14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_13770 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_13770  hypothetical protein  100 
 
 		 233 aa  451  1.0000000000000001e-126  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.334901 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2291  hypothetical protein  50 
 
 		 228 aa  123  3e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1593  hypothetical protein  39.39 
 
 		 219 aa  114  8.999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.452842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4740  hypothetical protein  40.8 
 
 		 207 aa  89  5e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0203866  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1162  hypothetical protein  39.88 
 
 		 217 aa  74.7  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00352286 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1277  hypothetical protein  36.64 
 
 		 208 aa  68.2  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0876  hypothetical protein  35.29 
 
 		 183 aa  60.8  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1225  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  30.53 
 
 		 234 aa  55.5  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0757  hypothetical protein  30.43 
 
 		 180 aa  53.5  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.688725  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3256  hypothetical protein  32.85 
 
 		 231 aa  53.5  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0632  hypothetical protein  26.72 
 
 		 261 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0291564  normal  0.419184 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2943  hypothetical protein  32.52 
 
 		 225 aa  48.5  0.00009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.204685 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6939  hypothetical protein  31.9 
 
 		 237 aa  45.1  0.0009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.449982  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00330  hypothetical protein  32.64 
 
 		 182 aa  44.7  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>