50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_3377 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_2023  Citrate carrier protein  87.3 
 
 
452 aa  777    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1750  Citrate carrier protein  85.78 
 
 
456 aa  790    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.0020544  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2324  Citrate carrier protein  81.88 
 
 
455 aa  744    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.415822  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2222  Citrate carrier protein  81.36 
 
 
455 aa  741    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.82686  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3730  citrate carrier protein  81.68 
 
 
451 aa  752    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3377  citrate carrier protein  100 
 
 
454 aa  907    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.50279 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5667  citrate carrier protein  55.04 
 
 
454 aa  496  1e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.662069  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0308  citrate carrier protein  56.31 
 
 
454 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.87694  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4928  citrate carrier protein  56.08 
 
 
454 aa  489  1e-137  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.509755  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5090  citrate carrier protein  58.53 
 
 
443 aa  490  1e-137  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.59557  decreased coverage  0.00122276 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3026  citrate carrier protein  56.08 
 
 
469 aa  489  1e-137  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5340  citrate carrier protein  56.08 
 
 
469 aa  489  1e-137  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.522817 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4690  citrate carrier protein  57.48 
 
 
456 aa  489  1e-137  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.329832 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3390  citrate carrier protein  57.48 
 
 
454 aa  484  1e-136  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.301093  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5219  citrate carrier protein  57.24 
 
 
454 aa  487  1e-136  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.374484 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4998  citrate symporter citrate carrier protein  56.9 
 
 
448 aa  456  1e-127  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.406874  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0792  Na+/citrate symporter protein  49.76 
 
 
465 aa  405  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.69813  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4129  citrate carrier protein  49.54 
 
 
454 aa  388  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4723  citrate cation symporter family  37.61 
 
 
448 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.470535  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0489  Na+/malate symporter  37.61 
 
 
448 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1920  CCS family citrate carrier protein  38.07 
 
 
445 aa  315  9.999999999999999e-85  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.296247  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0641  citrate cation symporter family protein  37.61 
 
 
442 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0491  Na+/malate symporter  37.61 
 
 
448 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0408466  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0492  citrate carrier protein  38.23 
 
 
448 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0578  citrate cation symporter family protein  37.39 
 
 
448 aa  312  5.999999999999999e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0547  citrate cation symporter family protein  37.39 
 
 
448 aa  312  5.999999999999999e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000864872  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0634  citrate cation symporter family  37.39 
 
 
448 aa  312  6.999999999999999e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0616  citrate cation symporter family  37.39 
 
 
448 aa  312  7.999999999999999e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0498  citrate carrier protein  36.87 
 
 
448 aa  309  6.999999999999999e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6958  citrate carrier protein  38.53 
 
 
440 aa  291  2e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.586219 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0043  Citrate carrier protein  37.71 
 
 
447 aa  247  2e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0048  Citrate carrier protein  37.26 
 
 
447 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.844506  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3908  Citrate carrier protein  35.56 
 
 
446 aa  242  1e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4099  Citrate carrier protein  35.24 
 
 
483 aa  241  2e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.253806  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2099  citrate carrier protein  36.06 
 
 
447 aa  240  2.9999999999999997e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.474742  normal  0.0186807 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1297  Citrate carrier protein  35.42 
 
 
448 aa  236  9e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.877313  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0701  citrate carrier protein  32.29 
 
 
437 aa  206  7e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0062  citrate-sodium symporter  29.34 
 
 
446 aa  180  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.193495  normal  0.608225 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0063  citrate-sodium symporter  29.34 
 
 
446 aa  180  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0061  citrate-sodium symporter  29.34 
 
 
446 aa  180  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.215839  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0062  citrate-sodium symporter  29.34 
 
 
446 aa  180  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.557589 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0064  citrate-sodium symporter  29.34 
 
 
446 aa  180  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1168  citrate/sodium symporter  29.04 
 
 
446 aa  170  5e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.226143  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2789  citrate carrier protein  31.31 
 
 
427 aa  164  3e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00204722  normal  0.85346 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0322  citrate/sodium symporter  29.53 
 
 
448 aa  158  2e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1006  Na+/malate symporter  31.16 
 
 
420 aa  156  6e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2700  CCS family citrate carrier protein  32.17 
 
 
430 aa  156  7e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.545794  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2357  citrate carrier protein  33.96 
 
 
301 aa  141  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.192356 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1118  citrate carrier protein  27.49 
 
 
412 aa  105  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0978  malate transporter  28 
 
 
385 aa  103  7e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.220084  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>