50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2099 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_2099  citrate carrier protein  100 
 
 		 447 aa  880    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.474742  normal  0.0186807 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3908  Citrate carrier protein  76.29 
 
 		 446 aa  651    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4099  Citrate carrier protein  78.12 
 
 		 483 aa  665    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.253806  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0048  Citrate carrier protein  77.08 
 
 		 447 aa  639    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.844506  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0043  Citrate carrier protein  77.13 
 
 		 447 aa  645    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1297  Citrate carrier protein  68.46 
 
 		 448 aa  552  1e-156  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.877313  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0616  citrate cation symporter family  54.65 
 
 		 448 aa  485  1e-136  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0547  citrate cation symporter family protein  54.88 
 
 		 448 aa  486  1e-136  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000864872  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0634  citrate cation symporter family  54.88 
 
 		 448 aa  486  1e-136  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0578  citrate cation symporter family protein  54.88 
 
 		 448 aa  486  1e-136  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0492  citrate carrier protein  54.88 
 
 		 448 aa  483  1e-135  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4723  citrate cation symporter family  54.65 
 
 		 448 aa  484  1e-135  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.470535  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0491  Na+/malate symporter  54.65 
 
 		 448 aa  483  1e-135  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0408466  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0489  Na+/malate symporter  54.65 
 
 		 448 aa  483  1e-135  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0498  citrate carrier protein  53.97 
 
 		 448 aa  479  1e-134  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0641  citrate cation symporter family protein  56.67 
 
 		 442 aa  480  1e-134  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1920  CCS family citrate carrier protein  47.75 
 
 		 445 aa  409  1e-113  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.296247  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6958  citrate carrier protein  50.45 
 
 		 440 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.586219 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5090  citrate carrier protein  39.06 
 
 		 443 aa  307  3e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.59557  decreased coverage  0.00122276 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5667  citrate carrier protein  38.01 
 
 		 454 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.662069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0792  Na+/citrate symporter protein  38.72 
 
 		 465 aa  297  3e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.69813  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4690  citrate carrier protein  38.62 
 
 		 456 aa  296  6e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.329832 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0308  citrate carrier protein  37.56 
 
 		 454 aa  293  3e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.87694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4998  citrate symporter citrate carrier protein  42.58 
 
 		 448 aa  293  4e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.406874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4928  citrate carrier protein  38.02 
 
 		 454 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.509755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3390  citrate carrier protein  39.38 
 
 		 454 aa  291  1e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.301093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3026  citrate carrier protein  38.02 
 
 		 469 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5340  citrate carrier protein  38.02 
 
 		 469 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.522817 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5219  citrate carrier protein  38.16 
 
 		 454 aa  291  2e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.374484 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3730  citrate carrier protein  36.6 
 
 		 451 aa  286  4e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2357  citrate carrier protein  61.54 
 
 		 301 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.192356 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3377  citrate carrier protein  36.06 
 
 		 454 aa  274  3e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.50279 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2023  Citrate carrier protein  36.32 
 
 		 452 aa  271  2e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1750  Citrate carrier protein  35.75 
 
 		 456 aa  265  1e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.0020544  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2324  Citrate carrier protein  35.93 
 
 		 455 aa  261  2e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.415822  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2222  Citrate carrier protein  34.39 
 
 		 455 aa  256  5e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.82686  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4129  citrate carrier protein  36.3 
 
 		 454 aa  251  2e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0701  citrate carrier protein  34.15 
 
 		 437 aa  225  1e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2700  CCS family citrate carrier protein  36.03 
 
 		 430 aa  206  1e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.545794  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2789  citrate carrier protein  35.12 
 
 		 427 aa  198  2.0000000000000003e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00204722  normal  0.85346 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1168  citrate/sodium symporter  29.11 
 
 		 446 aa  186  1.0000000000000001e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.226143  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0062  citrate-sodium symporter  27.42 
 
 		 446 aa  177  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.193495  normal  0.608225 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0063  citrate-sodium symporter  27.42 
 
 		 446 aa  177  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0061  citrate-sodium symporter  27.42 
 
 		 446 aa  177  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.215839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0062  citrate-sodium symporter  27.42 
 
 		 446 aa  177  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.557589 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0064  citrate-sodium symporter  27.42 
 
 		 446 aa  177  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1006  Na+/malate symporter  31.47 
 
 		 420 aa  176  5e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0322  citrate/sodium symporter  28.4 
 
 		 448 aa  150  5e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0978  malate transporter  29.1 
 
 		 385 aa  136  9e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.220084  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1118  citrate carrier protein  26.72 
 
 		 412 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>