109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001480 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013457  VEA_001480  phenylalanine-4-hydroxylase  100 
 
 
264 aa  546  1e-154  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05421  phenylalanine 4-monooxygenase  92.05 
 
 
264 aa  511  1e-144  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0407  phenylalanine 4-monooxygenase  68.82 
 
 
289 aa  392  1e-108  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000239412  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02830  phenylalanine 4-monooxygenase  58.91 
 
 
271 aa  330  1e-89  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0161825  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2999  phenylalanine 4-monooxygenase  58.75 
 
 
266 aa  313  9.999999999999999e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.25361  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1328  phenylalanine 4-monooxygenase  55.56 
 
 
265 aa  305  4.0000000000000004e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1479  phenylalanine 4-monooxygenase  57.47 
 
 
266 aa  305  6e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00165171  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1666  phenylalanine 4-monooxygenase  58.37 
 
 
271 aa  304  8.000000000000001e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2868  phenylalanine 4-monooxygenase  57.47 
 
 
266 aa  304  8.000000000000001e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.127384  hitchhiker  0.00000000657898 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1515  phenylalanine 4-monooxygenase  57.47 
 
 
266 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.319318  normal  0.0509448 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1484  phenylalanine 4-monooxygenase  57.09 
 
 
266 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000194196  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2781  phenylalanine 4-monooxygenase  57.42 
 
 
271 aa  302  4.0000000000000003e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.596236  hitchhiker  0.0000732891 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2222  phenylalanine 4-monooxygenase  57.09 
 
 
263 aa  302  4.0000000000000003e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.550402  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1435  phenylalanine 4-monooxygenase  55.56 
 
 
277 aa  302  4.0000000000000003e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0156707  normal  0.62095 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2607  phenylalanine 4-monooxygenase  57.42 
 
 
271 aa  301  6.000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.109404  hitchhiker  0.000000531063 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2595  phenylalanine 4-monooxygenase  57.47 
 
 
263 aa  301  7.000000000000001e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0717257  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2674  phenylalanine 4-monooxygenase  57.42 
 
 
271 aa  301  1e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.192739  hitchhiker  0.000490875 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1386  phenylalanine 4-monooxygenase  56.49 
 
 
266 aa  297  1e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4490  phenylalanine 4-monooxygenase  55.38 
 
 
262 aa  293  2e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3575  phenylalanine 4-monooxygenase  54.2 
 
 
265 aa  293  2e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.861489  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1424  phenylalanine 4-monooxygenase  55.38 
 
 
262 aa  293  2e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.17475  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3779  phenylalanine 4-monooxygenase  54.96 
 
 
262 aa  293  3e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.736945  hitchhiker  0.000564604 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1499  phenylalanine 4-monooxygenase  55 
 
 
263 aa  291  6e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3766  phenylalanine 4-monooxygenase  54.23 
 
 
267 aa  291  9e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2930  phenylalanine 4-monooxygenase  53.82 
 
 
265 aa  291  9e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00742608  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1448  phenylalanine 4-monooxygenase  55.25 
 
 
263 aa  290  1e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0546255  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3995  phenylalanine 4-monooxygenase  54.96 
 
 
262 aa  290  1e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.022764 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1822  phenylalanine-4-hydroxylase  53.05 
 
 
265 aa  289  4e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144628  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1715  phenylalanine 4-monooxygenase  53.64 
 
 
265 aa  288  5.0000000000000004e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00750789  normal  0.397112 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34650  phenylalanine 4-monooxygenase  54.86 
 
 
261 aa  286  2e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52990  phenylalanine 4-monooxygenase  53.46 
 
 
262 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4644  phenylalanine 4-monooxygenase  53.46 
 
 
262 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0943506  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3112  phenylalanine 4-monooxygenase  54.09 
 
 
261 aa  285  4e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.417382 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1554  phenylalanine 4-monooxygenase  52.73 
 
 
291 aa  273  3e-72  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.237867  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1041  phenylalanine 4-monooxygenase  51.78 
 
 
265 aa  268  7e-71  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1507  phenylalanine 4-monooxygenase  45.53 
 
 
263 aa  236  4e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0709957  normal  0.129189 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1403  phenylalanine 4-monooxygenase  46.3 
 
 
263 aa  234  8e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.424182 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2572  phenylalanine 4-monooxygenase  45.1 
 
 
272 aa  228  6e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2700  phenylalanine 4-monooxygenase  44.44 
 
 
272 aa  227  1e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0078  phenylalanine 4-monooxygenase  46.19 
 
 
324 aa  221  9e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3259  phenylalanine 4-monooxygenase  45.04 
 
 
306 aa  217  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3337  phenylalanine 4-monooxygenase  47.3 
 
 
297 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0077  phenylalanine 4-monooxygenase  45.04 
 
 
308 aa  215  5e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0069  phenylalanine 4-monooxygenase  44.63 
 
 
308 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0096  phenylalanine 4-monooxygenase  44.21 
 
 
320 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3533  phenylalanine 4-monooxygenase  46.36 
 
 
310 aa  212  4.9999999999999996e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2977  phenylalanine 4-monooxygenase  44.21 
 
 
320 aa  211  7e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0078  phenylalanine 4-monooxygenase  44.21 
 
 
320 aa  211  7e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.227621  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3387  phenylalanine 4-monooxygenase  44.55 
 
 
316 aa  205  6e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.752001  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0011  phenylalanine 4-monooxygenase  44.49 
 
 
336 aa  204  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3921  phenylalanine 4-monooxygenase  45.95 
 
 
296 aa  204  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.169368  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0168  phenylalanine 4-monooxygenase  42.55 
 
 
299 aa  203  2e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3549  phenylalanine 4-monooxygenase  44.55 
 
 
314 aa  204  2e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.881264 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3225  phenylalanine 4-monooxygenase  44.55 
 
 
314 aa  204  2e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3187  phenylalanine 4-monooxygenase  47 
 
 
312 aa  202  6e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3355  phenylalanine 4-monooxygenase  44.55 
 
 
313 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2208  phenylalanine 4-monooxygenase  46.43 
 
 
293 aa  198  7e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0291015  normal  0.429407 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0553  phenylalanine 4-monooxygenase  44.75 
 
 
289 aa  198  7.999999999999999e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0201466  normal  0.11263 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2927  phenylalanine 4-monooxygenase  47.69 
 
 
336 aa  193  2e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0206  phenylalanine 4-monooxygenase  47.69 
 
 
336 aa  193  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3383  phenylalanine 4-monooxygenase  47.69 
 
 
297 aa  193  2e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1616  phenylalanine 4-monooxygenase  47.69 
 
 
297 aa  193  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4001  phenylalanine 4-monooxygenase  47.69 
 
 
297 aa  193  2e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4075  phenylalanine 4-monooxygenase  47.69 
 
 
297 aa  193  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2986  phenylalanine 4-monooxygenase  47.69 
 
 
297 aa  193  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1117  phenylalanine 4-monooxygenase  40.61 
 
 
299 aa  192  3e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2046  phenylalanine 4-monooxygenase  43.21 
 
 
303 aa  192  5e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0739915 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6319  phenylalanine-4-hydroxylase  41.63 
 
 
261 aa  187  1e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.803918  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4193  phenylalanine 4-monooxygenase  43.18 
 
 
292 aa  186  3e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0032  phenylalanine 4-monooxygenase  41.63 
 
 
297 aa  185  7e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.686174  hitchhiker  0.000000292031 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2136  phenylalanine 4-monooxygenase  43.05 
 
 
275 aa  184  1.0000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.636393 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4768  phenylalanine 4-monooxygenase  42.45 
 
 
292 aa  184  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03285  phenylalanine 4-monooxygenase  40.24 
 
 
296 aa  183  2.0000000000000003e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0518  phenylalanine 4-monooxygenase  43.6 
 
 
279 aa  179  4.999999999999999e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.261474  normal  0.0225158 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0534  phenylalanine 4-monooxygenase  43.6 
 
 
279 aa  179  4.999999999999999e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0347  phenylalanine 4-monooxygenase  40.6 
 
 
295 aa  178  5.999999999999999e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.72687  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4215  phenylalanine 4-monooxygenase  40.34 
 
 
292 aa  176  3e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1853  phenylalanine 4-monooxygenase  40.36 
 
 
293 aa  176  3e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.56833  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1267  phenylalanine 4-monooxygenase  40.36 
 
 
296 aa  174  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2108  aromatic amino acid hydroxylase  40.51 
 
 
244 aa  171  7.999999999999999e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0346551  normal  0.391634 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1076  phenylalanine 4-monooxygenase  36.2 
 
 
250 aa  165  8e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0135613 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1392  phenylalanine 4-monooxygenase  41.01 
 
 
290 aa  160  1e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00177331  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3025  phenylalanine 4-monooxygenase  32.11 
 
 
246 aa  142  5e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0605  aromatic amino acid hydroxylase  31.65 
 
 
243 aa  135  8e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3847  aromatic amino acid hydroxylase  32.74 
 
 
247 aa  132  6.999999999999999e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3578  phenylalanine 4-monooxygenase  33.48 
 
 
294 aa  131  1.0000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.334066  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3076  phenylalanine 4-monooxygenase  29.8 
 
 
585 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4102  phenylalanine 4-monooxygenase  29.25 
 
 
584 aa  125  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4439  phenylalanine 4-monooxygenase  29.25 
 
 
584 aa  123  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4489  phenylalanine 4-monooxygenase  28.11 
 
 
584 aa  123  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4477  phenylalanine 4-monooxygenase  28.46 
 
 
584 aa  123  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4253  phenylalanine 4-monooxygenase  28.06 
 
 
584 aa  122  4e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4091  phenylalanine 4-monooxygenase  28.06 
 
 
584 aa  122  4e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4586  phenylalanine 4-monooxygenase  28.06 
 
 
584 aa  122  4e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5444  phenylalanine 4-monooxygenase  34.21 
 
 
296 aa  122  4e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.589228  normal  0.223638 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4438  phenylalanine 4-monooxygenase  28.06 
 
 
584 aa  122  4e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0759  phenylalanine 4-monooxygenase  28.46 
 
 
584 aa  122  6e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4205  phenylalanine 4-monooxygenase  28.06 
 
 
584 aa  120  3e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1027  Tyrosine 3-monooxygenase  33.48 
 
 
297 aa  115  8.999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0491575 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3717  Tyrosine 3-monooxygenase  38.2 
 
 
296 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.337468  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>