15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5697 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5697  hypothetical protein  100 
 
 		 188 aa  376  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.133622  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0757  hypothetical protein  51.72 
 
 		 180 aa  166  1e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.688725  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0876  hypothetical protein  54.37 
 
 		 183 aa  162  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00330  hypothetical protein  49.07 
 
 		 182 aa  140  9.999999999999999e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6553  hypothetical protein  42.02 
 
 		 174 aa  127  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.778311  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1225  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  43.18 
 
 		 234 aa  85.5  4e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2291  hypothetical protein  38.17 
 
 		 228 aa  62.8  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4740  hypothetical protein  33.86 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0203866  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1593  hypothetical protein  37.1 
 
 		 219 aa  58.9  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.452842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0632  hypothetical protein  33.33 
 
 		 261 aa  58.5  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0291564  normal  0.419184 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1277  hypothetical protein  33.81 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6939  hypothetical protein  31.5 
 
 		 237 aa  54.7  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.449982  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2943  hypothetical protein  33.61 
 
 		 225 aa  44.3  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.204685 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3416  hypothetical protein  71.88 
 
 		 64 aa  44.3  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0563111  normal  0.961393 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1162  hypothetical protein  30.28 
 
 		 217 aa  43.5  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00352286 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>