50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4998 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_5667  citrate carrier protein  71.69 
 
 		 454 aa  635    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.662069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4998  citrate symporter citrate carrier protein  100 
 
 		 448 aa  892    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.406874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0308  citrate carrier protein  71.75 
 
 		 454 aa  632  1e-180  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.87694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4690  citrate carrier protein  71.56 
 
 		 456 aa  634  1e-180  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.329832 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5219  citrate carrier protein  72.58 
 
 		 454 aa  629  1e-179  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.374484 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4928  citrate carrier protein  72.16 
 
 		 454 aa  624  1e-177  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.509755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5340  citrate carrier protein  72.16 
 
 		 469 aa  623  1e-177  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.522817 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3026  citrate carrier protein  72.16 
 
 		 469 aa  623  1e-177  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3390  citrate carrier protein  71.78 
 
 		 454 aa  617  1e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.301093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5090  citrate carrier protein  67.29 
 
 		 443 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.59557  decreased coverage  0.00122276 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3730  citrate carrier protein  57.88 
 
 		 451 aa  484  1e-135  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3377  citrate carrier protein  56.24 
 
 		 454 aa  475  1e-133  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.50279 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1750  Citrate carrier protein  53.85 
 
 		 456 aa  473  1e-132  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.0020544  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2023  Citrate carrier protein  52.88 
 
 		 452 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2324  Citrate carrier protein  54.91 
 
 		 455 aa  452  1.0000000000000001e-126  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.415822  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2222  Citrate carrier protein  52.38 
 
 		 455 aa  451  1e-125  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.82686  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0792  Na+/citrate symporter protein  52.98 
 
 		 465 aa  439  9.999999999999999e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.69813  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4129  citrate carrier protein  54.67 
 
 		 454 aa  422  1e-117  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0634  citrate cation symporter family  39.14 
 
 		 448 aa  331  1e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0547  citrate cation symporter family protein  39.14 
 
 		 448 aa  332  1e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000864872  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0578  citrate cation symporter family protein  39.14 
 
 		 448 aa  332  1e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0616  citrate cation symporter family  38.9 
 
 		 448 aa  330  2e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0491  Na+/malate symporter  38.9 
 
 		 448 aa  329  8e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0408466  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0489  Na+/malate symporter  38.9 
 
 		 448 aa  328  8e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4723  citrate cation symporter family  38.9 
 
 		 448 aa  328  9e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.470535  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0641  citrate cation symporter family protein  38.9 
 
 		 442 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0492  citrate carrier protein  38.66 
 
 		 448 aa  327  3e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0498  citrate carrier protein  38.06 
 
 		 448 aa  325  1e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6958  citrate carrier protein  43.72 
 
 		 440 aa  320  3e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.586219 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1920  CCS family citrate carrier protein  39.67 
 
 		 445 aa  305  1.0000000000000001e-81  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.296247  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0048  Citrate carrier protein  42.4 
 
 		 447 aa  278  2e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.844506  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0043  Citrate carrier protein  42.78 
 
 		 447 aa  277  3e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2099  citrate carrier protein  39.81 
 
 		 447 aa  265  1e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.474742  normal  0.0186807 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4099  Citrate carrier protein  38.28 
 
 		 483 aa  263  4e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.253806  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3908  Citrate carrier protein  39.73 
 
 		 446 aa  261  2e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1297  Citrate carrier protein  39.79 
 
 		 448 aa  250  3e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.877313  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0701  citrate carrier protein  34.48 
 
 		 437 aa  212  1e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0063  citrate-sodium symporter  28.85 
 
 		 446 aa  180  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0062  citrate-sodium symporter  29 
 
 		 446 aa  179  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.557589 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0061  citrate-sodium symporter  29 
 
 		 446 aa  179  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.215839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0062  citrate-sodium symporter  29 
 
 		 446 aa  179  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.193495  normal  0.608225 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0064  citrate-sodium symporter  29 
 
 		 446 aa  179  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2700  CCS family citrate carrier protein  35.61 
 
 		 430 aa  172  2e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.545794  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1006  Na+/malate symporter  29.19 
 
 		 420 aa  166  6.9999999999999995e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1168  citrate/sodium symporter  30.53 
 
 		 446 aa  166  6.9999999999999995e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.226143  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2789  citrate carrier protein  30.94 
 
 		 427 aa  155  1e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00204722  normal  0.85346 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0322  citrate/sodium symporter  29.01 
 
 		 448 aa  139  7.999999999999999e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2357  citrate carrier protein  37.8 
 
 		 301 aa  138  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.192356 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1118  citrate carrier protein  29.67 
 
 		 412 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0978  malate transporter  27.59 
 
 		 385 aa  125  2e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.220084  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>