26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2387 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_2387  hypothetical protein  100 
 
 
353 aa  709    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2238  hypothetical protein  63.56 
 
 
352 aa  444  1e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.050189  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0090  hypothetical protein  44.63 
 
 
360 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0068  hypothetical protein  47.48 
 
 
374 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4265  hypothetical protein  46.22 
 
 
360 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0087  hypothetical protein  45.92 
 
 
360 aa  312  5.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0084  hypothetical protein  45.92 
 
 
360 aa  312  6.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0075  hypothetical protein  49.69 
 
 
354 aa  292  7e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2007  hypothetical protein  47.34 
 
 
359 aa  280  4e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.215237  normal  0.122982 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4181  hypothetical protein  43.9 
 
 
317 aa  263  4e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3967  hypothetical protein  44.87 
 
 
341 aa  258  1e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2267  hypothetical protein  42.67 
 
 
340 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2190  hypothetical protein  42.58 
 
 
340 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.323373  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2400  hypothetical protein  40.64 
 
 
340 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.607127 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2702  hypothetical protein  37.57 
 
 
373 aa  216  5e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02654  hypothetical protein  31.34 
 
 
347 aa  150  5e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.909457  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2207  hypothetical protein  39.13 
 
 
137 aa  62  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2532  hypothetical protein  30.1 
 
 
693 aa  57  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1015  hypothetical protein  30.1 
 
 
492 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0328139  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1300  hypothetical protein  29.61 
 
 
469 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1277  hypothetical protein  30.1 
 
 
339 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.273168  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0280  hypothetical protein  30.1 
 
 
340 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.346548  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1355  hypothetical protein  30.1 
 
 
336 aa  55.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.648024  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0551  hypothetical protein  30.1 
 
 
336 aa  55.1  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0932093  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1466  hypothetical protein  30 
 
 
377 aa  52.4  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2205  hypothetical protein  51.06 
 
 
49 aa  44.3  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>