14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0334 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0334  putative transmembrane anti-sigma factor  100 
 
 		 79 aa  161  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0219633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0781  putative transmembrane anti-sigma factor  56.94 
 
 		 80 aa  85.5  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3276  putative transmembrane anti-sigma factor  48.72 
 
 		 80 aa  72.4  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.953611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3621  putative transmembrane anti-sigma factor  42.67 
 
 		 89 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0680768 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1555  putative transmembrane anti-sigma factor  40.54 
 
 		 81 aa  62.8  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0444542 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2225  hypothetical protein  44.9 
 
 		 91 aa  55.1  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0889  putative transmembrane anti-sigma factor  35.71 
 
 		 329 aa  53.9  0.0000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0333  putative transmembrane anti-sigma factor  41.18 
 
 		 93 aa  48.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0444258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1326  hypothetical protein  39.66 
 
 		 465 aa  46.2  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000243968  hitchhiker  0.00621187 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0040  putative transmembrane anti-sigma factor  30.77 
 
 		 363 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.411333  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0227  putative transmembrane anti-sigma factor  35.82 
 
 		 277 aa  42.7  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0544  hypothetical protein  35.71 
 
 		 255 aa  40.8  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2792  hypothetical protein  27.03 
 
 		 87 aa  40.4  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0724276  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3810  hypothetical protein  34 
 
 		 81 aa  40.4  0.009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>