16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1593 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_1593  hypothetical protein  100 
 
 
219 aa  419  1e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.452842  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4740  hypothetical protein  50.34 
 
 
207 aa  141  9e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0203866  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2291  hypothetical protein  49.25 
 
 
228 aa  130  1.0000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13770  hypothetical protein  39.39 
 
 
233 aa  104  9e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.334901 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1162  hypothetical protein  42.52 
 
 
217 aa  85.9  4e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00352286 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0876  hypothetical protein  36.72 
 
 
183 aa  76.3  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3256  hypothetical protein  37.78 
 
 
231 aa  73.9  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0757  hypothetical protein  31.95 
 
 
180 aa  71.2  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.688725  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1277  hypothetical protein  34.43 
 
 
208 aa  70.1  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00330  hypothetical protein  33.1 
 
 
182 aa  61.6  0.000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2943  hypothetical protein  34.21 
 
 
225 aa  61.2  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.204685 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1225  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  33.06 
 
 
234 aa  60.5  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5697  hypothetical protein  37.1 
 
 
188 aa  58.9  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.133622  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6939  hypothetical protein  29.05 
 
 
237 aa  54.3  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.449982  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0632  hypothetical protein  28.14 
 
 
261 aa  49.7  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0291564  normal  0.419184 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6553  hypothetical protein  27.91 
 
 
174 aa  42.4  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.778311  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>