25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_2267 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_2190  hypothetical protein  99.12 
 
 
340 aa  689    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.323373  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2267  hypothetical protein  100 
 
 
340 aa  696    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2400  hypothetical protein  93.53 
 
 
340 aa  594  1e-169  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.607127 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0075  hypothetical protein  44.07 
 
 
354 aa  249  7e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0068  hypothetical protein  42.72 
 
 
374 aa  237  2e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2387  hypothetical protein  42.4 
 
 
353 aa  233  3e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4265  hypothetical protein  41.8 
 
 
360 aa  230  2e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0087  hypothetical protein  41.61 
 
 
360 aa  230  2e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0090  hypothetical protein  41.61 
 
 
360 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0084  hypothetical protein  41.61 
 
 
360 aa  230  3e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2238  hypothetical protein  43.06 
 
 
352 aa  226  4e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.050189  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2007  hypothetical protein  41.39 
 
 
359 aa  225  7e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.215237  normal  0.122982 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2702  hypothetical protein  38.71 
 
 
373 aa  222  7e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3967  hypothetical protein  40.24 
 
 
341 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4181  hypothetical protein  41.5 
 
 
317 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02654  hypothetical protein  38.98 
 
 
347 aa  177  2e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.909457  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2207  hypothetical protein  60.48 
 
 
137 aa  160  3e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2205  hypothetical protein  80.85 
 
 
49 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2532  hypothetical protein  27.52 
 
 
693 aa  47.4  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1015  hypothetical protein  27.52 
 
 
492 aa  46.2  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0328139  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1300  hypothetical protein  27.52 
 
 
469 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0280  hypothetical protein  27.52 
 
 
340 aa  44.3  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.346548  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0551  hypothetical protein  27.52 
 
 
336 aa  44.7  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0932093  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1355  hypothetical protein  27.52 
 
 
336 aa  44.3  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.648024  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1277  hypothetical protein  27.52 
 
 
339 aa  44.3  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.273168  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>