15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_2894 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_2894  phage integrase family protein  100 
 
 		 1009 aa  2078    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2312  phage integrase family protein  27.91 
 
 		 1013 aa  357  7.999999999999999e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2354  phage integrase family protein  27.7 
 
 		 1030 aa  350  6e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.322733  decreased coverage  0.0000760795 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0912  phage integrase  24.23 
 
 		 1150 aa  109  3e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.745248  normal  0.743177 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2849  hypothetical protein  28.38 
 
 		 589 aa  90.9  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1103  integrase family protein  22.81 
 
 		 1053 aa  69.3  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0496625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4111  integrase family protein  21.15 
 
 		 996 aa  67.4  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.161486  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49670  hypothetical protein  21.64 
 
 		 1041 aa  60.5  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2073  hypothetical protein  25.76 
 
 		 991 aa  47.8  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2093  hypothetical protein  25.76 
 
 		 991 aa  47.8  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2674  phage integrase family protein  31.82 
 
 		 305 aa  47.4  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.174931  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0381  tyrosine recombinase XerD  34.26 
 
 		 303 aa  47  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1144  phage integrase  25.81 
 
 		 422 aa  45.4  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.132159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5395  integrase family protein  26.56 
 
 		 402 aa  45.4  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3700  phage integrase family protein  30.66 
 
 		 305 aa  44.7  0.01  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>