246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_2196 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010468  EcolC_2196  transposase IS4 family protein  100 
 
 
263 aa  543  1e-154  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.398204  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1544  ISEc1, transposase  98.1 
 
 
263 aa  534  1e-151  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.59802  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01418  hypothetical protein  95.82 
 
 
263 aa  524  1e-148  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00213  predicted transposase  96.12 
 
 
378 aa  523  1e-147  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2203  transposase IS4 family protein  97.29 
 
 
378 aa  523  1e-147  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000366545  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2950  transposase IS4 family protein  96.9 
 
 
378 aa  521  1e-147  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.179437  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00217  hypothetical protein  96.12 
 
 
378 aa  523  1e-147  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03334  predicted transposase  96.51 
 
 
378 aa  519  1e-146  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0230  transposase IS4 family protein  96.51 
 
 
378 aa  519  1e-146  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03286  hypothetical protein  96.51 
 
 
378 aa  519  1e-146  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0583  ISEc3, transposase  96.51 
 
 
378 aa  520  1e-146  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2187  transposase IS4 family protein  96.12 
 
 
378 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00361348  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0257  ISEc3, transposase  95.74 
 
 
378 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.893846 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0796  ISEc4, transposase  95.74 
 
 
378 aa  514  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.699242  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0643  ISEc4, transposase  95.74 
 
 
378 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.688283  normal  0.852316 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01430  hypothetical protein  95.74 
 
 
258 aa  513  1e-144  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2949  transposase IS4 family protein  96.44 
 
 
253 aa  505  9.999999999999999e-143  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.146429  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3082  transposase IS4 family protein  94.96 
 
 
378 aa  506  9.999999999999999e-143  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2930  transposase IS4 family protein  92.89 
 
 
253 aa  480  1e-135  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0753  ISEc4, transposase  92.89 
 
 
253 aa  480  1e-135  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0135748  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00666  hypothetical protein  91.3 
 
 
253 aa  474  1e-133  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00655  hypothetical protein  91.3 
 
 
253 aa  474  1e-133  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3399  transposase IS4 family protein  74.32 
 
 
377 aa  407  1e-113  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0182881  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3396  transposase IS4 family protein  73.93 
 
 
377 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0513234  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0262  putative transposase, IS4 family  60.47 
 
 
390 aa  314  9.999999999999999e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.400165  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01416  hypothetical protein  58.06 
 
 
248 aa  305  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01428  hypothetical protein  58.06 
 
 
248 aa  305  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0793  transposase, IS4 family protein  51.38 
 
 
374 aa  270  2.9999999999999997e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.980671  hitchhiker  0.00200934 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0767  transposase, IS4 family protein  51.38 
 
 
374 aa  267  1e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.179756 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0786  transposase, IS4 family protein  51.38 
 
 
374 aa  267  1e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0609195  hitchhiker  0.00199568 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0805  transposase, IS4 family protein  51.38 
 
 
374 aa  267  1e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0028853 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01670  hypothetical protein  49.61 
 
 
373 aa  248  7e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2042  transposase, IS4 family protein  50.89 
 
 
230 aa  238  8e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00132937  normal  0.19233 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3009  transposase  46.72 
 
 
370 aa  236  3e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2129  transposase, putative  44.87 
 
 
373 aa  233  3e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1127  transposase, IS4  46.12 
 
 
290 aa  226  2e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0477  transposase, IS4  46.12 
 
 
374 aa  226  3e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1172  transposase, IS4  46.12 
 
 
374 aa  226  3e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0598  transposase, IS4  46.12 
 
 
374 aa  224  9e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2439  transposase, IS4  45.74 
 
 
374 aa  221  8e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5670  transposase ISAs1 family protein  40.71 
 
 
393 aa  196  3e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3482  transposase, IS4 family protein  44.4 
 
 
327 aa  186  2e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.249116  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5660  transposase ISAs1 family protein  41.59 
 
 
333 aa  180  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.315532 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01923  transposase  38.4 
 
 
367 aa  180  2e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3614  transposase IS4 family protein  38.21 
 
 
366 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0626  transposase IS4 family protein  38.21 
 
 
366 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4179  transposase IS4 family protein  38.21 
 
 
366 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1595  transposase IS4 family protein  38.21 
 
 
366 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.137693 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1656  transposase IS4 family protein  38.21 
 
 
366 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.882664  normal  0.0664777 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0621  transposase IS4 family protein  38.21 
 
 
366 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.232742 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0550  transposase IS4 family protein  38.21 
 
 
366 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0292  transposase IS4 family protein  38.21 
 
 
366 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0594  transposase IS4 family protein  38.21 
 
 
366 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4156  transposase IS4 family protein  38.21 
 
 
366 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1183  transposase IS4 family protein  38.21 
 
 
366 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5401  transposase ISAs1 family protein  41.73 
 
 
377 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5649  transposase ISAs1 family protein  41.73 
 
 
377 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.345672 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5630  transposase ISAs1 family protein  41.73 
 
 
377 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000338804 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5802  transposase ISAs1 family protein  41.73 
 
 
377 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5832  transposase ISAs1 family protein  41.73 
 
 
377 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5528  transposase ISAs1 family protein  41.73 
 
 
377 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0898729 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3911  transposase ISAs1 family protein  41.73 
 
 
377 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3914  transposase IS4 family protein  38.46 
 
 
388 aa  168  8e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.435359 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0083  transposase IS4 family protein  38.46 
 
 
388 aa  168  8e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.0627718 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5084  transposase IS4 family protein  38.46 
 
 
388 aa  168  8e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0282093 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0336  transposase IS4 family protein  38.46 
 
 
388 aa  168  8e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.401127  normal  0.821515 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3776  transposase IS4 family protein  38.46 
 
 
388 aa  168  8e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.146379  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1781  transposase IS4 family protein  38.46 
 
 
388 aa  168  8e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.638522  normal  0.800258 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2179  transposase IS4 family protein  38.46 
 
 
388 aa  168  8e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0597  transposase IS4 family protein  34.71 
 
 
369 aa  162  6e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.818291 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0603  transposase IS4 family protein  34.71 
 
 
369 aa  162  6e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3866  transposase IS4 family protein  34.71 
 
 
369 aa  162  6e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000448202 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0296  transposase IS4 family protein  34.71 
 
 
369 aa  162  6e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0443  transposase IS4 family protein  34.71 
 
 
369 aa  162  6e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0569  transposase IS4 family protein  34.71 
 
 
369 aa  162  6e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.228181  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0572  transposase IS4 family protein  34.71 
 
 
369 aa  162  6e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3256  transposase IS4 family protein  34.71 
 
 
369 aa  162  7e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0156341 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3592  transposase IS4 family protein  34.71 
 
 
369 aa  162  7e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3606  transposase IS4 family protein  34.71 
 
 
369 aa  162  7e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3394  transposase IS4 family protein  34.71 
 
 
369 aa  162  7e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.750621  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0630  transposase IS4 family protein  34.71 
 
 
369 aa  162  7e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0643  transposase IS4 family protein  34.71 
 
 
369 aa  162  7e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3220  transposase IS4 family protein  34.71 
 
 
369 aa  162  7e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0595  transposase IS4 family protein  34.71 
 
 
369 aa  162  7e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1271  transposase IS4 family protein  34.71 
 
 
369 aa  162  7e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00393062 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0766  transposase IS4 family protein  34.71 
 
 
369 aa  162  7e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.799607  normal  0.310535 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0098  transposase IS4 family protein  34.71 
 
 
369 aa  162  7e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4396  transposase IS4 family protein  34.71 
 
 
369 aa  162  7e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000348998  normal  0.0139807 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0589  transposase IS4 family protein  34.71 
 
 
369 aa  162  7e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.900163 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0548  transposase IS4 family protein  34.71 
 
 
369 aa  162  7e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2785  transposase IS4 family protein  34.71 
 
 
369 aa  162  7e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.738177  normal  0.743727 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3014  transposase IS4 family protein  34.71 
 
 
369 aa  162  7e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.137978 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2564  transposase IS4 family protein  34.71 
 
 
369 aa  162  7e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000012164  hitchhiker  0.000000684165 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4087  transposase IS4 family protein  34.71 
 
 
369 aa  162  7e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0172  transposase IS4 family protein  34.71 
 
 
369 aa  162  7e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1398  transposase IS4 family protein  34.71 
 
 
369 aa  162  7e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1300  transposase IS4 family protein  34.71 
 
 
369 aa  162  7e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.406544  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0564  transposase IS4 family protein  34.71 
 
 
369 aa  162  7e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.561014  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0994  transposase IS4 family protein  34.71 
 
 
369 aa  162  7e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.416705  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1228  transposase IS4 family protein  34.71 
 
 
369 aa  162  7e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000142924 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>