109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3112 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3112  phenylalanine 4-monooxygenase  100 
 
 		 261 aa  536  1e-151  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.417382 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4644  phenylalanine 4-monooxygenase  87.36 
 
 		 262 aa  484  1e-136  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0943506  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52990  phenylalanine 4-monooxygenase  87.74 
 
 		 262 aa  483  1e-135  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4490  phenylalanine 4-monooxygenase  85.06 
 
 		 262 aa  475  1e-133  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1499  phenylalanine 4-monooxygenase  86.87 
 
 		 263 aa  476  1e-133  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1424  phenylalanine 4-monooxygenase  85.06 
 
 		 262 aa  475  1e-133  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.17475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3995  phenylalanine 4-monooxygenase  83.91 
 
 		 262 aa  471  1e-132  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.022764 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3779  phenylalanine 4-monooxygenase  83.91 
 
 		 262 aa  467  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.736945  hitchhiker  0.000564604 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1822  phenylalanine-4-hydroxylase  81.92 
 
 		 265 aa  456  1e-127  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144628  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34650  phenylalanine 4-monooxygenase  82.38 
 
 		 261 aa  452  1.0000000000000001e-126  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3575  phenylalanine 4-monooxygenase  81.47 
 
 		 265 aa  449  1e-125  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.861489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1479  phenylalanine 4-monooxygenase  64.75 
 
 		 266 aa  350  1e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00165171  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1484  phenylalanine 4-monooxygenase  64.75 
 
 		 266 aa  350  2e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000194196  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1515  phenylalanine 4-monooxygenase  64.75 
 
 		 266 aa  349  2e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.319318  normal  0.0509448 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2868  phenylalanine 4-monooxygenase  65.13 
 
 		 266 aa  350  2e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.127384  hitchhiker  0.00000000657898 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02830  phenylalanine 4-monooxygenase  63.71 
 
 		 271 aa  349  3e-95  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0161825  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2674  phenylalanine 4-monooxygenase  64.09 
 
 		 271 aa  346  3e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.192739  hitchhiker  0.000490875 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2222  phenylalanine 4-monooxygenase  64.48 
 
 		 263 aa  345  6e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.550402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2607  phenylalanine 4-monooxygenase  63.32 
 
 		 271 aa  344  8e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.109404  hitchhiker  0.000000531063 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2781  phenylalanine 4-monooxygenase  63.71 
 
 		 271 aa  344  8.999999999999999e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.596236  hitchhiker  0.0000732891 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1666  phenylalanine 4-monooxygenase  63.85 
 
 		 271 aa  344  1e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1328  phenylalanine 4-monooxygenase  62.02 
 
 		 265 aa  336  1.9999999999999998e-91  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1386  phenylalanine 4-monooxygenase  61.3 
 
 		 266 aa  336  1.9999999999999998e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1435  phenylalanine 4-monooxygenase  61.15 
 
 		 277 aa  335  3.9999999999999995e-91  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0156707  normal  0.62095 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2999  phenylalanine 4-monooxygenase  59 
 
 		 266 aa  333  2e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.25361  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1448  phenylalanine 4-monooxygenase  59.77 
 
 		 263 aa  332  3e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0546255  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3766  phenylalanine 4-monooxygenase  57.95 
 
 		 267 aa  324  1e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2595  phenylalanine 4-monooxygenase  59.3 
 
 		 263 aa  321  7e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0717257  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1554  phenylalanine 4-monooxygenase  57.47 
 
 		 291 aa  321  8e-87  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.237867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0407  phenylalanine 4-monooxygenase  59.92 
 
 		 289 aa  320  9.999999999999999e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000239412  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2930  phenylalanine 4-monooxygenase  56.92 
 
 		 265 aa  319  3e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00742608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1041  phenylalanine 4-monooxygenase  59.52 
 
 		 265 aa  318  7.999999999999999e-86  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1715  phenylalanine 4-monooxygenase  56.92 
 
 		 265 aa  315  6e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00750789  normal  0.397112 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05421  phenylalanine 4-monooxygenase  54.09 
 
 		 264 aa  286  2e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001480  phenylalanine-4-hydroxylase  54.09 
 
 		 264 aa  285  4e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2700  phenylalanine 4-monooxygenase  50.2 
 
 		 272 aa  263  2e-69  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2572  phenylalanine 4-monooxygenase  49.8 
 
 		 272 aa  261  6e-69  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1507  phenylalanine 4-monooxygenase  44.44 
 
 		 263 aa  246  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0709957  normal  0.129189 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1403  phenylalanine 4-monooxygenase  44.83 
 
 		 263 aa  243  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.424182 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3533  phenylalanine 4-monooxygenase  47.14 
 
 		 310 aa  229  4e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2208  phenylalanine 4-monooxygenase  49.57 
 
 		 293 aa  227  1e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0291015  normal  0.429407 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3337  phenylalanine 4-monooxygenase  45.87 
 
 		 297 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3355  phenylalanine 4-monooxygenase  48.02 
 
 		 313 aa  225  6e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3549  phenylalanine 4-monooxygenase  45.65 
 
 		 314 aa  224  8e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.881264 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3225  phenylalanine 4-monooxygenase  45.65 
 
 		 314 aa  224  8e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0347  phenylalanine 4-monooxygenase  48.74 
 
 		 295 aa  223  3e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.72687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3259  phenylalanine 4-monooxygenase  45.3 
 
 		 306 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0069  phenylalanine 4-monooxygenase  43.78 
 
 		 308 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0011  phenylalanine 4-monooxygenase  46.96 
 
 		 336 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2977  phenylalanine 4-monooxygenase  44.87 
 
 		 320 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0078  phenylalanine 4-monooxygenase  44.87 
 
 		 320 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.227621  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0096  phenylalanine 4-monooxygenase  44.87 
 
 		 320 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3921  phenylalanine 4-monooxygenase  46.55 
 
 		 296 aa  217  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.169368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0078  phenylalanine 4-monooxygenase  44.83 
 
 		 324 aa  215  5e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0077  phenylalanine 4-monooxygenase  42.97 
 
 		 308 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3387  phenylalanine 4-monooxygenase  44.54 
 
 		 316 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.752001  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0032  phenylalanine 4-monooxygenase  44.17 
 
 		 297 aa  214  9.999999999999999e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.686174  hitchhiker  0.000000292031 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2927  phenylalanine 4-monooxygenase  48.18 
 
 		 336 aa  209  2e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0206  phenylalanine 4-monooxygenase  48.18 
 
 		 336 aa  210  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1117  phenylalanine 4-monooxygenase  44.4 
 
 		 299 aa  210  2e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3383  phenylalanine 4-monooxygenase  48.18 
 
 		 297 aa  210  2e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1616  phenylalanine 4-monooxygenase  48.18 
 
 		 297 aa  210  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4001  phenylalanine 4-monooxygenase  48.18 
 
 		 297 aa  210  2e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4075  phenylalanine 4-monooxygenase  48.18 
 
 		 297 aa  210  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2986  phenylalanine 4-monooxygenase  48.18 
 
 		 297 aa  210  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03285  phenylalanine 4-monooxygenase  45.54 
 
 		 296 aa  207  1e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0168  phenylalanine 4-monooxygenase  42.21 
 
 		 299 aa  207  2e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2046  phenylalanine 4-monooxygenase  46.73 
 
 		 303 aa  207  2e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0739915 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0553  phenylalanine 4-monooxygenase  46.73 
 
 		 289 aa  206  3e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0201466  normal  0.11263 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1853  phenylalanine 4-monooxygenase  45.29 
 
 		 293 aa  202  3e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.56833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3187  phenylalanine 4-monooxygenase  41.28 
 
 		 312 aa  196  3e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4215  phenylalanine 4-monooxygenase  43.78 
 
 		 292 aa  190  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1267  phenylalanine 4-monooxygenase  44.54 
 
 		 296 aa  190  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4768  phenylalanine 4-monooxygenase  43.97 
 
 		 292 aa  189  5.999999999999999e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2136  phenylalanine 4-monooxygenase  44.98 
 
 		 275 aa  187  1e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.636393 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4193  phenylalanine 4-monooxygenase  44.3 
 
 		 292 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0518  phenylalanine 4-monooxygenase  44.98 
 
 		 279 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.261474  normal  0.0225158 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0534  phenylalanine 4-monooxygenase  44.98 
 
 		 279 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6319  phenylalanine-4-hydroxylase  42.79 
 
 		 261 aa  181  8.000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.803918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2108  aromatic amino acid hydroxylase  42.2 
 
 		 244 aa  180  2e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0346551  normal  0.391634 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1076  phenylalanine 4-monooxygenase  35.87 
 
 		 250 aa  174  9.999999999999999e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0135613 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1392  phenylalanine 4-monooxygenase  40.53 
 
 		 290 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00177331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3025  phenylalanine 4-monooxygenase  33.33 
 
 		 246 aa  135  7.000000000000001e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3847  aromatic amino acid hydroxylase  34.08 
 
 		 247 aa  132  5e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0605  aromatic amino acid hydroxylase  33.95 
 
 		 243 aa  132  7.999999999999999e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4253  phenylalanine 4-monooxygenase  28.52 
 
 		 584 aa  124  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4091  phenylalanine 4-monooxygenase  28.52 
 
 		 584 aa  124  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4102  phenylalanine 4-monooxygenase  28.52 
 
 		 584 aa  125  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4586  phenylalanine 4-monooxygenase  28.52 
 
 		 584 aa  124  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13175  predicted protein  35.27 
 
 		 391 aa  124  1e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4438  phenylalanine 4-monooxygenase  28.52 
 
 		 584 aa  124  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3076  phenylalanine 4-monooxygenase  28.14 
 
 		 585 aa  124  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4439  phenylalanine 4-monooxygenase  27.76 
 
 		 584 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2800  phenylalanine 4-monooxygenase  31.8 
 
 		 529 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4489  phenylalanine 4-monooxygenase  27.76 
 
 		 584 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2895  phenylalanine 4-monooxygenase  31.8 
 
 		 529 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0518578  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2986  phenylalanine 4-monooxygenase  31.42 
 
 		 529 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4477  phenylalanine 4-monooxygenase  27.38 
 
 		 584 aa  120  3e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0759  phenylalanine 4-monooxygenase  27.38 
 
 		 584 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4205  phenylalanine 4-monooxygenase  27.38 
 
 		 584 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>