109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1328 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1328  phenylalanine 4-monooxygenase  100 
 
 		 265 aa  553  1e-156  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2595  phenylalanine 4-monooxygenase  82.82 
 
 		 263 aa  463  1e-129  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0717257  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1484  phenylalanine 4-monooxygenase  79.32 
 
 		 266 aa  442  1e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000194196  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1479  phenylalanine 4-monooxygenase  78.95 
 
 		 266 aa  441  1e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00165171  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1515  phenylalanine 4-monooxygenase  78.95 
 
 		 266 aa  440  1e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.319318  normal  0.0509448 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2868  phenylalanine 4-monooxygenase  78.95 
 
 		 266 aa  441  1e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.127384  hitchhiker  0.00000000657898 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2607  phenylalanine 4-monooxygenase  77.31 
 
 		 271 aa  427  1e-119  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.109404  hitchhiker  0.000000531063 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1666  phenylalanine 4-monooxygenase  77.31 
 
 		 271 aa  426  1e-118  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2674  phenylalanine 4-monooxygenase  75.19 
 
 		 271 aa  424  1e-118  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.192739  hitchhiker  0.000490875 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1386  phenylalanine 4-monooxygenase  76.32 
 
 		 266 aa  425  1e-118  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2781  phenylalanine 4-monooxygenase  76.54 
 
 		 271 aa  421  1e-117  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.596236  hitchhiker  0.0000732891 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2222  phenylalanine 4-monooxygenase  72.41 
 
 		 263 aa  419  1e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.550402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1435  phenylalanine 4-monooxygenase  74.34 
 
 		 277 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0156707  normal  0.62095 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1715  phenylalanine 4-monooxygenase  71.32 
 
 		 265 aa  414  9.999999999999999e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00750789  normal  0.397112 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2930  phenylalanine 4-monooxygenase  71.32 
 
 		 265 aa  409  1e-113  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00742608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1448  phenylalanine 4-monooxygenase  69.85 
 
 		 263 aa  402  1e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0546255  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02830  phenylalanine 4-monooxygenase  65.04 
 
 		 271 aa  374  1e-103  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0161825  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1041  phenylalanine 4-monooxygenase  64.48 
 
 		 265 aa  359  3e-98  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1499  phenylalanine 4-monooxygenase  63.22 
 
 		 263 aa  348  5e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4490  phenylalanine 4-monooxygenase  63.08 
 
 		 262 aa  345  6e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1424  phenylalanine 4-monooxygenase  63.08 
 
 		 262 aa  345  6e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.17475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1554  phenylalanine 4-monooxygenase  61.72 
 
 		 291 aa  343  2e-93  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.237867  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34650  phenylalanine 4-monooxygenase  62.31 
 
 		 261 aa  342  2.9999999999999997e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3575  phenylalanine 4-monooxygenase  61.92 
 
 		 265 aa  342  4e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.861489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3779  phenylalanine 4-monooxygenase  62.31 
 
 		 262 aa  342  4e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.736945  hitchhiker  0.000564604 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3995  phenylalanine 4-monooxygenase  61.54 
 
 		 262 aa  337  8e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.022764 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3112  phenylalanine 4-monooxygenase  62.02 
 
 		 261 aa  336  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.417382 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3766  phenylalanine 4-monooxygenase  59.48 
 
 		 267 aa  333  1e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4644  phenylalanine 4-monooxygenase  60.92 
 
 		 262 aa  333  2e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0943506  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2999  phenylalanine 4-monooxygenase  58.27 
 
 		 266 aa  332  3e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.25361  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52990  phenylalanine 4-monooxygenase  60.92 
 
 		 262 aa  332  3e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1822  phenylalanine-4-hydroxylase  60 
 
 		 265 aa  329  3e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144628  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0407  phenylalanine 4-monooxygenase  56.59 
 
 		 289 aa  315  5e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000239412  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001480  phenylalanine-4-hydroxylase  55.56 
 
 		 264 aa  305  4.0000000000000004e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05421  phenylalanine 4-monooxygenase  55.56 
 
 		 264 aa  303  2.0000000000000002e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2700  phenylalanine 4-monooxygenase  50.58 
 
 		 272 aa  267  1e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2572  phenylalanine 4-monooxygenase  50.19 
 
 		 272 aa  265  5.999999999999999e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1507  phenylalanine 4-monooxygenase  44.87 
 
 		 263 aa  249  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0709957  normal  0.129189 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1403  phenylalanine 4-monooxygenase  44.11 
 
 		 263 aa  243  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.424182 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3337  phenylalanine 4-monooxygenase  44.84 
 
 		 297 aa  227  2e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3533  phenylalanine 4-monooxygenase  45.53 
 
 		 310 aa  223  3e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2208  phenylalanine 4-monooxygenase  48.37 
 
 		 293 aa  223  3e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0291015  normal  0.429407 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0168  phenylalanine 4-monooxygenase  45.15 
 
 		 299 aa  218  1e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3259  phenylalanine 4-monooxygenase  42.8 
 
 		 306 aa  216  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2046  phenylalanine 4-monooxygenase  46.94 
 
 		 303 aa  216  2e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0739915 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3355  phenylalanine 4-monooxygenase  47.58 
 
 		 313 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0096  phenylalanine 4-monooxygenase  44.49 
 
 		 320 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2977  phenylalanine 4-monooxygenase  44.49 
 
 		 320 aa  216  4e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0078  phenylalanine 4-monooxygenase  44.49 
 
 		 320 aa  216  4e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.227621  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3549  phenylalanine 4-monooxygenase  46.26 
 
 		 314 aa  214  8e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.881264 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3225  phenylalanine 4-monooxygenase  46.26 
 
 		 314 aa  214  8e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0069  phenylalanine 4-monooxygenase  45.49 
 
 		 308 aa  214  9e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1117  phenylalanine 4-monooxygenase  43.85 
 
 		 299 aa  214  9.999999999999999e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0078  phenylalanine 4-monooxygenase  43.98 
 
 		 324 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3921  phenylalanine 4-monooxygenase  45.02 
 
 		 296 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.169368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3387  phenylalanine 4-monooxygenase  45.26 
 
 		 316 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.752001  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0011  phenylalanine 4-monooxygenase  43.73 
 
 		 336 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0077  phenylalanine 4-monooxygenase  44.64 
 
 		 308 aa  210  2e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0553  phenylalanine 4-monooxygenase  45.33 
 
 		 289 aa  206  3e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0201466  normal  0.11263 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3383  phenylalanine 4-monooxygenase  46.35 
 
 		 297 aa  206  3e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1616  phenylalanine 4-monooxygenase  46.35 
 
 		 297 aa  206  3e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4001  phenylalanine 4-monooxygenase  46.35 
 
 		 297 aa  206  3e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4075  phenylalanine 4-monooxygenase  46.35 
 
 		 297 aa  206  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2986  phenylalanine 4-monooxygenase  46.35 
 
 		 297 aa  206  3e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4193  phenylalanine 4-monooxygenase  46.09 
 
 		 292 aa  206  4e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0206  phenylalanine 4-monooxygenase  46.35 
 
 		 336 aa  206  5e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2927  phenylalanine 4-monooxygenase  46.35 
 
 		 336 aa  205  6e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0347  phenylalanine 4-monooxygenase  45.8 
 
 		 295 aa  205  6e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.72687  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4768  phenylalanine 4-monooxygenase  45.73 
 
 		 292 aa  203  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0518  phenylalanine 4-monooxygenase  43.25 
 
 		 279 aa  198  6e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.261474  normal  0.0225158 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0534  phenylalanine 4-monooxygenase  43.25 
 
 		 279 aa  198  6e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0032  phenylalanine 4-monooxygenase  42.04 
 
 		 297 aa  198  9e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.686174  hitchhiker  0.000000292031 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1267  phenylalanine 4-monooxygenase  44.54 
 
 		 296 aa  197  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03285  phenylalanine 4-monooxygenase  41.76 
 
 		 296 aa  197  2.0000000000000003e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6319  phenylalanine-4-hydroxylase  43.95 
 
 		 261 aa  197  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.803918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2136  phenylalanine 4-monooxygenase  47.01 
 
 		 275 aa  196  5.000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.636393 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3187  phenylalanine 4-monooxygenase  45.02 
 
 		 312 aa  194  1e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4215  phenylalanine 4-monooxygenase  43.93 
 
 		 292 aa  193  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2108  aromatic amino acid hydroxylase  41.96 
 
 		 244 aa  184  9e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0346551  normal  0.391634 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1853  phenylalanine 4-monooxygenase  42.54 
 
 		 293 aa  181  1e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.56833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1392  phenylalanine 4-monooxygenase  39.76 
 
 		 290 aa  169  4e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00177331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1076  phenylalanine 4-monooxygenase  34.07 
 
 		 250 aa  157  1e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0135613 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0605  aromatic amino acid hydroxylase  32.73 
 
 		 243 aa  142  4e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3847  aromatic amino acid hydroxylase  33.94 
 
 		 247 aa  140  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3025  phenylalanine 4-monooxygenase  32.16 
 
 		 246 aa  138  1e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3076  phenylalanine 4-monooxygenase  29.32 
 
 		 585 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4439  phenylalanine 4-monooxygenase  28.57 
 
 		 584 aa  126  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4489  phenylalanine 4-monooxygenase  28.57 
 
 		 584 aa  126  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4102  phenylalanine 4-monooxygenase  28.2 
 
 		 584 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4477  phenylalanine 4-monooxygenase  28.2 
 
 		 584 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4253  phenylalanine 4-monooxygenase  28.2 
 
 		 584 aa  124  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4091  phenylalanine 4-monooxygenase  28.2 
 
 		 584 aa  124  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4586  phenylalanine 4-monooxygenase  28.2 
 
 		 584 aa  124  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0759  phenylalanine 4-monooxygenase  28.2 
 
 		 584 aa  124  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4438  phenylalanine 4-monooxygenase  28.2 
 
 		 584 aa  124  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2800  phenylalanine 4-monooxygenase  30 
 
 		 529 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2753  phenylalanine 4-monooxygenase  29.96 
 
 		 528 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2895  phenylalanine 4-monooxygenase  30 
 
 		 529 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0518578  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13175  predicted protein  34.82 
 
 		 391 aa  121  9.999999999999999e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2986  phenylalanine 4-monooxygenase  30 
 
 		 529 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>