26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2238 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_2238  hypothetical protein  100 
 
 		 352 aa  710    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.050189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2387  hypothetical protein  63.74 
 
 		 353 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4265  hypothetical protein  49.07 
 
 		 360 aa  305  5.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0068  hypothetical protein  47.53 
 
 		 374 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0087  hypothetical protein  48.92 
 
 		 360 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0090  hypothetical protein  48.76 
 
 		 360 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0084  hypothetical protein  48.92 
 
 		 360 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0075  hypothetical protein  48.92 
 
 		 354 aa  295  6e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2007  hypothetical protein  47.95 
 
 		 359 aa  288  8e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.215237  normal  0.122982 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3967  hypothetical protein  47.99 
 
 		 341 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4181  hypothetical protein  45.54 
 
 		 317 aa  260  2e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2190  hypothetical protein  42.53 
 
 		 340 aa  228  1e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.323373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2267  hypothetical protein  42.76 
 
 		 340 aa  226  3e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2702  hypothetical protein  37.04 
 
 		 373 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2400  hypothetical protein  41.29 
 
 		 340 aa  196  3e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.607127 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02654  hypothetical protein  35.24 
 
 		 347 aa  153  4e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.909457  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2207  hypothetical protein  50.79 
 
 		 137 aa  65.5  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2532  hypothetical protein  31.32 
 
 		 693 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1300  hypothetical protein  31.32 
 
 		 469 aa  50.4  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1015  hypothetical protein  31.32 
 
 		 492 aa  50.4  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0328139  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1466  hypothetical protein  30.61 
 
 		 377 aa  50.1  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2205  hypothetical protein  52.08 
 
 		 49 aa  49.7  0.00008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1277  hypothetical protein  31.32 
 
 		 339 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.273168  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1355  hypothetical protein  31.32 
 
 		 336 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.648024  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0551  hypothetical protein  31.32 
 
 		 336 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0932093  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0280  hypothetical protein  31.32 
 
 		 340 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.346548  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>