14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_00330 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_00330  hypothetical protein  100 
 
 
182 aa  360  4e-99  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0757  hypothetical protein  57.22 
 
 
180 aa  199  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.688725  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0876  hypothetical protein  54.95 
 
 
183 aa  191  7e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5697  hypothetical protein  44.67 
 
 
188 aa  140  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.133622  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6553  hypothetical protein  40.78 
 
 
174 aa  112  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.778311  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1225  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  40.94 
 
 
234 aa  84  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2943  hypothetical protein  42.5 
 
 
225 aa  72  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.204685 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6939  hypothetical protein  39.58 
 
 
237 aa  67  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.449982  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1277  hypothetical protein  35.88 
 
 
208 aa  65.1  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0632  hypothetical protein  33.09 
 
 
261 aa  62.4  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0291564  normal  0.419184 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1593  hypothetical protein  33.1 
 
 
219 aa  61.6  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.452842  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3416  hypothetical protein  84.85 
 
 
64 aa  59.7  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0563111  normal  0.961393 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4740  hypothetical protein  29.55 
 
 
207 aa  54.7  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0203866  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2291  hypothetical protein  33.83 
 
 
228 aa  53.9  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>