50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C6958 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C6958  citrate carrier protein  100 
 
 		 440 aa  868    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.586219 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0498  citrate carrier protein  55.34 
 
 		 448 aa  492  9.999999999999999e-139  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0547  citrate cation symporter family protein  55.85 
 
 		 448 aa  492  9.999999999999999e-139  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000864872  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0616  citrate cation symporter family  55.85 
 
 		 448 aa  492  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0578  citrate cation symporter family protein  55.85 
 
 		 448 aa  492  9.999999999999999e-139  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0634  citrate cation symporter family  55.85 
 
 		 448 aa  491  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0641  citrate cation symporter family protein  55.61 
 
 		 442 aa  488  1e-137  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0489  Na+/malate symporter  55.61 
 
 		 448 aa  489  1e-137  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0491  Na+/malate symporter  55.61 
 
 		 448 aa  489  1e-137  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0408466  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4723  citrate cation symporter family  55.61 
 
 		 448 aa  489  1e-137  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.470535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0492  citrate carrier protein  55.37 
 
 		 448 aa  488  1e-136  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3908  Citrate carrier protein  51.84 
 
 		 446 aa  423  1e-117  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4099  Citrate carrier protein  51.94 
 
 		 483 aa  419  1e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.253806  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1920  CCS family citrate carrier protein  51.06 
 
 		 445 aa  418  1e-116  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.296247  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0048  Citrate carrier protein  52.88 
 
 		 447 aa  410  1e-113  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.844506  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0043  Citrate carrier protein  52.52 
 
 		 447 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2099  citrate carrier protein  50.45 
 
 		 447 aa  400  9.999999999999999e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.474742  normal  0.0186807 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1297  Citrate carrier protein  49.52 
 
 		 448 aa  354  2e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.877313  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4998  citrate symporter citrate carrier protein  44.27 
 
 		 448 aa  347  2e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.406874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5667  citrate carrier protein  42.82 
 
 		 454 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.662069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4690  citrate carrier protein  42.72 
 
 		 456 aa  335  1e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.329832 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5090  citrate carrier protein  42.26 
 
 		 443 aa  335  1e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.59557  decreased coverage  0.00122276 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5219  citrate carrier protein  42.49 
 
 		 454 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.374484 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4928  citrate carrier protein  41.65 
 
 		 454 aa  331  2e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.509755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3390  citrate carrier protein  42.49 
 
 		 454 aa  331  2e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.301093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3730  citrate carrier protein  40.33 
 
 		 451 aa  330  2e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0308  citrate carrier protein  41.18 
 
 		 454 aa  331  2e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.87694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3026  citrate carrier protein  41.65 
 
 		 469 aa  331  2e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5340  citrate carrier protein  41.65 
 
 		 469 aa  331  2e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.522817 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3377  citrate carrier protein  38.53 
 
 		 454 aa  319  5e-86  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.50279 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2023  Citrate carrier protein  39.29 
 
 		 452 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1750  Citrate carrier protein  39.38 
 
 		 456 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.0020544  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2324  Citrate carrier protein  40.38 
 
 		 455 aa  301  2e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.415822  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2222  Citrate carrier protein  39.81 
 
 		 455 aa  295  8e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.82686  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4129  citrate carrier protein  37.62 
 
 		 454 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0792  Na+/citrate symporter protein  33.49 
 
 		 465 aa  278  2e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.69813  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0701  citrate carrier protein  36.45 
 
 		 437 aa  239  6.999999999999999e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2789  citrate carrier protein  36.1 
 
 		 427 aa  217  4e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00204722  normal  0.85346 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0061  citrate-sodium symporter  32.12 
 
 		 446 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.215839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0062  citrate-sodium symporter  32.12 
 
 		 446 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.193495  normal  0.608225 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0064  citrate-sodium symporter  32.12 
 
 		 446 aa  214  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0063  citrate-sodium symporter  31.97 
 
 		 446 aa  214  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0062  citrate-sodium symporter  31.97 
 
 		 446 aa  213  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.557589 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2700  CCS family citrate carrier protein  35.55 
 
 		 430 aa  203  5e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.545794  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2357  citrate carrier protein  47.88 
 
 		 301 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.192356 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1168  citrate/sodium symporter  29.14 
 
 		 446 aa  185  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.226143  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1006  Na+/malate symporter  29.74 
 
 		 420 aa  185  2.0000000000000003e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0322  citrate/sodium symporter  30.85 
 
 		 448 aa  180  4e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0978  malate transporter  31.1 
 
 		 385 aa  138  2e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.220084  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1118  citrate carrier protein  28.16 
 
 		 412 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>