25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_2400 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_2190  hypothetical protein  93.82 
 
 
340 aa  643    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.323373  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2267  hypothetical protein  93.53 
 
 
340 aa  641    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2400  hypothetical protein  100 
 
 
340 aa  699    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.607127 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0068  hypothetical protein  44.89 
 
 
374 aa  239  4e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2387  hypothetical protein  40.29 
 
 
353 aa  238  1e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0075  hypothetical protein  42.6 
 
 
354 aa  236  3e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0087  hypothetical protein  40.52 
 
 
360 aa  236  4e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0084  hypothetical protein  40.52 
 
 
360 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0090  hypothetical protein  42.19 
 
 
360 aa  236  6e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4265  hypothetical protein  40.52 
 
 
360 aa  235  7e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2007  hypothetical protein  41.99 
 
 
359 aa  226  6e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.215237  normal  0.122982 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2238  hypothetical protein  41.55 
 
 
352 aa  223  2e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.050189  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2702  hypothetical protein  36.99 
 
 
373 aa  223  3e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4181  hypothetical protein  38.53 
 
 
317 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3967  hypothetical protein  42.07 
 
 
341 aa  196  6e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02654  hypothetical protein  37.5 
 
 
347 aa  172  1e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.909457  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2207  hypothetical protein  61.29 
 
 
137 aa  158  1e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2205  hypothetical protein  78.72 
 
 
49 aa  77  0.0000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2532  hypothetical protein  25.93 
 
 
693 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1015  hypothetical protein  25.93 
 
 
492 aa  47.8  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0328139  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1300  hypothetical protein  25.93 
 
 
469 aa  47.4  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0280  hypothetical protein  25.93 
 
 
340 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.346548  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0551  hypothetical protein  25.93 
 
 
336 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0932093  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1277  hypothetical protein  25.93 
 
 
339 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.273168  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1355  hypothetical protein  25.93 
 
 
336 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.648024  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>