109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3779 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_3779  phenylalanine 4-monooxygenase  100 
 
 		 262 aa  543  1e-153  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.736945  hitchhiker  0.000564604 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4490  phenylalanine 4-monooxygenase  96.95 
 
 		 262 aa  528  1e-149  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1424  phenylalanine 4-monooxygenase  96.95 
 
 		 262 aa  528  1e-149  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.17475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3995  phenylalanine 4-monooxygenase  96.56 
 
 		 262 aa  526  1e-149  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.022764 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1499  phenylalanine 4-monooxygenase  91.22 
 
 		 263 aa  498  1e-140  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1822  phenylalanine-4-hydroxylase  85.88 
 
 		 265 aa  476  1e-133  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144628  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3112  phenylalanine 4-monooxygenase  83.91 
 
 		 261 aa  467  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.417382 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4644  phenylalanine 4-monooxygenase  84.35 
 
 		 262 aa  464  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0943506  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3575  phenylalanine 4-monooxygenase  83.97 
 
 		 265 aa  463  1e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.861489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52990  phenylalanine 4-monooxygenase  84.35 
 
 		 262 aa  462  1e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34650  phenylalanine 4-monooxygenase  76.63 
 
 		 261 aa  429  1e-119  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2222  phenylalanine 4-monooxygenase  63.22 
 
 		 263 aa  346  2e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.550402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02830  phenylalanine 4-monooxygenase  62.93 
 
 		 271 aa  344  1e-93  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0161825  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1328  phenylalanine 4-monooxygenase  62.31 
 
 		 265 aa  342  4e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1479  phenylalanine 4-monooxygenase  61.98 
 
 		 266 aa  339  2e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00165171  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1484  phenylalanine 4-monooxygenase  62.12 
 
 		 266 aa  339  2.9999999999999998e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000194196  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1386  phenylalanine 4-monooxygenase  60.98 
 
 		 266 aa  338  4e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1515  phenylalanine 4-monooxygenase  62.12 
 
 		 266 aa  338  4e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.319318  normal  0.0509448 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2868  phenylalanine 4-monooxygenase  62.5 
 
 		 266 aa  337  9e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.127384  hitchhiker  0.00000000657898 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2674  phenylalanine 4-monooxygenase  62.79 
 
 		 271 aa  336  1.9999999999999998e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.192739  hitchhiker  0.000490875 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1666  phenylalanine 4-monooxygenase  62.4 
 
 		 271 aa  335  5.999999999999999e-91  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2607  phenylalanine 4-monooxygenase  62.02 
 
 		 271 aa  334  7e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.109404  hitchhiker  0.000000531063 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1448  phenylalanine 4-monooxygenase  60.15 
 
 		 263 aa  334  9e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0546255  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2999  phenylalanine 4-monooxygenase  59 
 
 		 266 aa  334  1e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.25361  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2595  phenylalanine 4-monooxygenase  60.38 
 
 		 263 aa  332  3e-90  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0717257  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2781  phenylalanine 4-monooxygenase  62.02 
 
 		 271 aa  332  3e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.596236  hitchhiker  0.0000732891 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1435  phenylalanine 4-monooxygenase  60.69 
 
 		 277 aa  332  3e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0156707  normal  0.62095 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1554  phenylalanine 4-monooxygenase  59.39 
 
 		 291 aa  325  4.0000000000000003e-88  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.237867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1715  phenylalanine 4-monooxygenase  57.63 
 
 		 265 aa  318  7.999999999999999e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00750789  normal  0.397112 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3766  phenylalanine 4-monooxygenase  56.23 
 
 		 267 aa  317  1e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0407  phenylalanine 4-monooxygenase  59.53 
 
 		 289 aa  317  2e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000239412  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2930  phenylalanine 4-monooxygenase  55.73 
 
 		 265 aa  312  2.9999999999999996e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00742608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1041  phenylalanine 4-monooxygenase  59.52 
 
 		 265 aa  310  1e-83  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05421  phenylalanine 4-monooxygenase  55.77 
 
 		 264 aa  295  6e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001480  phenylalanine-4-hydroxylase  54.96 
 
 		 264 aa  293  3e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2700  phenylalanine 4-monooxygenase  51.37 
 
 		 272 aa  266  2e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2572  phenylalanine 4-monooxygenase  50.98 
 
 		 272 aa  265  8e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1403  phenylalanine 4-monooxygenase  43.68 
 
 		 263 aa  239  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.424182 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1507  phenylalanine 4-monooxygenase  42.91 
 
 		 263 aa  240  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0709957  normal  0.129189 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3533  phenylalanine 4-monooxygenase  46.9 
 
 		 310 aa  227  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3549  phenylalanine 4-monooxygenase  46.35 
 
 		 314 aa  225  5.0000000000000005e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.881264 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3225  phenylalanine 4-monooxygenase  46.35 
 
 		 314 aa  225  5.0000000000000005e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2208  phenylalanine 4-monooxygenase  46.43 
 
 		 293 aa  224  8e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0291015  normal  0.429407 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3259  phenylalanine 4-monooxygenase  45.15 
 
 		 306 aa  223  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3337  phenylalanine 4-monooxygenase  45.23 
 
 		 297 aa  223  3e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0011  phenylalanine 4-monooxygenase  47.84 
 
 		 336 aa  223  3e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3921  phenylalanine 4-monooxygenase  47.18 
 
 		 296 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.169368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0069  phenylalanine 4-monooxygenase  44.49 
 
 		 308 aa  221  6e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0096  phenylalanine 4-monooxygenase  46.46 
 
 		 320 aa  221  7e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3387  phenylalanine 4-monooxygenase  46.29 
 
 		 316 aa  221  8e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.752001  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3355  phenylalanine 4-monooxygenase  47.53 
 
 		 313 aa  220  9.999999999999999e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0553  phenylalanine 4-monooxygenase  48.21 
 
 		 289 aa  221  9.999999999999999e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0201466  normal  0.11263 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2977  phenylalanine 4-monooxygenase  44.73 
 
 		 320 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0078  phenylalanine 4-monooxygenase  44.73 
 
 		 320 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.227621  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1117  phenylalanine 4-monooxygenase  47.14 
 
 		 299 aa  219  5e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0078  phenylalanine 4-monooxygenase  46.02 
 
 		 324 aa  218  7e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0077  phenylalanine 4-monooxygenase  45.58 
 
 		 308 aa  215  4e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0347  phenylalanine 4-monooxygenase  47.37 
 
 		 295 aa  214  8e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.72687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2046  phenylalanine 4-monooxygenase  48.83 
 
 		 303 aa  214  9e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0739915 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0032  phenylalanine 4-monooxygenase  45.33 
 
 		 297 aa  211  7.999999999999999e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.686174  hitchhiker  0.000000292031 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0168  phenylalanine 4-monooxygenase  42.8 
 
 		 299 aa  209  3e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3187  phenylalanine 4-monooxygenase  42.55 
 
 		 312 aa  206  2e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3383  phenylalanine 4-monooxygenase  46.82 
 
 		 297 aa  205  6e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1616  phenylalanine 4-monooxygenase  46.82 
 
 		 297 aa  205  6e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4001  phenylalanine 4-monooxygenase  46.82 
 
 		 297 aa  205  6e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4075  phenylalanine 4-monooxygenase  46.82 
 
 		 297 aa  205  6e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2986  phenylalanine 4-monooxygenase  46.82 
 
 		 297 aa  205  6e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1853  phenylalanine 4-monooxygenase  44.96 
 
 		 293 aa  204  8e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.56833  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2927  phenylalanine 4-monooxygenase  46.82 
 
 		 336 aa  204  1e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0206  phenylalanine 4-monooxygenase  46.82 
 
 		 336 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03285  phenylalanine 4-monooxygenase  43.59 
 
 		 296 aa  202  6e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1267  phenylalanine 4-monooxygenase  43.4 
 
 		 296 aa  192  4e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4215  phenylalanine 4-monooxygenase  42.32 
 
 		 292 aa  191  8e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4193  phenylalanine 4-monooxygenase  44.1 
 
 		 292 aa  188  7e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2136  phenylalanine 4-monooxygenase  42.79 
 
 		 275 aa  185  8e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.636393 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4768  phenylalanine 4-monooxygenase  41.2 
 
 		 292 aa  183  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0518  phenylalanine 4-monooxygenase  42.79 
 
 		 279 aa  182  4.0000000000000006e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.261474  normal  0.0225158 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0534  phenylalanine 4-monooxygenase  42.79 
 
 		 279 aa  182  4.0000000000000006e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6319  phenylalanine-4-hydroxylase  42.15 
 
 		 261 aa  182  7e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.803918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1076  phenylalanine 4-monooxygenase  36.28 
 
 		 250 aa  171  7.999999999999999e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0135613 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2108  aromatic amino acid hydroxylase  39.01 
 
 		 244 aa  171  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0346551  normal  0.391634 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1392  phenylalanine 4-monooxygenase  41.28 
 
 		 290 aa  169  6e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00177331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3847  aromatic amino acid hydroxylase  35.43 
 
 		 247 aa  144  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0605  aromatic amino acid hydroxylase  34.88 
 
 		 243 aa  136  3.0000000000000003e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3025  phenylalanine 4-monooxygenase  32.42 
 
 		 246 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13175  predicted protein  34.38 
 
 		 391 aa  123  3e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2895  phenylalanine 4-monooxygenase  30.34 
 
 		 529 aa  119  6e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0518578  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2800  phenylalanine 4-monooxygenase  30.34 
 
 		 529 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2986  phenylalanine 4-monooxygenase  29.96 
 
 		 529 aa  117  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3717  Tyrosine 3-monooxygenase  33.33 
 
 		 296 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.337468  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3076  phenylalanine 4-monooxygenase  27.55 
 
 		 585 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4477  phenylalanine 4-monooxygenase  27.55 
 
 		 584 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0759  phenylalanine 4-monooxygenase  27.55 
 
 		 584 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1027  Tyrosine 3-monooxygenase  32.33 
 
 		 297 aa  113  3e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0491575 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4489  phenylalanine 4-monooxygenase  27.38 
 
 		 584 aa  113  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4439  phenylalanine 4-monooxygenase  27.38 
 
 		 584 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2753  phenylalanine 4-monooxygenase  29.1 
 
 		 528 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4102  phenylalanine 4-monooxygenase  27 
 
 		 584 aa  112  5e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3578  phenylalanine 4-monooxygenase  33.03 
 
 		 294 aa  112  6e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.334066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4586  phenylalanine 4-monooxygenase  27 
 
 		 584 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>