136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1943 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_1943  transposase  100 
 
 		 131 aa  264  2.9999999999999995e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4087  transposase IS4 family protein  53.98 
 
 		 369 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3394  transposase IS4 family protein  53.98 
 
 		 369 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.750621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3606  transposase IS4 family protein  53.98 
 
 		 369 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3866  transposase IS4 family protein  53.98 
 
 		 369 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000448202 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3592  transposase IS4 family protein  53.98 
 
 		 369 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3256  transposase IS4 family protein  53.98 
 
 		 369 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0156341 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4106  transposase IS4 family protein  53.98 
 
 		 369 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0296  transposase IS4 family protein  53.98 
 
 		 369 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0443  transposase IS4 family protein  53.98 
 
 		 369 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0564  transposase IS4 family protein  53.98 
 
 		 369 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.561014  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0569  transposase IS4 family protein  53.98 
 
 		 369 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.228181  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0572  transposase IS4 family protein  53.98 
 
 		 369 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0589  transposase IS4 family protein  53.98 
 
 		 369 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.900163 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4172  transposase IS4 family protein  53.98 
 
 		 369 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0597  transposase IS4 family protein  53.98 
 
 		 369 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.818291 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4396  transposase IS4 family protein  53.98 
 
 		 369 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000348998  normal  0.0139807 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0098  transposase IS4 family protein  53.98 
 
 		 369 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0101  transposase IS4 family protein  53.98 
 
 		 369 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0170  transposase IS4 family protein  53.98 
 
 		 369 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0172  transposase IS4 family protein  53.98 
 
 		 369 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0548  transposase IS4 family protein  53.98 
 
 		 369 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0595  transposase IS4 family protein  53.98 
 
 		 369 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0603  transposase IS4 family protein  53.98 
 
 		 369 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0630  transposase IS4 family protein  53.98 
 
 		 369 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0643  transposase IS4 family protein  53.98 
 
 		 369 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0766  transposase IS4 family protein  53.98 
 
 		 369 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.799607  normal  0.310535 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0994  transposase IS4 family protein  53.98 
 
 		 369 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.416705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1228  transposase IS4 family protein  53.98 
 
 		 369 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000142924 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1271  transposase IS4 family protein  53.98 
 
 		 369 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00393062 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1300  transposase IS4 family protein  53.98 
 
 		 369 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.406544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1398  transposase IS4 family protein  53.98 
 
 		 369 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2329  transposase IS4 family protein  53.98 
 
 		 369 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0102713  hitchhiker  0.000965394 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2564  transposase IS4 family protein  53.98 
 
 		 369 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000012164  hitchhiker  0.000000684165 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2609  transposase IS4 family protein  53.98 
 
 		 369 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.720943  hitchhiker  0.00290124 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2785  transposase IS4 family protein  53.98 
 
 		 369 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.738177  normal  0.743727 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3014  transposase IS4 family protein  53.98 
 
 		 369 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.137978 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3220  transposase IS4 family protein  53.98 
 
 		 369 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3614  transposase IS4 family protein  52.63 
 
 		 366 aa  128  3e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0594  transposase IS4 family protein  52.63 
 
 		 366 aa  128  3e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4156  transposase IS4 family protein  52.63 
 
 		 366 aa  128  3e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0550  transposase IS4 family protein  52.63 
 
 		 366 aa  128  3e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0621  transposase IS4 family protein  52.63 
 
 		 366 aa  128  3e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.232742 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1595  transposase IS4 family protein  52.63 
 
 		 366 aa  128  3e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.137693 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1656  transposase IS4 family protein  52.63 
 
 		 366 aa  128  3e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.882664  normal  0.0664777 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4179  transposase IS4 family protein  52.63 
 
 		 366 aa  128  3e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0292  transposase IS4 family protein  52.63 
 
 		 366 aa  128  3e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0626  transposase IS4 family protein  52.63 
 
 		 366 aa  128  3e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1183  transposase IS4 family protein  52.63 
 
 		 366 aa  128  3e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01923  transposase  51.35 
 
 		 367 aa  125  2.0000000000000002e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0246  transposase, IS4 family protein  44.55 
 
 		 367 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00213  predicted transposase  42.2 
 
 		 378 aa  97.8  5e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00217  hypothetical protein  42.2 
 
 		 378 aa  97.8  5e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0796  ISEc4, transposase  41.28 
 
 		 378 aa  97.1  7e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.699242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2949  transposase IS4 family protein  41.28 
 
 		 253 aa  97.1  8e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.146429  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03334  predicted transposase  41.28 
 
 		 378 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0230  transposase IS4 family protein  41.28 
 
 		 378 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0767  transposase, IS4 family protein  40.18 
 
 		 374 aa  96.7  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.179756 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0786  transposase, IS4 family protein  40.18 
 
 		 374 aa  96.3  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0609195  hitchhiker  0.00199568 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0793  transposase, IS4 family protein  41.07 
 
 		 374 aa  96.7  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.980671  hitchhiker  0.00200934 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0805  transposase, IS4 family protein  40.18 
 
 		 374 aa  96.3  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0028853 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2203  transposase IS4 family protein  41.28 
 
 		 378 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000366545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2950  transposase IS4 family protein  41.28 
 
 		 378 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.179437  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03286  hypothetical protein  41.28 
 
 		 378 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2042  transposase, IS4 family protein  40.18 
 
 		 230 aa  95.5  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00132937  normal  0.19233 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1544  ISEc1, transposase  41.28 
 
 		 263 aa  95.1  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.59802  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0583  ISEc3, transposase  41.28 
 
 		 378 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2196  transposase IS4 family protein  40.37 
 
 		 263 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.398204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0257  ISEc3, transposase  41.28 
 
 		 378 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.893846 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2187  transposase IS4 family protein  41.28 
 
 		 378 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00361348  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00666  hypothetical protein  40.37 
 
 		 253 aa  94  6e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00655  hypothetical protein  40.37 
 
 		 253 aa  94  6e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01418  hypothetical protein  39.45 
 
 		 263 aa  93.6  7e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0643  ISEc4, transposase  40.37 
 
 		 378 aa  93.6  7e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.688283  normal  0.852316 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01430  hypothetical protein  39.45 
 
 		 258 aa  93.6  7e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2930  transposase IS4 family protein  40.37 
 
 		 253 aa  93.6  8e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0753  ISEc4, transposase  40.37 
 
 		 253 aa  93.6  8e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0135748  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3082  transposase IS4 family protein  40.37 
 
 		 378 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0262  putative transposase, IS4 family  36.61 
 
 		 390 aa  90.9  6e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.400165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0594  hypothetical protein  48.15 
 
 		 115 aa  88.2  4e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.761756 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01416  hypothetical protein  35.71 
 
 		 248 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01428  hypothetical protein  35.71 
 
 		 248 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3396  transposase IS4 family protein  38.18 
 
 		 377 aa  85.5  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0513234  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3399  transposase IS4 family protein  38.18 
 
 		 377 aa  85.5  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0182881  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5670  transposase ISAs1 family protein  35.04 
 
 		 393 aa  79  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5084  transposase IS4 family protein  36.36 
 
 		 388 aa  74.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0282093 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3914  transposase IS4 family protein  36.36 
 
 		 388 aa  74.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.435359 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0083  transposase IS4 family protein  36.36 
 
 		 388 aa  74.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.0627718 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3776  transposase IS4 family protein  36.36 
 
 		 388 aa  74.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.146379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0336  transposase IS4 family protein  36.36 
 
 		 388 aa  74.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.401127  normal  0.821515 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2179  transposase IS4 family protein  36.36 
 
 		 388 aa  74.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1781  transposase IS4 family protein  36.36 
 
 		 388 aa  74.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.638522  normal  0.800258 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01670  hypothetical protein  38.89 
 
 		 373 aa  72.4  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3009  transposase  34.58 
 
 		 370 aa  69.7  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0751  ISEc2, transposase  43.84 
 
 		 84 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.000185341  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0730  ISEc2, transposase  43.84 
 
 		 84 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2129  transposase, putative  29.91 
 
 		 373 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0477  transposase, IS4  30.84 
 
 		 374 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1127  transposase, IS4  30.84 
 
 		 290 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1172  transposase, IS4  30.84 
 
 		 374 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>