000001e-112  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.550402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1479  phenylalanine 4-monooxygenase  73.31 
 
 		 266 aa  404  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00165171  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2868  phenylalanine 4-monooxygenase  73.68 
 
 		 266 aa  404  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.127384  hitchhiker  0.00000000657898 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1484  phenylalanine 4-monooxygenase  72.93 
 
 		 266 aa  401  1e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000194196  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1515  phenylalanine 4-monooxygenase  73.31 
 
 		 266 aa  404  1e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.319318  normal  0.0509448 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1448  phenylalanine 4-monooxygenase  71.76 
 
 		 263 aa  395  1e-109  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0546255  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1666  phenylalanine 4-monooxygenase  71.92 
 
 		 271 aa  392  1e-108  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2607  phenylalanine 4-monooxygenase  70.68 
 
 		 271 aa  394  1e-108  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.109404  hitchhiker  0.000000531063 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2674  phenylalanine 4-monooxygenase  71.05 
 
 		 271 aa  394  1e-108  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.192739  hitchhiker  0.000490875 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2781  phenylalanine 4-monooxygenase  70.68 
 
 		 271 aa  393  1e-108  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.596236  hitchhiker  0.0000732891 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2595  phenylalanine 4-monooxygenase  68.97 
 
 		 263 aa  381  1e-105  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0717257  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1386  phenylalanine 4-monooxygenase  69.17 
 
 		 266 aa  382  1e-105  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02830  phenylalanine 4-monooxygenase  65.04 
 
 		 271 aa  355  5e-97  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0161825  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52990  phenylalanine 4-monooxygenase  58.4 
 
 		 262 aa  329  3e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4644  phenylalanine 4-monooxygenase  58.4 
 
 		 262 aa  329  3e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0943506  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1499  phenylalanine 4-monooxygenase  56.65 
 
 		 263 aa  322  5e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1554  phenylalanine 4-monooxygenase  57.42 
 
 		 291 aa  320  9.999999999999999e-87  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.237867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3112  phenylalanine 4-monooxygenase  56.92 
 
 		 261 aa  319  3e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.417382 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4490  phenylalanine 4-monooxygenase  56.87 
 
 		 262 aa  317  1e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1424  phenylalanine 4-monooxygenase  56.87 
 
 		 262 aa  317  1e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.17475  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34650  phenylalanine 4-monooxygenase  57.75 
 
 		 261 aa  317  2e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3995  phenylalanine 4-monooxygenase  56.49 
 
 		 262 aa  315  5e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.022764 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3766  phenylalanine 4-monooxygenase  57.99 
 
 		 267 aa  314  9.999999999999999e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1041  phenylalanine 4-monooxygenase  56.98 
 
 		 265 aa  313  1.9999999999999998e-84  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3779  phenylalanine 4-monooxygenase  55.73 
 
 		 262 aa  312  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.736945  hitchhiker  0.000564604 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2999  phenylalanine 4-monooxygenase  53.76 
 
 		 266 aa  310  2e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.25361  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3575  phenylalanine 4-monooxygenase  55.77 
 
 		 265 aa  309  4e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.861489  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1822  phenylalanine-4-hydroxylase  55 
 
 		 265 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144628  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0407  phenylalanine 4-monooxygenase  53.64 
 
 		 289 aa  295  8e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000239412  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001480  phenylalanine-4-hydroxylase  53.82 
 
 		 264 aa  291  9e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05421  phenylalanine 4-monooxygenase  53.44 
 
 		 264 aa  287  1e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1507  phenylalanine 4-monooxygenase  49.43 
 
 		 263 aa  258  7e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0709957  normal  0.129189 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1403  phenylalanine 4-monooxygenase  47.91 
 
 		 263 aa  249  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.424182 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2700  phenylalanine 4-monooxygenase  46.15 
 
 		 272 aa  227  2e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2572  phenylalanine 4-monooxygenase  45.77 
 
 		 272 aa  225  5.0000000000000005e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2208  phenylalanine 4-monooxygenase  49.78 
 
 		 293 aa  204  2e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0291015  normal  0.429407 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3533  phenylalanine 4-monooxygenase  44.49 
 
 		 310 aa  199  5e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0168  phenylalanine 4-monooxygenase  45.02 
 
 		 299 aa  198  7.999999999999999e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1117  phenylalanine 4-monooxygenase  44.3 
 
 		 299 aa  196  3e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3337  phenylalanine 4-monooxygenase  43.17 
 
 		 297 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2046  phenylalanine 4-monooxygenase  43.44 
 
 		 303 aa  195  6e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0739915 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0096  phenylalanine 4-monooxygenase  42.73 
 
 		 320 aa  193  3e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3387  phenylalanine 4-monooxygenase  42.15 
 
 		 316 aa  192  5e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.752001  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3259  phenylalanine 4-monooxygenase  42.73 
 
 		 306 aa  192  5e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2977  phenylalanine 4-monooxygenase  42.73 
 
 		 320 aa  192  5e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0069  phenylalanine 4-monooxygenase  42.73 
 
 		 308 aa  192  5e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0078  phenylalanine 4-monooxygenase  42.73 
 
 		 320 aa  192  5e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.227621  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0078  phenylalanine 4-monooxygenase  42.29 
 
 		 324 aa  192  7e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0077  phenylalanine 4-monooxygenase  42.92 
 
 		 308 aa  191  7e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3549  phenylalanine 4-monooxygenase  42.02 
 
 		 314 aa  191  8e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.881264 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3355  phenylalanine 4-monooxygenase  42.39 
 
 		 313 aa  191  9e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3225  phenylalanine 4-monooxygenase  43.3 
 
 		 314 aa  191  9e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0011  phenylalanine 4-monooxygenase  43.56 
 
 		 336 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0347  phenylalanine 4-monooxygenase  44.87 
 
 		 295 aa  189  4e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.72687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3187  phenylalanine 4-monooxygenase  43.35 
 
 		 312 aa  187  1e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3921  phenylalanine 4-monooxygenase  43.56 
 
 		 296 aa  187  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.169368  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4768  phenylalanine 4-monooxygenase  45.29 
 
 		 292 aa  185  6e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4193  phenylalanine 4-monooxygenase  44.1 
 
 		 292 aa  182  3e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2136  phenylalanine 4-monooxygenase  45.13 
 
 		 275 aa  182  5.0000000000000004e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.636393 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0553  phenylalanine 4-monooxygenase  42.86 
 
 		 289 aa  180  2e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0201466  normal  0.11263 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0206  phenylalanine 4-monooxygenase  44.29 
 
 		 336 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2927  phenylalanine 4-monooxygenase  44.29 
 
 		 336 aa  179  4e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3383  phenylalanine 4-monooxygenase  44.29 
 
 		 297 aa  179  4e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1616  phenylalanine 4-monooxygenase  44.29 
 
 		 297 aa  179  4e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4001  phenylalanine 4-monooxygenase  44.29 
 
 		 297 aa  179  4e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4075  phenylalanine 4-monooxygenase  44.29 
 
 		 297 aa  179  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2986  phenylalanine 4-monooxygenase  44.29 
 
 		 297 aa  179  4e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0518  phenylalanine 4-monooxygenase  43.04 
 
 		 279 aa  178  7e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.261474  normal  0.0225158 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0534  phenylalanine 4-monooxygenase  43.04 
 
 		 279 aa  178  7e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1267  phenylalanine 4-monooxygenase  40.49 
 
 		 296 aa  177  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4215  phenylalanine 4-monooxygenase  44.39 
 
 		 292 aa  176  3e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0032  phenylalanine 4-monooxygenase  42.52 
 
 		 297 aa  173  2.9999999999999996e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.686174  hitchhiker  0.000000292031 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1853  phenylalanine 4-monooxygenase  43.95 
 
 		 293 aa  171  1e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.56833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6319  phenylalanine-4-hydroxylase  40.09 
 
 		 261 aa  171  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.803918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2108  aromatic amino acid hydroxylase  40.27 
 
 		 244 aa  167  1e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0346551  normal  0.391634 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1076  phenylalanine 4-monooxygenase  36.29 
 
 		 250 aa  165  5e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0135613 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03285  phenylalanine 4-monooxygenase  40.44 
 
 		 296 aa  165  5.9999999999999996e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1392  phenylalanine 4-monooxygenase  39.52 
 
 		 290 aa  155  8e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00177331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0605  aromatic amino acid hydroxylase  33.64 
 
 		 243 aa  144  1e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3847  aromatic amino acid hydroxylase  35.14 
 
 		 247 aa  137  3.0000000000000003e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3025  phenylalanine 4-monooxygenase  31.31 
 
 		 246 aa  128  8.000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13175  predicted protein  36.61 
 
 		 391 aa  127  2.0000000000000002e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5444  phenylalanine 4-monooxygenase  33.33 
 
 		 296 aa  121  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.589228  normal  0.223638 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3076  phenylalanine 4-monooxygenase  29.34 
 
 		 585 aa  120  3e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1027  Tyrosine 3-monooxygenase  31.67 
 
 		 297 aa  119  7e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0491575 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4439  phenylalanine 4-monooxygenase  28.36 
 
 		 584 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4102  phenylalanine 4-monooxygenase  27.99 
 
 		 584 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4489  phenylalanine 4-monooxygenase  28.36 
 
 		 584 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4477  phenylalanine 4-monooxygenase  28.57 
 
 		 584 aa  115  6e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3717  Tyrosine 3-monooxygenase  33.78 
 
 		 296 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.337468  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4253  phenylalanine 4-monooxygenase  27.61 
 
 		 584 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4091  phenylalanine 4-monooxygenase  27.61 
 
 		 584 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4586  phenylalanine 4-monooxygenase  27.61 
 
 		 584 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8337  Tyrosine 3-monooxygenase  33.63 
 
 		 297 aa  114  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.870774 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0759  phenylalanine 4-monooxygenase  28.57 
 
 		 584 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4438  phenylalanine 4-monooxygenase  27.61 
 
 		 584 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>