109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2999 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2999  phenylalanine 4-monooxygenase  100 
 
 		 266 aa  557  1e-158  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.25361  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02830  phenylalanine 4-monooxygenase  60.9 
 
 		 271 aa  350  1e-95  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0161825  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1499  phenylalanine 4-monooxygenase  61.6 
 
 		 263 aa  345  4e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2595  phenylalanine 4-monooxygenase  61.07 
 
 		 263 aa  337  9.999999999999999e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0717257  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4644  phenylalanine 4-monooxygenase  59.77 
 
 		 262 aa  335  5.999999999999999e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0943506  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3779  phenylalanine 4-monooxygenase  59 
 
 		 262 aa  334  1e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.736945  hitchhiker  0.000564604 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34650  phenylalanine 4-monooxygenase  59.46 
 
 		 261 aa  333  1e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52990  phenylalanine 4-monooxygenase  59.77 
 
 		 262 aa  333  2e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3112  phenylalanine 4-monooxygenase  59 
 
 		 261 aa  333  2e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.417382 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4490  phenylalanine 4-monooxygenase  58.62 
 
 		 262 aa  332  3e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1822  phenylalanine-4-hydroxylase  59.23 
 
 		 265 aa  332  3e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144628  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3575  phenylalanine 4-monooxygenase  60.38 
 
 		 265 aa  332  3e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.861489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1328  phenylalanine 4-monooxygenase  58.27 
 
 		 265 aa  332  3e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1424  phenylalanine 4-monooxygenase  58.62 
 
 		 262 aa  332  3e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.17475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3995  phenylalanine 4-monooxygenase  58.62 
 
 		 262 aa  331  6e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.022764 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2868  phenylalanine 4-monooxygenase  58.65 
 
 		 266 aa  331  7.000000000000001e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.127384  hitchhiker  0.00000000657898 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1435  phenylalanine 4-monooxygenase  57.89 
 
 		 277 aa  328  6e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0156707  normal  0.62095 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1479  phenylalanine 4-monooxygenase  57.89 
 
 		 266 aa  328  7e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00165171  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1484  phenylalanine 4-monooxygenase  57.89 
 
 		 266 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000194196  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1515  phenylalanine 4-monooxygenase  57.52 
 
 		 266 aa  326  2.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.319318  normal  0.0509448 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2781  phenylalanine 4-monooxygenase  56.83 
 
 		 271 aa  324  7e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.596236  hitchhiker  0.0000732891 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2222  phenylalanine 4-monooxygenase  59.54 
 
 		 263 aa  325  7e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.550402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1386  phenylalanine 4-monooxygenase  58.65 
 
 		 266 aa  324  7e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1666  phenylalanine 4-monooxygenase  57.41 
 
 		 271 aa  322  3e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2607  phenylalanine 4-monooxygenase  56.46 
 
 		 271 aa  322  5e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.109404  hitchhiker  0.000000531063 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2674  phenylalanine 4-monooxygenase  56.46 
 
 		 271 aa  321  6e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.192739  hitchhiker  0.000490875 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1715  phenylalanine 4-monooxygenase  55.26 
 
 		 265 aa  315  3e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00750789  normal  0.397112 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3766  phenylalanine 4-monooxygenase  54.89 
 
 		 267 aa  315  6e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001480  phenylalanine-4-hydroxylase  58.75 
 
 		 264 aa  313  9.999999999999999e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05421  phenylalanine 4-monooxygenase  58.75 
 
 		 264 aa  313  1.9999999999999998e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0407  phenylalanine 4-monooxygenase  57.2 
 
 		 289 aa  311  9e-84  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000239412  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1448  phenylalanine 4-monooxygenase  56.44 
 
 		 263 aa  310  1e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0546255  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2930  phenylalanine 4-monooxygenase  53.76 
 
 		 265 aa  310  2e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00742608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1041  phenylalanine 4-monooxygenase  57.65 
 
 		 265 aa  309  4e-83  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1554  phenylalanine 4-monooxygenase  53.44 
 
 		 291 aa  294  9e-79  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.237867  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2700  phenylalanine 4-monooxygenase  49.81 
 
 		 272 aa  270  2e-71  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2572  phenylalanine 4-monooxygenase  49.81 
 
 		 272 aa  268  5e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1507  phenylalanine 4-monooxygenase  45.63 
 
 		 263 aa  251  6e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0709957  normal  0.129189 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1403  phenylalanine 4-monooxygenase  44.87 
 
 		 263 aa  244  8e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.424182 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3533  phenylalanine 4-monooxygenase  47.7 
 
 		 310 aa  231  8.000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3337  phenylalanine 4-monooxygenase  47.03 
 
 		 297 aa  226  4e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3549  phenylalanine 4-monooxygenase  46.55 
 
 		 314 aa  223  2e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.881264 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3225  phenylalanine 4-monooxygenase  46.55 
 
 		 314 aa  223  2e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3355  phenylalanine 4-monooxygenase  46.67 
 
 		 313 aa  222  6e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3387  phenylalanine 4-monooxygenase  45.99 
 
 		 316 aa  221  9e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.752001  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0069  phenylalanine 4-monooxygenase  47.01 
 
 		 308 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3259  phenylalanine 4-monooxygenase  47.11 
 
 		 306 aa  216  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0168  phenylalanine 4-monooxygenase  47.39 
 
 		 299 aa  216  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0096  phenylalanine 4-monooxygenase  47.11 
 
 		 320 aa  216  4e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1117  phenylalanine 4-monooxygenase  46.15 
 
 		 299 aa  215  5.9999999999999996e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2977  phenylalanine 4-monooxygenase  47.11 
 
 		 320 aa  215  7e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0078  phenylalanine 4-monooxygenase  47.11 
 
 		 320 aa  215  7e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.227621  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0078  phenylalanine 4-monooxygenase  47.11 
 
 		 324 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0077  phenylalanine 4-monooxygenase  47.11 
 
 		 308 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3921  phenylalanine 4-monooxygenase  47.32 
 
 		 296 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.169368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0011  phenylalanine 4-monooxygenase  46.88 
 
 		 336 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2208  phenylalanine 4-monooxygenase  47.16 
 
 		 293 aa  212  3.9999999999999995e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0291015  normal  0.429407 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0553  phenylalanine 4-monooxygenase  42.86 
 
 		 289 aa  212  4.9999999999999996e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0201466  normal  0.11263 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3187  phenylalanine 4-monooxygenase  48.15 
 
 		 312 aa  206  3e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03285  phenylalanine 4-monooxygenase  43.33 
 
 		 296 aa  206  4e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0347  phenylalanine 4-monooxygenase  43.83 
 
 		 295 aa  203  2e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.72687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2046  phenylalanine 4-monooxygenase  47.89 
 
 		 303 aa  204  2e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0739915 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4768  phenylalanine 4-monooxygenase  43.7 
 
 		 292 aa  202  5e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3383  phenylalanine 4-monooxygenase  47.09 
 
 		 297 aa  202  6e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1616  phenylalanine 4-monooxygenase  47.09 
 
 		 297 aa  202  6e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4001  phenylalanine 4-monooxygenase  47.09 
 
 		 297 aa  202  6e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4075  phenylalanine 4-monooxygenase  47.09 
 
 		 297 aa  202  6e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2986  phenylalanine 4-monooxygenase  47.09 
 
 		 297 aa  202  6e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2927  phenylalanine 4-monooxygenase  47.09 
 
 		 336 aa  201  7e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4215  phenylalanine 4-monooxygenase  44.21 
 
 		 292 aa  201  9.999999999999999e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0206  phenylalanine 4-monooxygenase  46.64 
 
 		 336 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1853  phenylalanine 4-monooxygenase  45.18 
 
 		 293 aa  200  1.9999999999999998e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.56833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0032  phenylalanine 4-monooxygenase  42.11 
 
 		 297 aa  200  1.9999999999999998e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.686174  hitchhiker  0.000000292031 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2136  phenylalanine 4-monooxygenase  42.02 
 
 		 275 aa  199  6e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.636393 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1267  phenylalanine 4-monooxygenase  43.29 
 
 		 296 aa  194  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0518  phenylalanine 4-monooxygenase  42.19 
 
 		 279 aa  191  1e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.261474  normal  0.0225158 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0534  phenylalanine 4-monooxygenase  42.19 
 
 		 279 aa  191  1e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4193  phenylalanine 4-monooxygenase  40.93 
 
 		 292 aa  190  2.9999999999999997e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6319  phenylalanine-4-hydroxylase  38.1 
 
 		 261 aa  166  2.9999999999999998e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.803918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1392  phenylalanine 4-monooxygenase  42.52 
 
 		 290 aa  165  6.9999999999999995e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00177331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2108  aromatic amino acid hydroxylase  37.97 
 
 		 244 aa  165  6.9999999999999995e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0346551  normal  0.391634 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1076  phenylalanine 4-monooxygenase  32.72 
 
 		 250 aa  152  5.9999999999999996e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0135613 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3025  phenylalanine 4-monooxygenase  33.48 
 
 		 246 aa  146  4.0000000000000006e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3578  phenylalanine 4-monooxygenase  34.25 
 
 		 294 aa  129  5.0000000000000004e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.334066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5444  phenylalanine 4-monooxygenase  31.98 
 
 		 296 aa  124  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.589228  normal  0.223638 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0605  aromatic amino acid hydroxylase  32.11 
 
 		 243 aa  123  3e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3847  aromatic amino acid hydroxylase  33.33 
 
 		 247 aa  122  6e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4477  phenylalanine 4-monooxygenase  27.36 
 
 		 584 aa  116  5e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0759  phenylalanine 4-monooxygenase  27.36 
 
 		 584 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4439  phenylalanine 4-monooxygenase  26.71 
 
 		 584 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3076  phenylalanine 4-monooxygenase  27.67 
 
 		 585 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4102  phenylalanine 4-monooxygenase  26.38 
 
 		 584 aa  113  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4489  phenylalanine 4-monooxygenase  26.71 
 
 		 584 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4091  phenylalanine 4-monooxygenase  25.8 
 
 		 584 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4253  phenylalanine 4-monooxygenase  26.38 
 
 		 584 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4586  phenylalanine 4-monooxygenase  26.38 
 
 		 584 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4438  phenylalanine 4-monooxygenase  26.38 
 
 		 584 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3717  Tyrosine 3-monooxygenase  30.36 
 
 		 296 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.337468  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4205  phenylalanine 4-monooxygenase  26.03 
 
 		 584 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13175  predicted protein  28.7 
 
 		 391 aa  108  1e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>