50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_0048 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_2099  citrate carrier protein  77.08 
 
 		 447 aa  637    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.474742  normal  0.0186807 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0048  Citrate carrier protein  100 
 
 		 447 aa  889    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.844506  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0043  Citrate carrier protein  97.32 
 
 		 447 aa  818    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3908  Citrate carrier protein  80.45 
 
 		 446 aa  682    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4099  Citrate carrier protein  81.39 
 
 		 483 aa  694    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.253806  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1297  Citrate carrier protein  65.77 
 
 		 448 aa  539  9.999999999999999e-153  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.877313  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0547  citrate cation symporter family protein  56.31 
 
 		 448 aa  505  9.999999999999999e-143  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000864872  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0634  citrate cation symporter family  56.31 
 
 		 448 aa  505  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0578  citrate cation symporter family protein  56.31 
 
 		 448 aa  505  9.999999999999999e-143  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0641  citrate cation symporter family protein  57.14 
 
 		 442 aa  503  1e-141  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0492  citrate carrier protein  56.53 
 
 		 448 aa  503  1e-141  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0616  citrate cation symporter family  56.08 
 
 		 448 aa  504  1e-141  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4723  citrate cation symporter family  56.08 
 
 		 448 aa  503  1e-141  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.470535  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0491  Na+/malate symporter  57.14 
 
 		 448 aa  503  1e-141  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0408466  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0489  Na+/malate symporter  57.14 
 
 		 448 aa  503  1e-141  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0498  citrate carrier protein  55.61 
 
 		 448 aa  495  1e-139  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1920  CCS family citrate carrier protein  51.03 
 
 		 445 aa  447  1.0000000000000001e-124  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.296247  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6958  citrate carrier protein  52.88 
 
 		 440 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.586219 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5090  citrate carrier protein  40 
 
 		 443 aa  318  1e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.59557  decreased coverage  0.00122276 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0792  Na+/citrate symporter protein  39.81 
 
 		 465 aa  302  9e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.69813  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4998  citrate symporter citrate carrier protein  42.58 
 
 		 448 aa  299  6e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.406874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3730  citrate carrier protein  35.79 
 
 		 451 aa  293  3e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5667  citrate carrier protein  37.77 
 
 		 454 aa  292  7e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.662069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4690  citrate carrier protein  36.63 
 
 		 456 aa  290  4e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.329832 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4928  citrate carrier protein  37.35 
 
 		 454 aa  286  7e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.509755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3026  citrate carrier protein  37.35 
 
 		 469 aa  285  9e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5340  citrate carrier protein  37.35 
 
 		 469 aa  285  9e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.522817 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5219  citrate carrier protein  37.12 
 
 		 454 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.374484 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2023  Citrate carrier protein  36.67 
 
 		 452 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3390  citrate carrier protein  38.07 
 
 		 454 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.301093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2357  citrate carrier protein  64.05 
 
 		 301 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.192356 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0308  citrate carrier protein  38.46 
 
 		 454 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.87694  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1750  Citrate carrier protein  34.8 
 
 		 456 aa  281  2e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.0020544  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3377  citrate carrier protein  37.26 
 
 		 454 aa  276  7e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.50279 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2324  Citrate carrier protein  36.64 
 
 		 455 aa  267  2e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.415822  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4129  citrate carrier protein  34.92 
 
 		 454 aa  263  4.999999999999999e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2222  Citrate carrier protein  35.8 
 
 		 455 aa  263  6e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.82686  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0701  citrate carrier protein  34.58 
 
 		 437 aa  223  4e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2789  citrate carrier protein  35.12 
 
 		 427 aa  205  1e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00204722  normal  0.85346 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2700  CCS family citrate carrier protein  35.36 
 
 		 430 aa  200  6e-50  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.545794  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1168  citrate/sodium symporter  31.4 
 
 		 446 aa  199  7.999999999999999e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.226143  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0062  citrate-sodium symporter  30.25 
 
 		 446 aa  198  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.557589 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0061  citrate-sodium symporter  30.02 
 
 		 446 aa  196  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.215839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0062  citrate-sodium symporter  30.02 
 
 		 446 aa  196  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.193495  normal  0.608225 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0064  citrate-sodium symporter  30.02 
 
 		 446 aa  196  8.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0063  citrate-sodium symporter  29.8 
 
 		 446 aa  195  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0322  citrate/sodium symporter  30.36 
 
 		 448 aa  168  2e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1006  Na+/malate symporter  30.77 
 
 		 420 aa  165  2.0000000000000002e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1118  citrate carrier protein  28.26 
 
 		 412 aa  140  6e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0978  malate transporter  28.38 
 
 		 385 aa  129  1.0000000000000001e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.220084  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>