14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2943 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_2943  hypothetical protein  100 
 
 
225 aa  442  1e-123  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.204685 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6939  hypothetical protein  71.58 
 
 
237 aa  259  3e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.449982  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0632  hypothetical protein  44.07 
 
 
261 aa  167  1e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0291564  normal  0.419184 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1277  hypothetical protein  38.78 
 
 
208 aa  91.3  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1225  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  39.23 
 
 
234 aa  90.5  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0757  hypothetical protein  42.5 
 
 
180 aa  83.6  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.688725  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00330  hypothetical protein  42.5 
 
 
182 aa  72  0.000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1593  hypothetical protein  34.21 
 
 
219 aa  68.2  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.452842  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2291  hypothetical protein  32.58 
 
 
228 aa  64.3  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0876  hypothetical protein  38.52 
 
 
183 aa  63.9  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4740  hypothetical protein  33.33 
 
 
207 aa  52  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0203866  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5640  hypothetical protein  38.3 
 
 
177 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.771523 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5697  hypothetical protein  33.61 
 
 
188 aa  43.5  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.133622  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1162  hypothetical protein  32.46 
 
 
217 aa  41.6  0.009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00352286 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>