124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_13175 on replicon NC_011678
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011678  PHATRDRAFT_13175  predicted protein  100 
 
 		 391 aa  816    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3717  Tyrosine 3-monooxygenase  38.7 
 
 		 296 aa  176  4e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.337468  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5444  phenylalanine 4-monooxygenase  37.86 
 
 		 296 aa  174  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.589228  normal  0.223638 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1027  Tyrosine 3-monooxygenase  36.78 
 
 		 297 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0491575 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8337  Tyrosine 3-monooxygenase  36.82 
 
 		 297 aa  163  5.0000000000000005e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.870774 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3578  phenylalanine 4-monooxygenase  34.07 
 
 		 294 aa  158  2e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.334066  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2700  phenylalanine 4-monooxygenase  35.56 
 
 		 272 aa  142  9.999999999999999e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2572  phenylalanine 4-monooxygenase  34.47 
 
 		 272 aa  141  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02830  phenylalanine 4-monooxygenase  37.44 
 
 		 271 aa  133  3.9999999999999996e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0161825  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34650  phenylalanine 4-monooxygenase  37.05 
 
 		 261 aa  129  8.000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2595  phenylalanine 4-monooxygenase  34.38 
 
 		 263 aa  127  3e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0717257  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1076  phenylalanine 4-monooxygenase  40.11 
 
 		 250 aa  127  3e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0135613 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2930  phenylalanine 4-monooxygenase  36.61 
 
 		 265 aa  127  3e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00742608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0168  phenylalanine 4-monooxygenase  33.04 
 
 		 299 aa  127  4.0000000000000003e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1117  phenylalanine 4-monooxygenase  32.59 
 
 		 299 aa  127  4.0000000000000003e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3112  phenylalanine 4-monooxygenase  35.27 
 
 		 261 aa  124  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.417382 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3847  aromatic amino acid hydroxylase  34.41 
 
 		 247 aa  125  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4490  phenylalanine 4-monooxygenase  34.38 
 
 		 262 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1424  phenylalanine 4-monooxygenase  34.38 
 
 		 262 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.17475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2208  phenylalanine 4-monooxygenase  33.91 
 
 		 293 aa  124  4e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0291015  normal  0.429407 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1499  phenylalanine 4-monooxygenase  33.48 
 
 		 263 aa  123  5e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3779  phenylalanine 4-monooxygenase  34.38 
 
 		 262 aa  123  5e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.736945  hitchhiker  0.000564604 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3187  phenylalanine 4-monooxygenase  32.14 
 
 		 312 aa  122  9.999999999999999e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3995  phenylalanine 4-monooxygenase  33.48 
 
 		 262 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.022764 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1328  phenylalanine 4-monooxygenase  34.82 
 
 		 265 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52990  phenylalanine 4-monooxygenase  34.18 
 
 		 262 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1448  phenylalanine 4-monooxygenase  33.19 
 
 		 263 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0546255  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1435  phenylalanine 4-monooxygenase  34.38 
 
 		 277 aa  120  3e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0156707  normal  0.62095 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6319  phenylalanine-4-hydroxylase  30.13 
 
 		 261 aa  120  3.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.803918  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1822  phenylalanine-4-hydroxylase  33.33 
 
 		 265 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144628  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2136  phenylalanine 4-monooxygenase  35.87 
 
 		 275 aa  120  3.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.636393 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1386  phenylalanine 4-monooxygenase  33.78 
 
 		 266 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0032  phenylalanine 4-monooxygenase  30.59 
 
 		 297 aa  120  4.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.686174  hitchhiker  0.000000292031 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4644  phenylalanine 4-monooxygenase  33.33 
 
 		 262 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0943506  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2222  phenylalanine 4-monooxygenase  33.93 
 
 		 263 aa  119  9e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.550402  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1666  phenylalanine 4-monooxygenase  35.27 
 
 		 271 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3575  phenylalanine 4-monooxygenase  33.48 
 
 		 265 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.861489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2607  phenylalanine 4-monooxygenase  34.82 
 
 		 271 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.109404  hitchhiker  0.000000531063 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2674  phenylalanine 4-monooxygenase  34.82 
 
 		 271 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.192739  hitchhiker  0.000490875 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1484  phenylalanine 4-monooxygenase  34.82 
 
 		 266 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000194196  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2868  phenylalanine 4-monooxygenase  34.82 
 
 		 266 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.127384  hitchhiker  0.00000000657898 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3355  phenylalanine 4-monooxygenase  31.6 
 
 		 313 aa  117  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1479  phenylalanine 4-monooxygenase  34.38 
 
 		 266 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00165171  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0078  phenylalanine 4-monooxygenase  30.83 
 
 		 324 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4193  phenylalanine 4-monooxygenase  32.74 
 
 		 292 aa  117  5e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1515  phenylalanine 4-monooxygenase  34.38 
 
 		 266 aa  117  5e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.319318  normal  0.0509448 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03285  phenylalanine 4-monooxygenase  32.02 
 
 		 296 aa  116  6e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3766  phenylalanine 4-monooxygenase  28.85 
 
 		 267 aa  115  1.0000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0553  phenylalanine 4-monooxygenase  30.94 
 
 		 289 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0201466  normal  0.11263 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1853  phenylalanine 4-monooxygenase  29.66 
 
 		 293 aa  115  1.0000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.56833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0069  phenylalanine 4-monooxygenase  31.25 
 
 		 308 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2781  phenylalanine 4-monooxygenase  34.38 
 
 		 271 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.596236  hitchhiker  0.0000732891 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3225  phenylalanine 4-monooxygenase  30.43 
 
 		 314 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3549  phenylalanine 4-monooxygenase  30.43 
 
 		 314 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.881264 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4768  phenylalanine 4-monooxygenase  33.19 
 
 		 292 aa  114  4.0000000000000004e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0407  phenylalanine 4-monooxygenase  31.9 
 
 		 289 aa  114  4.0000000000000004e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000239412  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1267  phenylalanine 4-monooxygenase  33.04 
 
 		 296 aa  113  4.0000000000000004e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2046  phenylalanine 4-monooxygenase  31.19 
 
 		 303 aa  114  4.0000000000000004e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0739915 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0347  phenylalanine 4-monooxygenase  36.82 
 
 		 295 aa  113  6e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.72687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0077  phenylalanine 4-monooxygenase  30.83 
 
 		 308 aa  113  6e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2977  phenylalanine 4-monooxygenase  31.12 
 
 		 320 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0078  phenylalanine 4-monooxygenase  31.12 
 
 		 320 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.227621  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4215  phenylalanine 4-monooxygenase  33.04 
 
 		 292 aa  112  8.000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3533  phenylalanine 4-monooxygenase  29.13 
 
 		 310 aa  112  8.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001480  phenylalanine-4-hydroxylase  34.43 
 
 		 264 aa  112  8.000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3259  phenylalanine 4-monooxygenase  30.6 
 
 		 306 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3337  phenylalanine 4-monooxygenase  32.19 
 
 		 297 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0518  phenylalanine 4-monooxygenase  32.59 
 
 		 279 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.261474  normal  0.0225158 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0534  phenylalanine 4-monooxygenase  32.59 
 
 		 279 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05421  phenylalanine 4-monooxygenase  31.7 
 
 		 264 aa  112  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0096  phenylalanine 4-monooxygenase  31.12 
 
 		 320 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0605  aromatic amino acid hydroxylase  30.13 
 
 		 243 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1715  phenylalanine 4-monooxygenase  32.3 
 
 		 265 aa  110  5e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00750789  normal  0.397112 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1554  phenylalanine 4-monooxygenase  32.14 
 
 		 291 aa  108  2e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.237867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2999  phenylalanine 4-monooxygenase  28.7 
 
 		 266 aa  108  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.25361  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0011  phenylalanine 4-monooxygenase  32.9 
 
 		 336 aa  106  6e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3387  phenylalanine 4-monooxygenase  27.83 
 
 		 316 aa  104  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.752001  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3921  phenylalanine 4-monooxygenase  32.22 
 
 		 296 aa  104  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.169368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3383  phenylalanine 4-monooxygenase  31.49 
 
 		 297 aa  103  5e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1616  phenylalanine 4-monooxygenase  31.49 
 
 		 297 aa  103  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4001  phenylalanine 4-monooxygenase  31.49 
 
 		 297 aa  103  5e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4075  phenylalanine 4-monooxygenase  31.49 
 
 		 297 aa  103  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2986  phenylalanine 4-monooxygenase  31.49 
 
 		 297 aa  103  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2927  phenylalanine 4-monooxygenase  31.49 
 
 		 336 aa  103  7e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0206  phenylalanine 4-monooxygenase  31.49 
 
 		 336 aa  103  7e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1041  phenylalanine 4-monooxygenase  32.46 
 
 		 265 aa  103  7e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1507  phenylalanine 4-monooxygenase  27.2 
 
 		 263 aa  101  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0709957  normal  0.129189 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1392  phenylalanine 4-monooxygenase  29.36 
 
 		 290 aa  100  4e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00177331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1403  phenylalanine 4-monooxygenase  26.36 
 
 		 263 aa  95.5  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.424182 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2108  aromatic amino acid hydroxylase  27.56 
 
 		 244 aa  84.3  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0346551  normal  0.391634 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3025  phenylalanine 4-monooxygenase  23.85 
 
 		 246 aa  83.6  0.000000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2986  phenylalanine 4-monooxygenase  27.76 
 
 		 529 aa  79  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3273  phenylalanine 4-monooxygenase  26.94 
 
 		 599 aa  79.3  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.90398  normal  0.367732 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2895  phenylalanine 4-monooxygenase  27.76 
 
 		 529 aa  79.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0518578  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2800  phenylalanine 4-monooxygenase  27 
 
 		 529 aa  76.6  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4102  phenylalanine 4-monooxygenase  21.35 
 
 		 584 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4205  phenylalanine 4-monooxygenase  22.06 
 
 		 584 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2753  phenylalanine 4-monooxygenase  24.56 
 
 		 528 aa  73.9  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4253  phenylalanine 4-monooxygenase  21.71 
 
 		 584 aa  72.8  0.000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4438  phenylalanine 4-monooxygenase  21.71 
 
 		 584 aa  72.8  0.000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>