17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1277 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1277  hypothetical protein  100 
 
 		 208 aa  412  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6939  hypothetical protein  36.61 
 
 		 237 aa  98.2  8e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.449982  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0876  hypothetical protein  47.01 
 
 		 183 aa  95.9  3e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2943  hypothetical protein  38.51 
 
 		 225 aa  94.4  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.204685 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1225  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  37.1 
 
 		 234 aa  92.8  4e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0632  hypothetical protein  35.66 
 
 		 261 aa  90.9  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0291564  normal  0.419184 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0757  hypothetical protein  38.04 
 
 		 180 aa  89.7  3e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.688725  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2291  hypothetical protein  39.71 
 
 		 228 aa  84.3  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1593  hypothetical protein  31.46 
 
 		 219 aa  70.9  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.452842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4740  hypothetical protein  36.3 
 
 		 207 aa  71.2  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0203866  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00330  hypothetical protein  35.88 
 
 		 182 aa  64.3  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1162  hypothetical protein  39.2 
 
 		 217 aa  62.8  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00352286 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13770  hypothetical protein  34.03 
 
 		 233 aa  57.4  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.334901 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5697  hypothetical protein  33.33 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.133622  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1066  hypothetical protein  31.45 
 
 		 161 aa  50.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.316842  normal  0.867737 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5640  hypothetical protein  40.74 
 
 		 177 aa  50.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.771523 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3256  hypothetical protein  32.65 
 
 		 231 aa  47.4  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>