18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_4181 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_4181  hypothetical protein  100 
 
 
317 aa  639    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0068  hypothetical protein  43.65 
 
 
374 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0090  hypothetical protein  43.9 
 
 
360 aa  269  4e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0084  hypothetical protein  43.9 
 
 
360 aa  269  5e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4265  hypothetical protein  42.73 
 
 
360 aa  269  5e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0087  hypothetical protein  43.9 
 
 
360 aa  269  5.9999999999999995e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0075  hypothetical protein  43.66 
 
 
354 aa  257  2e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2387  hypothetical protein  44.82 
 
 
353 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2238  hypothetical protein  45.54 
 
 
352 aa  251  1e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.050189  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2007  hypothetical protein  39.6 
 
 
359 aa  227  2e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.215237  normal  0.122982 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3967  hypothetical protein  41.09 
 
 
341 aa  212  5.999999999999999e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2267  hypothetical protein  41.5 
 
 
340 aa  191  2e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2190  hypothetical protein  41.5 
 
 
340 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.323373  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2702  hypothetical protein  34.68 
 
 
373 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2400  hypothetical protein  39.02 
 
 
340 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.607127 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02654  hypothetical protein  32.52 
 
 
347 aa  146  4.0000000000000006e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.909457  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2207  hypothetical protein  47.69 
 
 
137 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1466  hypothetical protein  26.67 
 
 
377 aa  43.1  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>