18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_2312 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_2354  phage integrase family protein  89.62 
 
 		 1030 aa  1892    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.322733  decreased coverage  0.0000760795 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2312  phage integrase family protein  100 
 
 		 1013 aa  2106    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2894  phage integrase family protein  27.91 
 
 		 1009 aa  345  4e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0912  phage integrase  21.25 
 
 		 1150 aa  115  5e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.745248  normal  0.743177 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2849  hypothetical protein  24.72 
 
 		 589 aa  93.2  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4111  integrase family protein  22.81 
 
 		 996 aa  76.6  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.161486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1103  integrase family protein  23.81 
 
 		 1053 aa  61.2  0.00000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0496625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2093  hypothetical protein  22.71 
 
 		 991 aa  57  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2073  hypothetical protein  22.71 
 
 		 991 aa  57  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49670  hypothetical protein  26.03 
 
 		 1041 aa  52  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0638  lipoprotein  30.61 
 
 		 297 aa  48.9  0.0004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.713246  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0706  site-specific recombinase, phage integrase family protein  30.61 
 
 		 297 aa  48.9  0.0004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0344  phage integrase  23.41 
 
 		 293 aa  45.8  0.004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0123208  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3642  phage integrase family protein  27.96 
 
 		 305 aa  45.4  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000185721  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2082  site-specific recombinase, phage integrase family protein  29.93 
 
 		 260 aa  45.4  0.006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6954  integrase family protein  29.47 
 
 		 325 aa  45.1  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2077  putative phage integrase  29.93 
 
 		 302 aa  45.1  0.008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3671  phage integrase family protein  27.42 
 
 		 305 aa  44.7  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>