17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4740 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_4740  hypothetical protein  100 
 
 
207 aa  404  1.0000000000000001e-112  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0203866  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1593  hypothetical protein  48.39 
 
 
219 aa  145  4.0000000000000006e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.452842  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2291  hypothetical protein  53.55 
 
 
228 aa  143  2e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1162  hypothetical protein  37.38 
 
 
217 aa  95.9  3e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00352286 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0876  hypothetical protein  39.1 
 
 
183 aa  86.7  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13770  hypothetical protein  40.8 
 
 
233 aa  78.6  0.00000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.334901 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0757  hypothetical protein  36.36 
 
 
180 aa  78.6  0.00000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.688725  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1277  hypothetical protein  33.16 
 
 
208 aa  71.6  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3256  hypothetical protein  37.31 
 
 
231 aa  70.9  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1225  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  35.54 
 
 
234 aa  64.7  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5697  hypothetical protein  33.86 
 
 
188 aa  61.6  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.133622  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6939  hypothetical protein  29.57 
 
 
237 aa  58.5  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.449982  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0632  hypothetical protein  29.36 
 
 
261 aa  54.7  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0291564  normal  0.419184 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00330  hypothetical protein  29.77 
 
 
182 aa  53.9  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2943  hypothetical protein  33.33 
 
 
225 aa  51.6  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.204685 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6553  hypothetical protein  31.5 
 
 
174 aa  50.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.778311  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1059  hypothetical protein  28.43 
 
 
199 aa  47.8  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.529871  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>