26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2007 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_2007  hypothetical protein  100 
 
 		 359 aa  733    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.215237  normal  0.122982 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4265  hypothetical protein  48 
 
 		 360 aa  317  2e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0087  hypothetical protein  47.85 
 
 		 360 aa  316  3e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0084  hypothetical protein  47.85 
 
 		 360 aa  317  3e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0090  hypothetical protein  48.29 
 
 		 360 aa  316  4e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0068  hypothetical protein  48.4 
 
 		 374 aa  312  5.999999999999999e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2238  hypothetical protein  50.29 
 
 		 352 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.050189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2387  hypothetical protein  47.04 
 
 		 353 aa  295  9e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0075  hypothetical protein  45.38 
 
 		 354 aa  281  9e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3967  hypothetical protein  45.09 
 
 		 341 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4181  hypothetical protein  40.17 
 
 		 317 aa  245  9e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2190  hypothetical protein  41.09 
 
 		 340 aa  238  1e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.323373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2267  hypothetical protein  41.09 
 
 		 340 aa  237  3e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2702  hypothetical protein  39.45 
 
 		 373 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2400  hypothetical protein  41.69 
 
 		 340 aa  205  1e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.607127 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02654  hypothetical protein  33.62 
 
 		 347 aa  155  1e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.909457  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2207  hypothetical protein  38.35 
 
 		 137 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1466  hypothetical protein  25.69 
 
 		 377 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2532  hypothetical protein  27.36 
 
 		 693 aa  54.7  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1015  hypothetical protein  27.36 
 
 		 492 aa  54.3  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0328139  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1300  hypothetical protein  27.36 
 
 		 469 aa  54.3  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1277  hypothetical protein  27.36 
 
 		 339 aa  50.4  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.273168  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0551  hypothetical protein  27.36 
 
 		 336 aa  50.1  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0932093  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1355  hypothetical protein  27.36 
 
 		 336 aa  50.1  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.648024  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0280  hypothetical protein  27.36 
 
 		 340 aa  50.1  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.346548  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2205  hypothetical protein  55.56 
 
 		 49 aa  48.5  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>